Библиома - Bibliome

В библиома это совокупность биологического текста корпус. Этот термин был введен примерно в 2000 г. в EBI (Европейский институт биоинформатики ) для обозначения важности биологической текстовой информации. Подобные термины, которые использовались реже: литература и текстом.[нужна цитата ] По приблизительной аналогии с широко используемыми терминами, такими как геном, метаболом, протеом и транскриптом, этот -ome будет правильно относиться к литературе в определенной или контекстуально подразумеваемой области, следовательно: биологическая библиома, политическая библиома, так далее.[нужна цитата ] Однако этот термин (пока) не применялся за пределами биологических и медицинских наук, поэтому в настоящее время он по умолчанию применяется только к биомедицинским областям. Было бы бессмысленно применять его к конкретному корпусу текстов, например MEDLINE, несмотря на естественную аналогию, которая может показаться такой: термины геном, протеом, канал, метаболом, и транскриптом все обычно предполагают конкретный организм или набор клеток и (за исключением генома) определенный момент времени. Причина, по которой следующая аналогия не имеет большого смысла, состоит в том, что для этой цели уже существует установленный термин, корпус.

Из библиомы, биологи и компьютерные ученые датамин открывать новые генные мишени и наркотики. Библиомика - это биоинформатика изучение библиомы. Bibliome - это не псевдоум потому что это полезная концепция, которую используют биоинформатисты.

Онлайн-приложения

EAGLi это механизм биомедицинского поиска для MEDLINE. GOCat - автоматический классификатор / браузер GO для функциональной аннотации биомедицинских текстов; также полезно для функциональной характеристики списков названий белков и генов, созданных в ходе высокопроизводительных экспериментов.

внешняя ссылка

  • «Разработка библиомы» (аннотация)
  • Гривелл, Лес (15 марта 2002 г.). "Копание библиомы: поиск иголки в стоге сена?". EMBO отчеты. 3 (3): 200–203. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf059. ЧВК  1084023. PMID  11882534.