Открытая рамка считывания в восходящем направлении - Upstream open reading frame

An открытая рамка считывания в восходящем направлении (uORF) является открытая рамка чтения (ORF) в пределах 5 'непереведенный регион (5'UTR) мРНК. uORFs могут регулировать эукариотический экспрессия гена.[1][2] Трансляция uORF обычно ингибирует последующую экспрессию первичной ORF. В бактерии, uORFs называются лидерные пептиды и первоначально были обнаружены на основе их влияния на регуляцию генов, участвующих в синтезе или транспорте аминокислоты.

Примерно 50% генов человека содержат uORF в 5'UTR, и, если они присутствуют, они вызывают снижение экспрессии белка.[3] Человек пептиды полученные из транслированных uORFs могут быть обнаружены из клеточного материала с масс-спектрометр.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вилела С., Маккарти Дж. Э. (август 2003 г.). «Регулирование экспрессии генов грибов с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК». Молекулярная микробиология. 49 (4): 859–67. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2003.03622.x. PMID  12890013.
  2. ^ Ловетт PS, Роджерс EJ (июнь 1996 г.). «Регулирование рибосом с помощью растущего пептида». Микробиологические обзоры. 60 (2): 366–85. Дои:10.1128 / MMBR.60.2.366-385.1996. ЧВК  239448. PMID  8801438.
  3. ^ Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (май 2009 г.). «Открытые рамки считывания, расположенные выше по течению, вызывают повсеместное снижение экспрессии белка и являются полиморфными среди людей» (PDF). Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. Труды Национальной академии наук. 106 (18): 7507–12. Bibcode:2009PNAS..106.7507C. Дои:10.1073 / pnas.0810916106. ЧВК  2669787. PMID  19372376.
  4. ^ Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (январь 2013 г.). «Пептидомическое открытие пептидов, кодируемых короткой открытой рамкой считывания, в клетках человека». Природа Химическая Биология. 9 (1): 59–64. Дои:10.1038 / nchembio.1120. ЧВК  3625679. PMID  23160002.