TOG суперсемейство - TOG superfamily

В рецептор, связанный с белком-переносчиком опсина-G (TOG) надсемейство это белковое суперсемейство интегральной мембранные белки, обычно из 7 или 8 трансмембранных альфа-спиральный сегменты (ТМС). Он включает (1) микробные родопсины, переносящие ионы, и (2) рецепторы, связанные с G-белком (GPCR), (3) переносчики сладкого сахара, (4) захват никотинамид-рибонуклеозида. проникает (PnuC; TC № 4.B.1 ), (5) Пермеазы захвата 4-толуолсульфоната (TSUP); TC № 2.A.102 ), (6) Ni²⁺–Co²⁺ транспортеры (NiCoT); TC № 2.A.52 ), (7) переносчики органических растворенных веществ (OST); TC № 2.A.82 ), (8) фосфат: Na⁺ симпортеры (PNaS); TC № 2.A.58 ) и (9) лизосомальные переносчики цистина (LCT); TC № 2.A.43 ).^[1][2]

Семьи

В настоящее время признано семьи внутри надсемейства TOG (с TC цифры синего цвета) включают:^[3]

• 1.A.14 - Семейство передачи генов, усиленных семенниками (TEGT)
• 1.A.26 - Mg²⁺ Семейство Transporter-E (MgtE)
• 1.A.76 - Семейство транспортеров магния 1 (MagT1)
• 2.A.43 - Семейство лизосомальных переносчиков цистина (LCT)
• 2.A.52 - Затем я²⁺-Co²⁺ Семейство транспортеров (NiCoT)
• 2.A.58 - Фосфат: Na⁺ Семейство Symporter (PNaS)
• 2.A.82 - Семейство транспортеров органических веществ (OST)
• 2.A.102 - Семейство пермеаз захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)
• 2.A.123 - Сладость; PQ-петля; Слюна; Семья MtN3 (Sweet)
• 3.E.1 - Семейство переносящих ионы микробного родопсина (MR)
• 4.B.1 - Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозидов (NR) (PnuC)
• 9.A.14 - Семейство рецепторов, связанных с G-белком (GPCR)

Структуры

Вот пара трехмерных структур, доступных для членов следующих семейств:

• Милая семья: 4RNG​
• Семейство MR: 5AX0​, 3T45- конструкции высокого разрешения
• Семейство PnuC: 4QTN​
• Семейство GPCR: 3CAP​

Смотрите также

• Семейство носителей растворенных веществ
• База данных классификации транспортеров

Рекомендации

1. Максим А. Шлыков; Вэй Хао Чжэн; Джонатан С. Чен и Милтон Х. Сайер-младший (март 2012 г.). «Биоинформатическая характеристика семейства трансмембранных белков пермеазы захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1818 (3): 703–717. Дои:10.1016 / j.bbamem.2011.12.005. ЧВК  3917603. PMID  22192777.
2. Yee DC1, Шлыков М.А., Вестермарк А., Редди В.С., Арора С., Сан Е.И., Сайер М.Х. мл. (Сентябрь 2013 г.). «Суперсемейство рецепторов, связанных с транспортером-опсином-G (TOG)». Журнал FEBS. 280 (22): 5780–5800. Дои:10.1111 / фев.12499. ЧВК  3832197. PMID  23981446.
3. Сайер, Милтон. «Суперсемейство переносчиков-опсин-G-рецепторов, связанных с белками (TOG)». tcdb.org. Получено 28 декабря 2015.

дальнейшее чтение

• Yee DC1, Шлыков М.А., Вестермарк А., Редди В.С., Арора С., Сан Е.И., Сайер М.Х. мл. (Сентябрь 2013 г.). «Суперсемейство рецепторов, связанных с транспортером-опсином-G (TOG)». Журнал FEBS. 280 (22): 5780–5800. Дои:10.1111 / фев.12499. ЧВК  3832197. PMID  23981446.