Дриада (хранилище) - Dryad (repository)

Дриада
DryadLogo2019.png
Разработчики)Национальный центр эволюционного синтеза, UNC-CH Центр исследования метаданных, Оксфордский университет, Британская библиотека, Калифорнийская цифровая библиотека
изначальный выпускЯнварь 2008 г.
Репозиторий Отредактируйте это в Викиданных
Написано вРубин
ЛицензияНовая лицензия BSD
Интернет сайтдатадриада.org

Дриада международный репозиторий с открытым доступом данных исследований, особенно данных, лежащих в основе научных и медицинских публикаций (в основном по эволюционной, генетической и экологической биологии). Dryad - это тщательно подобранный репозиторий общего назначения, который делает данные доступными для обнаружения, свободного повторного использования и цитирования. Научная, образовательная и благотворительная миссия Dryad заключается в обеспечении инфраструктуры и поощрении повторного использования данных научных исследований.

Видение Dryad - это научная коммуникационная система, в которой научные общества, издатели, научно-исследовательские и образовательные учреждения, финансирующие организации и другие заинтересованные стороны совместно поддерживают и продвигают сохранение и повторное использование данных исследований.

Dryad стремится позволить исследователям проверять опубликованные результаты, исследовать новые методологии анализа, перенаправлять данные для вопросов исследования, которые не были предвидены первоначальными авторами, и выполнять синтетические исследования, такие как формальный метаанализ. Для многих публикаций существующие репозитории данных не охватывают весь пакет данных. В результате многие важные наборы данных не сохраняются и больше не доступны или не могут использоваться в то время, когда их ищут более поздние исследователи.[1]

Dryad служит репозиторием для таблиц, электронных таблиц, плоских файлов и всех других видов опубликованных данных, для которых специализированные репозитории еще не существуют. В оптимальном случае авторы отправляют данные в Dryad вместе с публикацией статьи, чтобы ссылки на данные могли быть включены в публикуемую статью. Все файлы данных в Dryad связаны с опубликованной статьей и доступны для повторного использования в соответствии с условиями Creative Commons Zero отказ.

Dryad также является некоммерческой членской организацией, зарегистрированной в США, предоставляя форум для всех заинтересованных сторон, чтобы установить приоритеты для хранилища, участвовать в планировании, обмениваться знаниями и координировать действия в отношении политик данных.

Дриада указана в Реестр хранилищ данных исследований re3data.org.[2]

Функции

Цитата на пакет данных Dryad в Википедии
Эмбарго, выбранные авторами данных Dryad

Dryad позволяет авторам, журналам, обществам и издателям облегчить архивирование данных во время публикации, когда данные легко доступны. Данные в Dryad получают постоянный уникальный Идентификатор цифрового объекта (DOI), которые могут быть включены в опубликованную статью, чтобы читатели могли получить доступ к данным. Авторы могут архивировать данные в Dryad и быть уверены в их сохранности, одновременно выполняя мандаты журналов и исследовательских агентств по распространению результатов своих исследований.[3]

Авторы представляют данные в Dryad, когда соответствующая статья находится на рассмотрении или когда она была принята к публикации. Выбор зависит от того, включает ли журнал данные, попадающие в компетенцию рецензента. Авторы также могут отправлять данные после публикации статьи.

Подачу данных способствуют журналы, отправляющие в Дриаду уведомления о новых рукописях. Это избавляет авторов от необходимости повторно вводить библиографические данные при загрузке файлов данных.

Кураторы Dryad просматривают представленные файлы данных и осуществляют контроль качества описаний метаданных перед включением нового содержимого в репозиторий. Подход Dryad к метаданным подчеркивает простоту и функциональную совместимость, поддерживаемую Дублинское ядро метаданные профиль приложения. В Центр исследования метаданных сейчас на Колледж вычислительной техники и информатики Дрексельского университета, ранее служил центральным центром курирования Дриады, а основная деятельность теперь осуществляется через некоммерческую организацию в Северной Каролине. [4]

Dryad координирует отправку данных в специализированные репозитории, где (а) снижает нагрузку на пользователя за счет оптимизации рабочего процесса отправки и (b) позволяет Dryad и специализированным репозиториям обмениваться идентификаторами и другими метаданными, чтобы обеспечить перекрестные ссылки на различные связанные информационные продукты с данной публикацией. Первые два партнера по установлению связи - TreeBASE и GenBank, которые журналы-партнеры Dryad ранее определили как необходимые точки депонирования данных филогенетического дерева и последовательностей ДНК, соответственно.

Управление, история и финансирование

Дриадой управляет двенадцать человек. Совет директоров, избираемый его членами. Членами могут быть независимые журналы, общества, издатели, исследовательские и образовательные учреждения, библиотеки, спонсоры или другие организации, поддерживающие миссию Дриады. Организация координирует политику обмена данными и способствует долгосрочной устойчивости репозитория.

Dryad начала взимать плату за подачу материалов в сентябре 2013 года. Dryad - это некоммерческая организация, которая предоставляет долгосрочный бесплатный доступ к своему содержанию исследователям, преподавателям или студентам, независимо от национальности или институциональной принадлежности. Dryad может предоставить бесплатный доступ к данным благодаря финансовой поддержке со стороны участников и отправителей данных. Плата за подачу заявки Dryad предназначена для поддержания ее основных функций за счет возмещения основных затрат на обработку и сохранение данных.

Дриада вышла из Национальный центр эволюционного синтеза (NESCent) семинар на тему «Сохранение, обмен и обнаружение цифровых данных: проблемы для малых научных сообществ в цифровую эпоху» в мае 2007 г. Первоначальное финансирование Dryad было предоставлено Национальный фонд науки к Национальный центр эволюционного синтеза и другие партнеры в США.

DryadUK был Jisc проект, финансируемый из Британская библиотека и Оксфордский университет в партнерстве с NESCent Цифровой центр курирования, и Charles Beagrie Ltd. Проект привел к созданию британского зеркала репозитория дриад, базирующегося в Британской библиотеке. Проект также улучшил инструменты, доступные для публикации и цитирования данных, расширил дисциплинарный диапазон участвующих журналов и далее развил бизнес-структуру для международной организации, занимающейся долгосрочным сохранением данных.

В 2019 году Dryad объявила о партнерстве с другим хранилищем данных. Зенодо совместно разрабатывать новые решения, ориентированные на поддержку рабочих процессов исследователей и издателей, а также передовые практики в области программного обеспечения и курирование данных.[5]

Дриада является членом Сети наблюдения за данными Земли (DataONE ).

Программного обеспечения

Изначально Dryad была построена на основе открытого кода. DSpace программное обеспечение репозитория, разработанное Массачусетский Институт Технологий и Hewlett Packard. В 2019 году Dryad перешла на платформу публикации данных Ruby-on-Rails с открытым исходным кодом под названием Stash.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Видение, T.J. (2010) Открытые данные и общественный договор научных публикаций. BioScience 60 (5): 330-330. Дои:10.1525 / bio.2010.60.5.2
  2. ^ "Запись дриады на re3data.org". www.re3data.org. Получено 21 июля 2014.
  3. ^ Архивирование данных. Майкл К. Уитлок, Марк А. Макпик, Марк Д. Раушер, Лорен Ризеберг и Аллен Дж. Мур, Американский натуралист, Vol. 175, № 2 (февраль 2010 г.), стр. 145–146. Дои:10.1086/650340
  4. ^ Гринберг, Дж., Уайт, Х., К., Карриер, К. и Шерле, Р. (2009). Лучшая практика метаданных для репозитория научных данных. Журнал библиотечных метаданных, 9: 3, 194–212. Дои:10.1080/19386380903405090
  5. ^ Шельда, Мелиссанна (17.07.2019). «Финансируемое партнерство сближает Дриаду и Зенодо». Новости и обзоры дриад. Получено 2019-11-08.

внешняя ссылка