CBMAR - CBMAR - Wikipedia

CBMAR
Содержание
ОписаниеБаза данных бета-лактамаз, аннотирующая бета-лактамазы на основе их характеристик
Типы данных
захвачен		Бета-лактамаза
ОрганизмыБактерии
Контакт
Основное цитированиеPMID  25475113
Доступ
Интернет сайт14.139.227.92/ mkumar/ lactamasedb
Разное
Закладки
сущности		да

CBMAR иначе известный как Cвсесторонний β-лактамаза Mглазной Анотация рesource - это база данных сосредоточены на аннотации и открытии романа бета-лактамаза гены и белки в бактерии.[1] Бета-лактамазы охарактеризованы на CBMAR с использованием системы классификации Ambler.[2] CBMAR упорядочивает бета-лактамазы в соответствии с их классами: A, B, C и D. Затем они классифицируются по их (i) вариабельности последовательности, (ii) профилю устойчивости к антибиотикам, (iii) чувствительности к ингибитору, (iv) активному центру. , (v) семейные отпечатки пальцев, (vi) мутационный профиль, (vii) варианты, (viii) расположение гена, (ix) филогенетическое дерево и т. д. Основными источниками базы данных для CBMAR являются GenBank и Uniprot.[3] CBMAR построен на HTTP-сервер Apache 2.2.17 с MySQL Версия 14.14 и размещена на Ubuntu 11.04 Linux Платформа.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Шривастава, Абхишикха; Сингхал, Нилджа; Гоэль, Маниша; Вирди, Джугшаран Сингх; Кумар, Маниш (01.01.2014). «CBMAR: исчерпывающий ресурс по аннотации молекулярных β-лактамаз». База данных. 2014: bau111. Дои:10.1093 / база данных / bau111. ISSN  1758-0463. ЧВК  4255060. PMID  25475113.
  2. ^ Эмблер, Р. П. (1980-05-16). "Структура $ beta $ -лактамаз". Философские труды Королевского общества B: биологические науки. 289 (1036): 321–331. Дои:10.1098 / рстб.1980.0049. ISSN  0962-8436.
  3. ^ Консорциум UniProt (18 ноября 2011 г.). «Реорганизация белкового пространства в Universal Protein Resource (UniProt)». Исследования нуклеиновых кислот. 40 (D1): D71 – D75. Дои:10.1093 / нар / gkr981. ISSN  0305-1048. ЧВК  3245120. PMID  22102590.