Токсин-антитоксиновая система ParDE типа II - ParDE type II toxin-antitoxin system

Токсин ParE системы токсин-аниттоксин II типа
PDB 1wmi EBI.jpg
Кристаллическая структура комплекса рел-релб архей из Pyrococcus horikoshii ot3
Идентификаторы
СимволParE_toxin
PfamPF05016
Pfam кланCL0136
ИнтерПроIPR007712
ParD
Идентификаторы
СимволParD
PfamPF09386
Pfam кланCL0057
ИнтерПроIPR018985

В токсин-антитоксиновая система parDE типа II это один из примеров бактериальный токсин-антитоксин (TA) системы, которые кодируют два белки, один из мощных ингибиторов распространение клеток (токсин) и другой его специфический антидот (антитоксин). Эти системы преимущественно гарантируют рост плазмида -носящие дочерние клетки в бактериальной популяции путем убийства новорожденного бактерии которые не унаследовали копию плазмиды при делении клетки (пост-сегрегационное уничтожение).[1]

ParD - это плазмида антитоксин, который образует ленту-спираль-спираль ДНК привязка структура.[2] Стабилизирует плазмиды путем ингибирования ParE токсичность в клетки которые выражают ParD и ParE. ParD образует димер а также регулирует свой собственный промоутер (parDE). Как и в случае с CcdB, целью токсина является ДНК-гираза.[3] Индукция токсина ParE приводит к подавлению деления клеток, но не к росту клеток.

ПарД и ccD системы оказались поразительно похожими по своей структуре и действиям. Белок-антитоксин каждой системы взаимодействует со своим родственным токсином, чтобы нейтрализовать активность токсина, и в процессе этого комплекс этих двух становится эффективной транскрипцией. репрессор.[4]

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ Йенсен РБ, Гердес К. (1995). «Запрограммированная гибель клеток у бактерий: системы стабилизации белковой плазмиды». Мол Микробиол. 17 (2): 205–10. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1995.mmi_17020205.x. PMID  7494469.
  2. ^ Оберер М., Зангер К., Притулла С., Келлер В. (январь 2002 г.). «Антитоксин ParD плазмиды RK2 состоит из двух структурно различных частей и принадлежит к семейству ДНК-связывающих белков лента-спираль-спираль». Biochem. J. 361 (Пт 1): 41–7. Дои:10.1042/0264-6021:3610041. ЧВК  1222296. PMID  11743881.
  3. ^ Фибиг А., Кастро Рохас К.М., Сигал-Гаскинс Д., Кроссон С. (2010). «Специфичность взаимодействия, токсичность и регуляция паралогичного набора систем токсин-антитоксин семейства ParE / RelE». Мол Микробиол. 77 (1): 236–51. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2010.07207.x. ЧВК  2907451. PMID  20487277.
  4. ^ Смит А.Б., Лопес-Вилларехо Дж., Диаго-Наварро Э., Митченолл Л.А., Барендрегт А., Хек А.Дж. и др. (2012). «Общее происхождение бактериальных систем токсин-антитоксин parD и ccd, предложенное анализами взаимодействий токсин / мишень и токсин / антитоксин». PLOS ONE. 7 (9): e46499. Дои:10.1371 / journal.pone.0046499. ЧВК  3460896. PMID  23029540.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR018985
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR007712