Матурас К - Maturase K

Матурас К
Идентификаторы
ОрганизмArabidopsis thaliana, растения
СимволматK
Альт. символыycf14
Entrez844797
RefSeq (мРНК)NP_051040.2
UniProtP56784
MatK / TrnK, N-терминал (неактивный RT)
Идентификаторы
СимволMatK_N
PfamPF01824
ИнтерПроIPR024942
Расположение matK ген в геном хлоропласта из Arabidopsis thaliana. matK является одним из генов, кодирующих белок, участвующих в других функциях, помимо фотосинтетических реакций (красные прямоугольники). matK карты в координатах 2-3,5 кб.

Матурас К (matK) это растение пластидный ген,[1] хотя у высших растений он переместился в ядерный геном.[2] Белок, который он кодирует, представляет собой матуразу интрона органелл, белок, который сращивания Интроны группы II. Это важно для in vivo сплайсинг интронов группы II.[3] Среди других созреваний этот белок сохраняет только хорошо сохраненные домен X и остатки обратная транскриптаза домен.[4]

Универсальный коврик K грунтовки может использоваться для Штрих-кодирование ДНК покрытосеменных.[5]

Смотрите также

  • LtrA, открытая рамка считывания найдена в Lactococcus lactis интроны группы II LtrB. Это кодируемый интроном белок с тремя субдоменами, один из которых является обратной транскриптазой / матуразой.

Рекомендации

  1. ^ Zoschke R, Nakamura M, Liere K, Sugiura M, Börner T, Schmitz-Linneweber C (февраль 2010 г.). «Органелларная матураза связывается с множественными интронами группы II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (7): 3245–50. Дои:10.1073 / pnas.0909400107. ЧВК  2840290. PMID  20133623.
  2. ^ Mohr G, Lambowitz AM (январь 2003 г.). «Предполагаемые белки, относящиеся к обратной транскриптазе / созреванию интронов группы II, кодируются ядерными генами у высших растений». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (2): 647–52. Дои:10.1093 / нар / гкг153. ЧВК  140517. PMID  12527773.
  3. ^ Алерт Д., Пипенбург К., Кудла Дж., Бок Р. (июль 2006 г.). «Эволюционное происхождение интрона митохондриальной группы II растений от предка, кодирующего обратную транскриптазу / матуразу». Журнал исследований растений. 119 (4): 363–71. Дои:10.1007 / s10265-006-0284-0. PMID  16763758.
  4. ^ Мор Г., Перлман П.С., Ламбовиц А.М. (ноябрь 1993 г.). «Эволюционные взаимоотношения между белками, кодируемыми интронами группы II, и идентификация консервативного домена, который может быть связан с функцией созревания». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (22): 4991–7. Дои:10.1093 / nar / 21.22.4991. ЧВК  310608. PMID  8255751.
  5. ^ Цзин Ю, Цзянь-Хуа Сюй, Ши-Лян Чж (май 2011 г.). «Новые универсальные праймеры matK для штрих-кодирования ДНК покрытосеменных». Журнал систематики и эволюции. 49 (3): 176–81. Дои:10.1111 / j.1759-6831.2011.00134.x.