Система Arrowsmith - Arrowsmith System

Эрроусмит был Открытие на основе литературы система построена Дон Р. Суонсон используя концепцию Неизвестные общественные знания. Он назвал это «Эроусмит»: «Интеллектуальное приключение».[1]

«Представьте, что части головоломки разрабатываются и создаются независимо друг от друга, и что при извлечении и сборке они затем обнаруживают образец - непреднамеренный, непреднамеренный и никогда ранее не замеченный, но при этом образец, вызывающий интерес и побуждающий к интерпретации. , Я утверждаю, что независимо созданные части знания могут содержать невидимые, неизвестные и непреднамеренные закономерности. Таким образом, мир записанных знаний может давать поистине новые открытия ».

— Дон Р. Суонсон, Swanson DR: неизведанные общественные знания, Библиотека Quarterly 1986, 56: 103-118.[2]

Вступление

Инструмент имеет поиск режим, который помогает Пользователь в поиске предметов или концепций, которые могут присутствовать в двух разных наборах статей. Другой контекст для использования режима поиска - это когда пользователь хочет найти информацию, которая присутствует в одном поле и может иметь отношение к другому полю запроса. Пользователь будет проходить через два PubMed поиски биомедицинских статей из MEDLINE база данных: первый поиск определяет «литературу A», а второй - «литературу C.» В программа затем генерирует «B-список» слов и фраз, найденных в названиях обоих наборов литературы.

Отображается B-список в рейтинге по релевантности и может быть ограничено определенными семантический категории (например, анатомический регионы или расстройства, или же наркотики ). Для каждого интересующего термина B можно просмотреть заголовки, содержащие A и B («заголовки AB»), рядом с заголовками, содержащими B и C («заголовки BC»). Таким образом, можно легко оценить, есть ли биологически значительная общность или взаимосвязь между двумя наборами статей.[3]

История

Свонсон искал базы данных MEDLINE, когда обнаружил нить о Болезнь Рейно и диетический рыбий жир, что заставило его задуматься о том, полезен ли рыбий жир для лечения болезни Рейно. Этот гипотеза позже подтвердилось клинически. Затем Суонсон выдвинул гипотезу о связи между мигрень и магний дефицит, существование которого также было клинически доказано.

Заинтригованные этими открытиями, Свонсон и Нил Смалхайзер из Иллинойский университет в Чикаго разработал Arrowsmith, часть программного обеспечения для выявления связей между двумя статьями Medline. Назван в честь 1925 г. Роман Синклера Льюиса, он был направлен на создание систематического и вычислительного метода поиска возможных ссылок между статьями.[1]

Влияние

Модель Эроусмита оказалась влиятельной, и подход, разработанный Суонсоном и Смалхайзером, был адаптирован для изучения корреляции из гены с болезни и найти возможные новые применения для лекарства.[1]

связанные проекты

  • Авторство: укажите статьи в MEDLINE, написанные конкретным человеком.
  • Энн О'Тейт: обобщение, детализация и просмотр результатов запроса PubMed
  • WETLAB: Открытый исходный код электронный лабораторный ноутбук
  • АДАМ: еще одна база сокращений в MEDLINE[3]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c "Дон Р. Суонсон, пионер информатики, 1924–2012 | Новости Чикаго".
  2. ^ Smalheiser, Neil R; Торвик, Ветле I; Бишофф-Грет, Аманда; Бурханс, Лорен Б; Габриэль, Михаил; Хомаюни, Рамин; Кашеф, Алиреза; Мартоне, Мэриэнн Э; Перкинс, Гай А; Прайс, Диана Л. Говорите, Эндрю С; Уэст, Рут (1 января 2006 г.). «Совместная разработка двухузлового поискового интерфейса Arrowsmith для лабораторных исследователей». Журнал биомедицинских открытий и сотрудничества. 1 (1): 8. Дои:10.1186/1747-5333-1-8. ЧВК  1559644. PMID  16817965.
  3. ^ а б "ArrowSmith".