Бен Лэнгмид - Ben Langmead - Wikipedia
Бен Лэнгмид | |
---|---|
Родившийся | Бенджамин Томас Лэнгмид |
Альма-матер | |
Известен | Выравниватель последовательности Bowtie |
Награды | Премия Бенджамина Франклина (2016) |
Научная карьера | |
Поля | Вычислительная биология |
Учреждения | Университет Джона Хопкинса |
Тезис | Алгоритмы и подходы к высокопроизводительным вычислениям для сравнительной геномики на основе секвенирования (2012) |
Докторант | Стивен Зальцберг |
Интернет сайт | www |
Бен Лэнгмид это компьютерный биолог и доцент группы вычислительной биологии и медицины в Университет Джона Хопкинса.[1][2]
Образование
Лангмид получил Бакалавр искусств степень в области Информатика из Колумбийский колледж, Колумбийский университет в 2003 году. Он получил оба Магистр естественных наук и докторские степени в области компьютерных наук от Университет Мэриленда, под руководством Стивен Зальцберг, в 2009 и 2012 годах соответственно.[3]
Карьера
Лангмид известен разработкой Галстук-бабочка выравнивание последовательностей алгоритм,[4] который реализует Преобразование Барроуза – Уиллера чтобы улучшить масштабируемость выравнивания последовательностей. По состоянию на 2017 год[Обновить], оригинал Геномная биология статья, описывающая программный пакет Bowtie, цитировалась более 9000 раз.
Лэнгмид стал доцентом Университета Джонса Хопкинса в июле 2012 года.[3]
Награды
Лангмид был награжден Премия Бенджамина Франклина в 2016 году за продвижение бесплатных и открытых материалов для использования в науках о жизни.[5]
Рекомендации
- ^ «Бенджамин Лэнгмид - Департамент компьютерных наук». Департамент компьютерных наук. Получено 23 марта 2017.
- ^ Бен Лэнгмид публикации, проиндексированные Google ученый
- ^ а б "Langmead CV" (PDF). Получено 24 марта 2017.
- ^ Лэнгмид, Бен; Трапнелл, Коул; Поп, Михай; Зальцберг, Стивен Л. (2009). «Сверхбыстрое и эффективное с точки зрения памяти выравнивание коротких последовательностей ДНК с геномом человека». Геномная биология. 10 (3): R25. Дои:10.1186 / gb-2009-10-3-r25. ЧВК 2690996. PMID 19261174.
- ^ "Премия Бенджамина Франклина - Bioinformatics.org". www.bioinformatics.org. Получено 23 марта 2017.