База данных бета-лактамаз (BLAD) - Beta-Lactamase Database (BLAD)

Не путать с База данных бета-лактамаз (BLDB).
База данных бета-лактамаз (BLAD)
Содержание
ОписаниеБаза данных бета-лактамаз (BLAD) предоставляет трехмерную структурную информацию, в частности, о бета-лактамазах, и регулярно обновляется.
Типы данных
захвачен		Бета-лактамаза
ОрганизмыБактерии
Контакт
Исследовательский центрМусульманский университет Алигарх
Основное цитированиеPMID  23943635
Доступ
Интернет сайтBLAD
Разное
Закладки
сущности		да

В База данных бета-лактамаз (BLAD) - это веб- база данных по устойчивости к противомикробным препаратам который предоставляет структурные и фенотипические данные о классе ферментов, бета-лактамаза.[1] Он содержит последовательности из всех классов металло- и неметалло-бета-лактамаз. Ресурс содержит около 2000 последовательностей генов и собирает данные из различной литературы, NCBI, банка данных по белкам. [2] и другие носители. BLAD базируется на Мусульманский университет Алигарх в междисциплинарном отделении биотехнологии. На сайте BLAD есть четыре поля поиска: база данных, устойчивость, PDBS и геном.

При просмотре вкладки своей базы данных пользователи могут видеть информацию о последовательностях с перекрестными связями NCBI, в частности, глядя на нуклеотиды и белки. Эти данные также можно экспортировать для интересующей записи. На вкладке «Устойчивость» доступна информация о бета-лактамазах, которые придают устойчивость к противомикробным препаратам. PDBS или формат файла банка данных белков содержит трехмерную структурную информацию о бета-лактамазах, их вариантах и ​​связанных лигандах. Наконец, на вкладке «Геном» представлена ​​информация о плазмидах, содержащих ген бета-лактамазы, и их идентифицирующие характеристики.

Рекомендации

  1. ^ Данишуддин, М .; Hassan Baig, M .; Kaushal, L .; Хан, А. У. (2013). «BLAD: обширная база данных широко распространенных бета-лактамаз». Биоинформатика. 29 (19): 2515–2516. Дои:10.1093 / биоинформатика / btt417.
  2. ^ Sussman, Joel L .; Линь, Давэй; Цзян, Цзяньшэн; Мэннинг, Нэнси О .; Прилуски, Хайме; Риттер, Отто; Абола, Энрике Э. (1998). «Банк данных о белках (PDB): База данных трехмерной структурной информации о биологических макромолекулах». Acta Crystallographica Раздел D. 54 (6): 1078–1084. Дои:10.1107 / s0907444998009378.