Малая ядрышковая РНК 1 вируса Эпштейна-Барра - Epstein–Barr virus small nucleolar RNA 1
| Малая ядрышковая РНК вируса герпеса 1 человека | |
|---|---|
 Консервация последовательности v-snoRNA1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | v-snoRNA1 |
| Рфам | RF01516 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | snoRNA |
| PDB структуры | PDBe |
V-snoRNA1 это коробка CD-snoRNA[требуется разъяснение ] идентифицировано в В-лимфоциты заражен Вирус Эпштейна-Барра (вирус герпеса человека 4 (HHV-4)).[1] Эта snoRNA является первым известным примером snoRNA, экспрессируемым из вирусного генома.[2] Он гомологичен эукариотический snoRNAs, потому что он содержит мотивы последовательностей C- и D-боксов[требуется разъяснение ] но нет терминала стебель-петля структура. В ядрышковый локализация v-snoRNA1 определялась гибридизация in situ. V-snoRNA1 может образовывать рибонуклеопротеин комплекс (сноРНП) как коиммунопреципитация (CoIP) анализы показали, что эта snoRNA взаимодействует с белками ядра snoRNA, фибрилларин, Nop56, Nop58.[требуется разъяснение ] Также было высказано предположение, что эта мяРНК может действовать как miRNA -подобный предшественник, который процессируется во фрагменты РНК размером 24 нуклеотида, которые нацелены на 3 'UTR[требуется разъяснение ] вирусных ДНК-полимераза мРНК.[1]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б Hutzinger R, Feederle R, Mrazek J, Schiefermeier N, Balwierz PJ, Zavolan M, Polacek N, Delecluse HJ, Hüttenhofer A (август 2009 г.). Каллен Б.Р. (ред.). «Экспрессия и обработка небольшой ядрышковой РНК из генома вируса Эпштейна-Барра». Патогены PLOS. 5 (8): e1000547. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000547. ЧВК 2718842. PMID 19680535.
- ^ Гарднер П.П., Бейтман А., Пул А.М. (2010). "SnoPatrol: сколько существует генов snoRNA?". Журнал биологии. 9 (1): 4. Дои:10.1186 / jbiol211. ЧВК 2871523. PMID 20122292.