LocDB - LocDB
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | экспериментальные аннотации локализации |
| Организмы | Homo sapiens Arabidopsis thaliana |
| Связаться с нами | |
| Исследовательский центр | Колумбийский университет |
| Лаборатория | Кафедра биохимии и молекулярной биофизики |
| Авторы | Шрути Растоги |
| Основное цитирование | Растоги и др. (2011)[1] |
| Дата выхода | 2010 |
| Доступ | |
| Формат данных | База данных MySQL |
| Интернет сайт | http://www.rostlab.org/services/locDB |
| веб-сервис URL | http://www.rostlab.org/services/locDB/search.php |
| Разное | |
| Версия | Выпуск 1.0 |
LocDB[1] это база данных, созданная экспертами, которая собирает экспериментальные аннотации для субклеточной локализации белков в Homo sapiens (человек) и Arabidopsis thaliana (Сорняк). База данных также содержит прогнозы субклеточной локализации на основе множества современных методов прогнозирования для всех белков с экспериментальной информацией.
Белки являются основными функциональными компонентами клеток. Они несут ответственность за преобразование генетической информации в физическую реальность. Эти макромолекулы опосредуют генную регуляцию, ферментативный катализ, клеточный метаболизм, репликацию ДНК и транспорт питательных веществ, распознавание и передачу сигналов. Интерпретация этого богатства данных для выяснения функции белков в постгеномную эпоху является фундаментальной проблемой. На сегодняшний день даже для наиболее хорошо изученных организмов, таких как дрожжи, около четверти белков остается неохарактеризованной. Основным препятствием для экспериментального определения функции белков является то, что исследования требуют огромных ресурсов. Следовательно, разрыв между количеством последовательностей, депонированных в базах данных, и экспериментальной характеристикой соответствующих белков постоянно растет. Биоинформатика играет центральную роль в преодолении этого разрыва между последовательностью и функцией путем разработки инструментов для более быстрого и эффективного прогнозирования функции белков. Этот репозиторий эффективно заполняет пробел между экспериментальными аннотациями и прогнозами и предоставляет более крупный и надежный набор данных для тестирования новых методов прогнозирования.[1]
Смотрите также
использованная литература
- ^ а б c Растоги, Шрути; Рост Буркхард (январь 2011 г.). «LocDB: экспериментальные аннотации локализации для Homo sapiens и Arabidopsis thaliana». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 39 (Проблема с базой данных): D230-4. Дои:10.1093 / nar / gkq927. ЧВК 3013784. PMID 21071420.
 | Эта Биологическая база данных -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |