Chematica - Chematica - Wikipedia
 | Эта статья содержит контент, который написан как Реклама. (Сентябрь 2014 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
| Разработчики) | Элизабет Уайли, Мэтью Уэмплер-Доти, Линг Су, Андреа Кадедду, Аарон Оппенгеймер, Патрик Фуллер, Малус Коссарян, Крис Готард, Ношин Готард, Камель Мегеллати, Миколай Ковалик, Кайл Бишоп, Бартош Гржибовски |
|---|---|
| изначальный выпуск | Нет данных |
| Написано в | Python, Ява, C ++, Coffeescript |
| Платформа | Кроссплатформенность |
| Доступно в | английский |
| Тип | Компьютерная алгебра, численные расчеты, Визуализация информации, статистика, создание пользовательского интерфейса |
| Лицензия | Проприетарный |
Chematica представляет собой программное обеспечение / базу данных, в которой используются алгоритмы и коллективная база данных 250-летней информации об органических химических веществах для прогнозирования и определения путей синтеза молекул. Разработка программного обеспечения, возглавляемая Бартошем А. Гжибовски, длилась десять лет, когда в августе 2012 года она была наконец обнародована.
В 2017 году программное обеспечение и база данных были полностью куплены Merck KGaA | MRK.[1][2] Программное обеспечение стало коммерчески доступным с момента приобретения Synthia.[3]
Функции
В программного обеспечения был разработан для объединения длинных путей синтеза в более короткие и более экономичные пути. Программное обеспечение может помочь химикам в поиске открытие лекарств и другие промышленно важные химические вещества. По оценкам, семь миллионов химикатов связаны количеством реакций и 86 000 химических правил.[4]Программное обеспечение дополняет другие попытки, такие как ручной поиск или полуавтоматические инструменты поиска, которые используют обратное отслеживание для оценки каждого возможного шага. Обратное отслеживание оказалось неэффективным, поскольку даже пятиэтапный синтез составляет 1019 возможные пути.[5]
Задать молекулу можно несколькими способами, включая поиск по Регистрационный номер Beilstein, Регистрационный номер CAS, химическое название, Улыбки структуры, или нарисовав саму диаграмму молекулы.[6] Поддерживает оптимизацию реакций по стоимости. Можно масштабировать размеры узлов по молекулярной массе, присутствию продукта и присутствию реагента. Программа также поддерживает 3D-моделирование отдельных молекул, а также маркировку функциональных групп.[6]
Программа также отмечает регулируемые и нерегулируемые соединения и использует специальные алгоритмы, которые их избегают. Он также дает классификацию и причины для регулирования.[6]
Реакции в одной емкости
Программное обеспечение может определять пути синтеза, которые могут происходить в реакции «в одном сосуде», когда все исходные химические вещества смешиваются одновременно для получения конечного продукта, тем самым устраняя любую очистку и необходимость в нескольких стадиях.[4]
Рекомендации
- ^ Merck KGaA купить Chematica Энди Экстэнс из ChemistryWorld; опубликовано 12 мая 2017 г .; получено 1 января, 2019
- ^ Ключник, Томаш; Микулак-Ключник, Варвара; Маккормак, Майкл П .; Лима, Хизер; Шимкуч, Сара; Бхоумик, Манишабрата; Мольга, Кароль; Чжоу, Юбай; Рикершаузер, Линдси; Gajewska, Ewa P .; Тутчкин, Алексей (март 2018). «Эффективный синтез разнообразных, имеющих медицинское значение целей, спланированных компьютером и выполняемых в лаборатории». Chem. 4 (3): 522–532. Дои:10.1016 / j.chempr.2018.02.002. ISSN 2451-9294.
- ^ Synthia
- ^ а б Феллман, Меган. "Северо-западные ученые создают химический мозг". Издательство Северо-Западного университета. Получено 25 августа 2012.
- ^ Grzybowski, Bartosz A .; Кайл Дж. М. Бишоп; Миколай Ковалик; Крис М. Готард; Аарон М. Дрюс; Ношин А. Готард; Алекс Вецкевич; Патрик Э. Фуллер (август 2012 г.). «Параллельная оптимизация синтетических путей в сети органической химии». Энгью. Chem. Int. Эд. 51 (32): 7928–7932. Дои:10.1002 / anie.201202209. PMID 22807100.
- ^ а б c Chematica демонстрация. Май 2012 г. Проверено 9 апреля 2013 г..