Жанин Участок - Janin Plot

Сюжет Джанина, созданный CING из цепи A, остаток аргинина номер 18 в легкой цепи динеина, (PDB Я БЫ 1г4о ). Синяя область показывает вероятные комбинации углов для спиральных остатков, а желтые области отображают области, которые являются общими для нитевидных участков. Некоторый зеленый фон можно увидеть для остатков, которые находятся в других типах областей.

В биохимии Джанин сюжет, как Рамачандран сюжет, это способ визуализировать двугранный угол распределения в белковых структурах. В то время как график Рамачандрана связывает два двугранных угла основной цепи, график Джанина связывает двугранный угол χ-1 первой боковой цепи с χ-2. Поскольку не все аминокислоты имеют эти двугранные углы, график Жанина применим не ко всем таким кислотам.

Эта корреляция различна для разных аминокислот и может зависеть от типа вторичной структуры (Helix, Sheet и т. Д.), Локальной для этого остатка. Сюжет назван в честь Жоэля Жанина, изучавшего эти корреляции в 1978 г. Шошана Водак.^[1]

Рекомендации

1. Janin, J .; Водак, С. (1978). «Конформация боковых цепей аминокислот в белках * 1». Журнал молекулярной биологии. 125 (3): 357–386. Дои:10.1016/0022-2836(78)90408-4. PMID  731698.