FastContact - FastContact

FastContact алгоритм быстрой оценки контакта и привязки свободные энергии за структуры белково-белкового комплекса. Он основан на статистически определенном опустошение контактный потенциал и Кулон электростатика с зависящим от расстояния диэлектрическая постоянная. Приложение также сообщает об энергиях, свободных от остаточных контактов, которые быстро выделяют горячие точки взаимодействия.

Программа написана на Фортран 77 Карлос Дж. Камачо и Чао Чжан из Департамента вычислительной биологии, Питтсбургский университет, PA.[1] Веб-сервер для запуска FastContact в режиме онлайн или загрузки двоичного файла был создан П. Кристофом Чампом в июле 2005 года.[2][3]

Рекомендации

  1. ^ Камачо CJ, Чжан C (2005). «FastContact: быстрая оценка энергии контакта и свободной связи». Биоинформатика. 21 (10): 2534–2536. Дои:10.1093 / биоинформатика / bti322. PMID  15713734.
  2. ^ Камачо CJ, Ma H, Champ PC (2006). «Оценка разнообразного набора высококачественных пристыкованных конформаций: мета-счетчик, основанный на электростатическом и десольватационном взаимодействиях». Белки. 63 (4): 868–877. Дои:10.1002 / prot.20932. PMID  16506242.
  3. ^ Чемпион ПК, Камачо CJ (2007). «FastContact: инструмент для оценки свободной энергии для структур белково-белковых комплексов». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (Интернет-приложение): W556–60. Дои:10.1093 / нар / гкм326. ЧВК  1933237. PMID  17537824.

внешняя ссылка