ЭЛИКСИР - ELIXIR - Wikipedia

Для использования в других целях см. Эликсир (значения).
ЭЛИКСИР
Место расположения
  • Бельгия
  • Чехия
  • Кипр (наблюдатель)
  • Дания
  • Эстония
  • Финляндия
  • Франция
  • Германия
  • Греция
  • Израиль
  • Ирландия
  • Италия
  • Люксембург
  • Нидерланды
  • Норвегия
  • Португалия
  • Словения
  • Испания
  • Швеция
  • Швейцария
  • объединенное Королевство
ОсновательНиклас Бломберг
Интернет сайтwww.elixir-europe.org

ЭЛИКСИР (Европейская инфраструктура наук о жизни для биологической информации) - это инициатива, которая позволит наука о жизни лаборатории по всей Европе для обмена и хранения данных своих исследований в рамках организованной сети. Его цель - объединить европейские исследовательские организации и дата-центры чтобы помочь координировать сбор, контроль качества и хранение больших объемов биологических данных, производимых наука о жизни эксперименты. ELIXIR стремится к тому, чтобы биологические данные интегрирован в федеративную систему, легко доступную для научного сообщества.[1]

Миссия

Миссия ELIXIR заключается в создании устойчивой европейской инфраструктуры биологической информации, поддержке исследований в области наук о жизни и их применения в медицине и окружающей среде, биоиндустрии и обществе.[2]

Результаты биологических экспериментов дают огромное количество результатов, которые сохраняются в виде данных с использованием компьютер программного обеспечения. Европейские страны вложили значительные средства в исследования, которые производят, анализируют и хранят биологическую информацию.[3] Однако сбор, хранение, архивирование и интеграция этих больших объемов данных представляет собой проблему, которую не может решить одна страна в одиночку. ELIXIR представляет собой объединение независимых бионаука средства для создания интегрированной сети, которая решает сложную проблему хранения биологических данных и управления ими. Предоставляя устойчивую и распределенную структуру для обработки данных и инструментов поиска данных, ELIXIR надеется обеспечить общеевропейские инвестиции в биоинформатика, обеспечивая стабильность для проведения исследований во всех областях науки о жизни, как в академических кругах, так и в промышленности.[1]

Организация и структура

ЭЛИКСИР - межправительственная организация, объединяющая существующие биоинформатика Ресурсы. Его координирует ELIXIR Hub, расположенный вместе с Европейской лабораторией молекулярной биологии. Европейский институт биоинформатики (EMBL -EBI) на Кампус Wellcome Trust Genome в Хинкстоне, Кембридж.

Членами консорциума ELIXIR являются европейские страны, представленные их правительствами и министерствами; научное сообщество в каждой стране-участнице разрабатывает свои национальный узел, который управляет службами и ресурсами, входящими в состав ELIXIR. Каждый узел ELIXIR представляет собой сеть национальных медико-биологических организаций, деятельность которых координируется ведущим институтом.

Европейская лаборатория молекулярной биологии является межправительственной организацией, поэтому это единственный узел, не связанный со страной.

ELIXIR концентрирует свои усилия на пяти основных областях деятельности, называемых Платформы. Они охватывают данные, инструменты, вычисления, взаимодействие и обучение. Работа в этих областях направлена ​​на улучшение доступа к ресурсам и инструментам открытых данных за счет улучшения возможности подключения, обнаружения и доступа к вычислительным мощностям, а также развития обучения пользователей и поставщиков услуг для достижения этих целей.

ELIXIR поддерживает пользователей, решающих грандиозные задачи в области биологических исследований в различных областях. ELIXIR поддерживает ряд сообществ, выбранных самостоятельно, которые посвящены темам высокого уровня, таким как «Данные человека» и «Науки о растениях», и более конкретным и сфокусированным дисциплинам, таким как «Метаболомика» и «Внутренне нарушенные белки», а также сообществу, посвященному ресурсу «Галактика». Эти сообщества созданы для разработки стандартов, услуг и обучения биоинформатики и данных, которые необходимы для содействия этому сообществу в достижении их научных целей.

Участников

По состоянию на август 2019 года следующие страны и EMBL-EBI подписали Соглашение о консорциуме ЭЛИКСИР (ECA) чтобы стать членом ELIXIR: Бельгия, Чехия, Дания, Эстония, Финляндия, Франция, Германия, Греция, Венгрия, Ирландия, Израиль, Италия, Люксембург, Нидерланды, Норвегия, Португалия, Словения, Испания, Швеция, Швейцария , и Соединенное Королевство.

Кипр является страной-наблюдателем, работающей над ратификацией ЕЦА в ближайшем будущем.

Страны, подписавшие ECA, получают представительства на Доска ЭЛИКСИР.

Подготовительный этап ЭЛИКСИРА координировал профессор Дам. Джанет Торнтон из EMBL-EBI.

Директор-основатель ELIXIR д-р Никлас Бломберг занял свою должность в новом центре ELIXIR в Кембридже в мае 2013 года.[4]

Страны на борту

Финансирование

К концу 2012 года «ЭЛИКСИР» завершил пятилетний подготовительный этап, финансируемый Европейским союзом. Седьмая рамочная программа [5] как часть Европейский стратегический форум по исследовательским инфраструктурам (ESFRI) процесс.

В 2015 году компания ELIXIR получила финансирование HORIZON 2020 в размере 19 миллионов евро на реализацию проекта EXCELERATE.[6][7] Этот проект позволил ELIXIR координировать и расширять национальные и международные ресурсы данных и продлился до 31 августа 2019 года.[8] ELIXIR также наладил сотрудничество, чтобы подать заявку на другое крупномасштабное финансирование для других проектов ЕС, в которых он также участвует в организационном потенциале, например, для проектов CORBEL, FAIRplus и EOSC-Life.

Каждое государство-член вносит совместный вклад в финансирование ELIXIR Hub пропорционально своему ВВП. Некоторые страны выделили новые средства для пополнения своего узла ELIXIR. Услуги и деятельность узлов ELIXIR будут по-прежнему финансироваться национальными агентствами. Коллективно члены ELIXIR будут подавать заявки на дополнительное внешнее финансирование.

Рекомендации

  1. ^ а б Crosswell, L.C .; Торнтон, Дж. М. (2012). «ЭЛИКСИР: Распределенная инфраструктура европейских биологических данных». Тенденции в биотехнологии. 30 (5): 241–242. Дои:10.1016 / j.tibtech.2012.02.002. PMID  22417641.
  2. ^ ЭЛИКСИР (11 декабря 2018 г.). Научная программа ЭЛИКСИР на 2019-2023 гг.. Хинкстон: ЭЛИКСИР. Дои:10.7490 / f1000research.1117352.1. Получено 30 сентября 2019.
  3. ^ «Бизнес-кейс ЭЛИКСИР» (PDF). Архивировано из оригинал (PDF) на 2013-04-23. Получено 2013-04-25.
  4. ^ Пресс-релиз ELIXIR о назначении Никласа Бломберга директором-основателем
  5. ^ Описание FP7 Советом по экономическим и социальным исследованиям
  6. ^ ЭЛИКСИР (11 мая 2015 г.). «ELIXIR ускоряется благодаря крупному финансированию Horizon 2020». ЭЛИКСИР. Получено 30 сентября 2019.
  7. ^ «ELIXIR-EXCELERATE: ускоренное внедрение ELIXIR и стимулирование раннего использования пользователями в науках о жизни». КОРДИС. Европейская комиссия. Получено 30 сентября 2019.
  8. ^ ЭЛИКСИР (2 сентября 2019 г.). «Успешное завершение разработки ELIXIR-EXCELERATE знаменует новый этап в развитии ELIXIR». ЭЛИКСИР. Получено 30 сентября 2019.

внешняя ссылка