Семейство пластоцианиновых белков, связывающих медь - Plastocyanin family of copper-binding proteins
| Белки, связывающие медь, семейство пластоцианинов / азуринов | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура пластоцианина тополя.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Медь-связка | ||||||||
| Pfam | PF00127 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000923 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00174 | ||||||||
| SCOP2 | 1plc / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 93 | ||||||||
| Белок OPM | 1sfd | ||||||||
| CDD | cd00920 | ||||||||
| |||||||||
Семейство пластоцианинов / азуринов медьсвязывающих белков (или синий (тип 1) медный домен) это семья малых белков, которые связывают один атом меди и которые характеризуются интенсивной электронной полосой поглощения около 600 нм (см. белки меди ).[2][3] Наиболее известными представителями этого класса белков являются хлоропласты растений. пластоцианы, которые обмениваются электронами с цитохром c6, и отдаленно родственные бактериальные азурины, которые обмениваются электронами с цитохромом с551. Это семейство белков также включает амицианин от бактерий, таких как Methylobacterium extorquens или же Paracoccus versutus (Thiobacillus versutus), которые могут расти на метиламине; auracyanins A и B из Chloroflexus aurantiacus;[4] белок голубой меди из Alcaligenes faecalis; купредоксин (CPC) от Cucumis sativus Пилинги (огурцы);[5] кузацианин (основной синий белок; плантацианин, CBP) из огурца; галоцианин из Натрономонас фараонис (Natronobacterium pharaonis),[6] ассоциированный с мембраной медьсвязывающий белок; псевдоазурин из Pseudomonas; рустицианин из Thiobacillus ferrooxidans;[7] стеллацианин из Rhus vernicifera (Японское лаковое дерево); умецианин из корней Арморация деревенская (Хрен); и аллерген Ra3 из амброзии. Этот белок пыльцы эволюционно связан с указанными выше белками, но, по-видимому, утратил способность связывать медь. Хотя существует значительная дивергенция в последовательностях всех этих белков, сайты медных лигандов сохранены.
Рекомендации
- ^ Гусс Дж. М., Бартуник HD, Freeman HC (Декабрь 1992 г.). «Точность и прецизионность анализа структуры белка: уточнение структуры пластоцианина тополя с ограничением по методу наименьших квадратов при разрешении 1,33 A». Acta Crystallogr. B. 48 (6): 790–811. Дои:10.1107 / S0108768192004270. PMID 1492962.
- ^ Клингелеффер DJ, Гасс Дж. М., Роджерс С. Дж., Фриман Х. С., Гаррет Т. П. (1984). «Кристаллическая структура апопластоцианина тополя при разрешении 1,8-A. Геометрия сайта связывания меди создается полипептидом». J. Biol. Chem. 259 (5): 2822–2825. Дои:10.2210 / pdb2pcy / pdb. PMID 6698995.
- ^ Охота LT, Райден LG (1993). «Эволюция белковой сложности: синие медьсодержащие оксидазы и родственные белки». J. Mol. Evol. 36 (1): 41–66. Дои:10.1007 / BF02407305. PMID 8433378. S2CID 28527197.
- ^ Meyer TE, Han J, McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J, Cusanovich MA, Tollin G, Blankenship RE (1992). «Выделение, характеристика и аминокислотные последовательности auracyanins, белков голубой меди из зеленой фотосинтетической бактерии Chloroflexus aurantiacus». J. Biol. Chem. 267 (10): 6531–6540. PMID 1313011.
- ^ Мессершмидт А., Манн К., Тонес У., Мехрабиан З., Налбандян Р., Шафер В. (1992). «Аминокислотная последовательность белка меди типа I с необычным С-концевым доменом, богатым серином и гидроксипролином, выделенным из кожуры огурца». FEBS Lett. 314 (3): 220–223. Дои:10.1016/0014-5793(92)81475-2. PMID 1468551. S2CID 24911765.
- ^ Oesterhelt D, Mattar S, Scharf B, Rodewald K, Engelhard M, Kent SB (1994). «Первичная структура галоцианина, синего медного белка архей, предсказывает липидный якорь для фиксации мембраны». J. Biol. Chem. 269 (21): 14939–14945. PMID 8195126.
- ^ Яно Т., Фукумори Ю., Яманака Т. (1991). «Аминокислотная последовательность рустицианина, выделенного из Thiobacillus ferrooxidans». FEBS Lett. 288 (1): 159–162. Дои:10.1016/0014-5793(91)81025-4. PMID 1879547. S2CID 37485952.