Джеффри Чанг - Geoffrey Chang

Джеффри Чанг является профессором Калифорнийский университет в Сан-Диего с Школа фармацевтики Skaggs и фармацевтические науки и факультет фармакологии Медицинского факультета. Его лаборатория специализируется на структурная биология из интегральные мембранные белки, особенно исследуя Рентгеновская кристаллография методы решения третичные структуры мембранных белков, которые известны своей устойчивостью к кристаллизация. Лаборатория специализируется на структурах множественная лекарственная устойчивость белки-переносчики в бактерии. В 2001 году, будучи преподавателем Научно-исследовательский институт Скриппса, Чанг был награжден Премия Бекмана молодым исследователям,[1] разработан для поддержки исследователей на ранних этапах их академической карьеры за его работу по структурной биологии множественной лекарственной устойчивости.[2] Чанг объявил о переезде из Скриппса в соседний Калифорнийский университет в Сан-Диего в 2012 году.[3]

В 2007 году Чанг и соавторы убран пять ранее опубликованных статей, описывающих структуры трех белков-переносчиков нескольких лекарственных препаратов после того, как другая исследовательская группа опубликовала сильно отличающуюся структуру, что привело к открытию критического ошибка в пользовательских программных инструментах группы Chang.[4] Однако с того времени Чанг опубликовал и другие статьи в области структурной биологии,[5][6] и был награжден грантом EUREKA «за исключительно инновационные исследовательские проекты, которые могут оказать чрезвычайно значительное влияние на многие области науки» от Национальных институтов здравоохранения.[7]

Отозванные документы

Чанг и соавторы опубликовали статьи о структурах переносчиков множественной лекарственной устойчивости, известных как EmrE, и MsbA. Хотя первоначальные конструкции в этой области считались загадочными из-за неожиданного размещения их АТФ участок связывания в собранном димер,[8] публикация дополнительной структуры в том же семействе белков показала, что структуры Чанга вряд ли представляют биологически активную конформацию молекул.[9] Чанг и соавторы выпустили опровержения своих структурных документов на EmrE и MsbA, указав ошибку во внутренней программной утилите как источник неверной интерпретации данных, которая привела к появлению неправильно собранных димеров.[4][10] Применение популярного инструмента проверки структуры белка к одному из отозванных MsbA структур приводит к баллам, которые указывают на серьезные ошибки в этой структуре.[11]

Следующие бумаги были отозваны в 2007 году:[10][12]

  • Чанг, G; Рот, CB (2001). «Структура MsbA из E. coli: гомолог переносчиков кассет связывания АТФ с множественной лекарственной устойчивостью (ABC)». Наука. 293 (5536): 1793–800. Дои:10.1126 / science.293.5536.1793. PMID  11546864.
  • Порнильос, О; Чен, YJ; Chen, AP; Чанг, Г. (2005). «Рентгеновская структура мультилекарственного транспортера EmrE в комплексе с субстратом». Наука. 310 (5756): 1950–3. Дои:10.1126 / science.1119776. PMID  16373573.
  • Рейес, К.Л .; Чанг, Г. (2005). «Структура ABC транспортера MsbA в комплексе с АДФ.ванадатом и липополисахаридом». Наука. 308 (5724): 1028–31. Дои:10.1126 / science.1107733. PMID  15890884.
  • Чанг, Г. (2003). «Структура MsbA из Vibrio cholera: гомолог переносчика ABC с множественной лекарственной устойчивостью в закрытой конформации». Дж Мол Биол. 330 (2): 419–30. PMID  12823979.
  • Ma, C; Чанг, Г. (2004). «Структура эффлюксного переносчика множественной лекарственной устойчивости EmrE из Escherichia coli». Proc Natl Acad Sci USA. 101 (9): 2852–7. Дои:10.1073 / pnas.0400137101. ЧВК  365709. PMID  14970332.

На этот эпизод ссылались как в научных[13] и популярные СМИ[14] в качестве примера мотивации улучшения программная инженерия практики в вычислительная биология.

Недавняя работа

В 2009 году Чанг опубликовал статью в Наука,[5] описание белка, который удерживает определенные вещества, включая многие лекарства, вне клеток. Белок, называемый P-гликопротеином или сокращенно P-gp, является одной из основных причин устойчивости раковых клеток к химиотерапевтическим препаратам.[15] В 2010 году он провел исследование, опубликованное в Природа детализация структуры МАТЭ (Мульти антимикробный экструзионный белок ) семейный переносчик NorM, который принадлежит к единственному оставшемуся классу переносчиков множественной лекарственной устойчивости, который предстоит описать ученым.[6] Работа имеет значение для борьбы с опасными устойчивыми к антибиотикам штаммами бактерий, а также для создания устойчивых штаммов сельскохозяйственных культур.[16]

Рекомендации

  1. ^ "Джеффри Чанг". Фонд Арнольда и Мейбл Бекман. Получено 1 августа 2018.
  2. ^ Новости и обзоры Исследовательского института Скриппса. Вкратце 1 (9): 2 апреля 2001 г. Дата доступа 17 января 2001 г.
  3. ^ Роббинс, Гэри (9 октября 2012 г.). "Scripps Research теряет пятого талантливого ученого". Сан-Диего Юнион-Трибьюн. Получено 10 февраля 2015.
  4. ^ а б Миллер, G (2006). «Научные публикации. Кошмар ученого: проблема программного обеспечения приводит к пяти отзывам». Наука. 314 (5807): 1856–7. Дои:10.1126 / science.314.5807.1856. PMID  17185570.
  5. ^ а б Aller, S .; и другие. (2009). «Структура P-гликопротеина выявляет молекулярную основу полиспецифического связывания лекарств». Наука. 323 (5922): 1718–1722. Дои:10.1126 / science.1168750. ЧВК  2720052. PMID  19325113.
  6. ^ а б Он и др., «Структура катионно-связанного экструзионного транспортера для нескольких лекарственных препаратов и токсичных соединений», http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature09408.html
  7. ^ Исследовательский институт Скриппса Джеффри Чанг получил награду EUREKA http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20100920/etc.html
  8. ^ Хиггинс, CF; Линтон, KJ (2001). «Структурная биология. Xyz транспортеров ABC». Наука. 293 (5536): 1782–4. Дои:10.1126 / science.1065588. PMID  11546861.
  9. ^ Dawson, RJ; Лохер, КП (2006). «Структура бактериального мультилекарственного переносчика ABC». Природа. 443 (7108): 180–5. Дои:10.1038 / природа05155. PMID  16943773.
  10. ^ а б Чанг, G; Рот, CB; Рейес, К.Л .; Pornillos, O; Чен, YJ; Чен, AP (2006). «Отзыв». Наука. 314 (5807): 1875. Дои:10.1126 / science.314.5807.1875b. PMID  17185584.
  11. ^ Wiederstein, M; Сиппл, MJ (2007). «ProSA-web: интерактивный веб-сервис для распознавания ошибок в трехмерных структурах белков». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (Выпуск веб-сервера): W407–10. Дои:10.1093 / нар / гкм290. ЧВК  1933241. PMID  17517781.
  12. ^ Гаврылевский А. (2006). Опровержения нарушают структурную биографию: недавние результаты опровергают выводы пяти широко цитируемых статей Ученый 4 января 2007 г. Бесплатный полный текст Дата доступа 17 января 2007 г.
  13. ^ Перкель, Джеффри М. (29 июня 2011 г.). «Кодируйте свой выход из проблемы». Методы природы. 8 (7): 541–543. Дои:10.1038 / nmeth.1631. PMID  21716280.
  14. ^ Теннер, Эдвард (7 декабря 2012 г.). "Программное обеспечение с ошибками: Ахиллесова пята науки, основанной на больших данных?". Атлантический океан. Получено 10 февраля 2015.
  15. ^ Ученые обнаружили структуру белка, которая делает раковые клетки устойчивыми к химиотерапии http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20090330/chang.html
  16. ^ Научно-исследовательский институт Скриппса http://www.scripps.edu/news/press/20100922 В архиве 2010-09-28 на Wayback Machine

внешняя ссылка