Информационная система по биоразнообразию океана - Ocean Biodiversity Information System

Информационная система по биоразнообразию океана
Тип сайта
Интернет-система данных и информации
Доступно ванглийский
URLwww.obis.org
Коммерческийнет
Постановка на учетне требуется
ЗапущенМарт 2002 г.
Текущее состояниеактивный
Записи ОБИС для океанская солнечная рыба, Мола Мола, по состоянию на июль 2018 г., визуализировано картографом ОБИС (www.obis.org)

В Информационная система по биоразнообразию океана (ОБИС), ранее Биогеографическая информационная система океана, представляет собой интернет-точку доступа к информации о распределении и изобилии живых разновидность в океан. Он был разработан как компонент управления информацией десятилетнего Перепись морской жизни (CoML) (2001-2010), но не ограничивается данными, полученными из CoML, и направлен на обеспечение комплексного обзора всех данных о морском биоразнообразии, которые могут быть предоставлены ему в открытом доступе соответствующими хранителями данных. Согласно его веб-сайту по состоянию на июль 2018 года, ОБИС «является глобальным центром обмена данными и информацией с открытым доступом по морскому биоразнообразию для науки, сохранения и устойчивого развития». На сайте ОБИС перечислено 8 конкретных целей, главная из которых состоит в том, чтобы «предоставить [] самую большую в мире базу научных знаний о разнообразии, распространении и численности всех морских организмов в интегрированном и стандартизированном формате».[1]

История и текущий статус

Первоначальные идеи для ОБИС были разработаны на совещании CoML по бентической (донной) океанской жизни в октябре 1997 года. Рекомендации этого семинара привели к созданию веб-сайта (http://marine.rutgers.edu/OBIS ) в Рутгерсе в 1998 г., чтобы продемонстрировать первоначальную концепцию ОБИС.[2] 3–4 ноября 1999 г. в Вашингтоне, округ Колумбия, был проведен первый международный семинар ОБИС, который привел к определению объема проекта и привлечению потенциальных партнеров, а отдельные материалы были опубликованы в специальном выпуске журнала. Океанография журнал[3] в рамках которой основатель ОБИС Др. Дж. Ф. Грассл сформулировал видение ОБИС как «онлайнового всемирного атласа для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте».[4] В мае 2000 г. правительственные агентства США в рамках Национальной программы океанографического партнерства вместе с Фонд Альфреда П. Слоана профинансировал восемь исследовательских проектов для инициирования ОБИС. В мае 2001 г. Национальный фонд науки финансируется Университет Рутгерса разработать глобальный портал для ОБИС. Также в 2001 году был сформирован Международный комитет ОБИС, первое заседание которого состоялось в августе 2001 года.[5]

Производственная версия портала ОБИС была запущена в Университете Рутгерса в 2002 году в качестве веб-сайта. http://www.iobis.org, обслуживающая 430000 записей данных с привязкой к видам из 8 партнерских баз данных, включая записи рыб из FishBase, головоногие моллюски из CephBase, кораллы из Биогеоинформатика гексакоралов, моллюски из База данных индо-тихоокеанских моллюсков и больше.[6] К маю 2006 года портал ОБИС смог получить доступ к 9,5 миллионам записей о 59 000 видов из 112 баз данных, [7] и к декабрю 2010 г. (по завершении переписи морской флоры и фауны) предоставили доступ к 27,7 миллионам записей, представляющих 167 000 названий таксонов.[8] По состоянию на июль 2018 года на веб-сайте ОБИС указано, что система обеспечивает доступ к более чем 45 миллионам наблюдений почти за 120 000 морских видов (сокращение числа названий является результатом разрешения синонимов, т. Е. Сокращения таксонов, зарегистрированных под несколькими названиями, до одного принятое название), основанный на вкладе 500 организаций из 56 стран.[9]

В 2009 г. ОБИС был принят как проект Международной программой обмена океанографическими данными и информацией (IODE) Межправительственная океанографическая комиссия (МОК) ЮНЕСКО а в 2011 году, с прекращением финансирования секретариата и портала в Рутгерсе Фондом Слоуна, предложение о размещении Морской институт Фландрии (ВЛИЗ) в Остенде, Бельгия был принят в качестве долгосрочного хоста для системы, а также секретариат ОБИС переехал из Университета Рутгерса в Проектный офис МОК для МООД в Остенде, откуда в настоящее время ОБИС обслуживается и ведется дополнительная разработка без изменения веб-адреса. Таким образом, OBIS теперь находится в Остенде, в том же здании, где находится VLIZ. VLIZ поддерживает две таксономические базы данных: Всемирный регистр морских видов и IRMNG, то Временный реестр морских и неморских родов оба из них используются в таксономических решениях, используемых для управления отображением информации о видах в OBIS, а также обеспечивают таксономическую иерархию, с помощью которой можно перемещаться по содержимому OBIS. ОБИС в настоящее время находится под руководством МООД при поддержке руководящей группы, Руководящей группы МООД по ОБИС (SG-OBIS); Оперативная деятельность направляется Исполнительным комитетом ОБИС (ОБИС-ЕС) при поддержке 6 рабочих групп ОБИС. Секретариат ОБИС, расположенный в проектном офисе ЮНЕСКО / МОК для МООД в Остенде (Бельгия), включает менеджера проекта ОБИС и менеджера данных и, помимо обслуживания системы ОБИС, также предоставляет обучение и техническую помощь поставщикам данных, направляет новые данные стандартов и технических разработок, а также поощряет международное сотрудничество для повышения групповых преимуществ сети.[10]

Данные, доступные через OBIS, охватывают все группы организмов, которые имеют какое-либо отношение к морским или морским организмам. эстуарий среды обитания, включая береговые линии и атмосферу над океаном, например морскую позвоночные (рыбы, морские млекопитающие, черепахи, морские птицы и др.); морской беспозвоночные (включая зоопланктон ); морской бактерии; и морской растения (например, фитопланктон, водоросли, мангровые заросли).

ОБИС портал

По мере развития доступных веб-технологий ОБИС Портал претерпел ряд итераций с момента своего создания в 2002 году. Первоначально система извлекала удаленные данные в реальном времени в ответ на запрос пользователя и использовала KGS Mapper для визуализации результатов. В 2004 году было введено централизованное индексирование и кеширование метаданных, что привело к более быстрым и надежным результатам, а преобразователь c-квадратов добавлены опции визуализации данных.[11] В 2010 г. веб-ГИС Система на базе была представлена ​​впервые вместе с новой версией веб-сайта, что привело к значительно более подробному и гибкому представлению результатов поиска, а также ряду новых параметров поиска.[12] В апреле 2018 года было объявлено о финансировании разработки новой версии OBIS «2.0» с улучшенными возможностями.[13], и выпущен 29 января 2019 года.[14]. URL-адрес веб-сайта изменен с iobis.org на obis.org.

Региональные узлы ОБИС

За период с 2004 г. по настоящее время международная сеть Региональные узлы ОБИС также были созданы, которые облегчают подключение источников данных в их регионе к главной сети данных OBIS, а также все чаще предоставляют специализированные услуги или представления данных OBIS пользователям в их конкретном регионе.

Размещено Бельгийской платформой по биоразнообразию, Брюссель и Морской институт Фландрии, Остенде. Под управлением Бруно Даниса
Организатор: Centro Nacional Patagonico - (CENPAT) - CONICET. Под управлением Мирты Льюис
Организатор - Организация научных и промышленных исследований Содружества - океаны и атмосфера. Управляет Дэйв Уоттс
Организаторы - Центр морского биоразнообразия и Бедфордский институт океанографии. Под управлением Боба Брантона
Организатор - Институт океанологии. Управляется Сунь Сяося
Размещено Vlaams Instituut voor de Zee. Под управлением Ward Appeltans
Организаторы - Национальная химическая лаборатория и Национальный институт океанографии. Под управлением Бабы Инголе
Организатор - Национальный институт экологических исследований. Под управлением Джунко Шимура
Организатор - Национальный институт водных и атмосферных исследований. Под управлением Дона Робертсона
Размещено Южноафриканским центром данных по океанографии. Под управлением Мартена Грундлинга
Организатор - Центр биоразнообразия АСЕАН. Под управлением Кристиана Эллорана
Организатор - Университет Консепсьона. Под управлением Рубена Эскрибандо
Организаторы: Университет Сан-Паулу (USP) и Справочный центр экологической информации (CRIA. Управляется Фабио Ланг Да Силвера)
Размещено Геологической службой США (USGS). Под управлением Марка Форнуолла

Смотрите также

Избранные публикации об ОБИС

Рекомендации

  1. ^ Сайт ОБИС (посещение 18 июля 2018 г.)
  2. ^ Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. «Глобальная океаническая биогеографическая информационная система (ОБИС) для переписи морской жизни». Океанография 12(3): 12-14.
  3. ^ Океанография Том 13, вып. 3, ноябрь 2000 г. Специальный выпуск: Океанская биогеографическая информационная система.
  4. ^ Грассл, Дж. Ф. 2000. "Биогеографическая информационная система океана (ОБИС): он-лайн всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте". Океанография 13(3): 5-7.
  5. ^ Чжан Ю. и Грассл Дж. Ф. 2003. «Портал океанской биогеографической информационной системы». Oceanologica Acta 25(5): 193-197.
  6. ^ "www.iobis.org: архивная версия, 20 марта 2002 г.". В архиве с оригинала от 20 марта 2002 г.. Получено 20 марта 2002.
  7. ^ «www.iobis.org: архивная версия, 2 мая 2006 г.». В архиве из оригинала 2 мая 2006 г.. Получено 2 мая 2006.
  8. ^ www.obis.org: архивная версия, 13 декабря 2010 г.
  9. ^ Об ОБИС: архивная версия, 5 июля 2018 г.
  10. ^ Об ОБИС: Управление
  11. ^ Тони Рис и Фиби Чжан, 2007. «Развитие концепций в архитектуре и функциональности OBIS, океанской биогеографической информационной системы». в Vanden Berghe, E. et al. (ред.) Proceedings of Ocean Biodiversity Informatics: международная конференция по управлению данными морского биоразнообразия, Гамбург, Германия, 29 ноября - 1 декабря 2004 г. Отчет семинара МОК, 202, Специальная публикация 37 ВЛИЗ: стр. 167-176.
  12. ^ Эй Фудзиока и другие., 2012. «Развитие глобальных исследований морской биогеографии с помощью программного обеспечения ГИС с открытым исходным кодом и облачных вычислений». Транзакции в ГИС 16(2): 143–160.
  13. ^ «МОК инвестирует в OBIS2.0, крупную модернизацию платформы OBIS»,
  14. ^ «Выпущен ОБИС 2.0»,

внешняя ссылка

ОБИС Международный Портал

Региональные узлы ОБИС

Тематические узлы

Родительский проект

История