Цистром - Cistrome

В цистром относится к "набору цис-действующий цели трансакционный фактор в масштабе всего генома, также известный как in vivo геномное расположение [сайтов связывания факторов транскрипции] или гистон модификации ».^[1] Термин цистром - это чемодан из цистерна (из цистрон ) + ом (из геном ). Термин цистром был придуман исследователями из Институт рака Дана-Фарбер и Гарвардская медицинская школа.^[2]

Такие технологии как иммунопреципитация хроматина в сочетании с анализом микрочипов »Чип-на-чипе «или с массовым параллельным секвенированием ДНК»ChIP-Seq "значительно облегчили определение цистрома факторы транскрипции и другие хроматин ассоциированные белки.

Рекомендации

1. Лю Т., Ортис Дж.А., Тайнг Л., Мейер К.А., Ли Б., Чжан И, Шин Х, Вонг С.С., Ма Дж., Лей И, Папе У. Дж., Пойдингер М., Чен Й, Йунг К., Браун М., Турпаз И, Лю Х. (2011). «Цистром: интегративная платформа для исследований регуляции транскрипции». Геном Биол. 12 (8): R83. Дои:10.1186 / gb-2011-12-8-r83. ЧВК  3245621. PMID  21859476.
2. "cistrome / FrontPage". PBWiki, Inc.

дальнейшее чтение

• Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (март 2008 г.). «FoxA1 переводит эпигенетические сигнатуры в транскрипцию, специфичную для клонов, управляемую энхансером». Клетка. 132 (6): 958–70. Дои:10.1016 / j.cell.2008.01.018. ЧВК  2323438. PMID  18358809.
• Lupien M, Brown M (июнь 2009 г.). «Цистромики гормонозависимого рака». Endocr. Relat. Рак. 16 (2): 381–9. Дои:10.1677 / ERC-09-0038. PMID  19369485.