Плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1 - Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1

Плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1
Классификация вирусов
Группа:
Группа I (дцДНК )
Семья:
Pleolipoviridae
Род:
Альфаплеолиповирус

Плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1 представляет собой двухцепочечный ДНК-вирус, поражающий галофильных архей. Haloarcula hispanica.[1] Он имеет ряд уникальных особенностей, в отличие от любого ранее описанного вируса.[2][3]

Вирусология

Вироны покрыты оболочкой, плеоморфной формы. Оболочка содержит множество липидов, в том числе кардиолипины, фосфатидилглицерины, метиловые эфиры фосфатидилглицерофосфата и фосфатидилглицеросульфаты. В оболочке два основных белка - VP3 (12 кг.Дальтон по весу) и VP4 (по весу 60 килодальтон).[1]

Вироны покидают хозяина без лизиса, что предполагает подающий надежды механизм.[1]

Геном

Геном представляет собой одиночную молекулу двунитевой ДНК, кольцевой, длиной 8082 пары оснований с G + C содержание 55,8%. Он имеет восемь открытых рамок считывания (ORF). VP3 и VP4 кодируются ORF3 и ORF4 соответственно.

ORF1, вероятно, является белком инициации репликации. ORF3 кодирует интегральный мембранный белок с сигнальной последовательностью из 50 аминокислот и двумя трансмембранными областями. Перед С-концевым трансмембранным доменом находится область спиральной спирали. ORF7 содержит домен NTPase, но его функция не ясна.

Таксономия

Исследование белков и организации генома этого вируса предполагает, что он связан с одноцепочечным ДНК вируса. Плеоморфный вирус Halorubrum 1, то плазмида pHK2 и область внутри археона Haloferax volcanii. Кажется вероятным, что плазмида pHK2 может быть вирусом, который может образовывать кольцевые плазмиды, и что область внутри Haloferax volcanii это профаг.

Сходство между этими двухцепочечными элементами ДНК и одноцепочечным вирусом Halorubrum pleomorphic virus 1 в настоящее время является уникальным. Если эта взаимосвязь может быть подтверждена для других вирусов, это говорит о том, что используемая в настоящее время балтиморская система классификации может нуждаться в пересмотре.

Рекомендации

  1. ^ а б c Roine E, Kukkaro P, Paulin L, Laurinavicius S, Domanska A, Somerharju P, Bamford DH (2010) Новые, близкородственные галоархейные вирусные элементы с различными типами нуклеиновых кислот. J Virol 84 (7): 3682–89.
  2. ^ Пиетиля МК, Атанасова Н.С., Маноле В., Лильероос Л., Бутчер С.Дж., Оксанен Х.М., Бамфорд Д.Х. (2012). «Архитектура вириона объединяет глобально распространенные плеолиповирусы, заражающие галофильные археи». Журнал вирусологии. 86 (9): 5067–79. Дои:10.1128 / JVI.06915-11. ЧВК  3347350. PMID  22357279.
  3. ^ Пиетила МК, Лауринавичюс С., Сунд Дж., Ройн Э., Бэмфорд Д.Х. (2010). «Геном одноцепочечной ДНК нового архейного вируса Halorubrum pleomorphic virus 1 заключен в оболочку, украшенную шипами гликопротеина». J Virol. 84 (2): 788–798. Дои:10.1128 / JVI.01347-09. ЧВК  2798366. PMID  19864380.