Квазисвязанное равновесие - Quasi-linkage equilibrium

Квазисвязанное равновесие (QLE) математическое приближение, используемое при решении задач популяционной генетики. Мотоо Кимура ввел понятие для упрощения модели Основная теорема Фишера. QLE значительно упрощает генетические уравнения популяций, делая допущение слабый отбор и слабый эпистаз.^[1] Отбор в этих условиях быстро изменяет частоты аллелей до состояния, при котором они развиваются, как если бы равновесие сцепления. Первоначально Кимура предоставил достаточные условия для QLE в двухлокусных системах, но недавно несколько исследователей показали, как QLE возникает в общих мультилокусных системах.^[2] QLE позволяет теоретикам аппроксимировать неравновесие сцепления простыми выражениями, часто простыми функциями частот аллелей или генотипов, тем самым обеспечивая решения очень сложных проблем, включающих отбор по множественным локусам или полигенным признакам.^[3] QLE также играет важную роль в обосновании приближений при выводе количественный генетический уравнения из менделевский принципы.

Простая модель

Позволять ${\displaystyle X}$, ${\displaystyle Y}$, ${\displaystyle Z}$ и ${\displaystyle U}$ представляют собой частоты четырех возможных генотипы в гаплоидной модели с двумя локусами и двумя аллелями. Оригинальная модель Кимуры^[1] показало, что

${\displaystyle R={\frac {XU}{YZ}}}$

приближается к стабильному состоянию ${\displaystyle {\hat {R}}}$ быстро, если эпистатические эффекты малы по сравнению с рекомбинацией. Отклонения от ${\displaystyle {\hat {R}}}$ будет сокращено на рекомбинация дробь каждого поколения.

Рекомендации

1. Кимура, Мотоо (1965). «Достижение квазисвязанного равновесия при изменении частот генов в результате естественного отбора». Генетика. 52 (5): 875–890. ЧВК  1210959. PMID  17248281.
2. Нагилаки, Томас; Хофбауэр, Джозеф; Бруновский, Павел (1999). «Сходимость мультилокусных систем при слабом эпистазе или слабом отборе». Журнал математической биологии. 38 (2): 103–133. Дои:10.1007 / s002850050143. PMID  10085555. S2CID  1220489.
3. Киркпатрик, Марк; Джонсон, Тоби; Бартон, Николас (2002). «Общие модели эволюции мультилокуса». Генетика. 161 (4): 1727–1750. ЧВК  1462196. PMID  12196414.