Спарсомицин - Sparsomycin

Спарсомицин
Спарсомицин.png
Идентификаторы
Количество CAS
PubChem CID
ChemSpider
UNII
КЕГГ
ЧЭМБЛ
Панель управления CompTox (EPA)
Химические и физические данные
ФормулаC13ЧАС19N3О5S2
Молярная масса361.43 г · моль−1
3D модель (JSmol )

Спарсомицин соединение, первоначально обнаруженное как метаболит бактерии Streptomyces sparsogenes, который связывается с 50S рибосомная субъединица и подавляет синтез белка через пептидилтрансфераза торможение.[1] Связываясь с 50S субъединицей рибосомы, он индуцирует перемещение на Подблок 30S.[2] Это нуклеотид аналог. Раньше считалось возможным противоопухолевый агент, но интерес к этому препарату был позже отброшен после того, как было обнаружено, что он приводит к ретинопатия[3] и как инструмент для изучения синтеза белка; это не специфично для бактериальные рибосомы и поэтому не может использоваться в качестве антибиотик.

Соединение было обнаружено в 1962 году. [4] а структура была определена в 1970 г .;[5] о первом полном синтезе сообщалось в 1981 году.[6]

Производным этого соединения является фенол-аланин-спарсомицин, и считается, что он является более эффективным противоопухолевым средством, чем сам спарсомицин.[3]

Биосинтез

Хотя структура спарсомицина была опубликована в 1970 году, нет биосинтетический путь для его формирования предлагалось в литературе вплоть до 1988 г. Рональд Дж. Парри и другие. исследовали биосинтетические предшественники необычной монооксодитиоацетальной группы.[7] Применяя радиоактивно меченые L-метионин к С. sparsogenes, они выяснили, что это был наиболее вероятный предшественник атомов C-4 'и C-5' спарсомицина. Однако при введении меченых цистеин, они обнаружили, что C-4 'не содержал 13C, в то время как C-3 все еще делал. Это открытие привело их к предположению, что фермент так называемая серинтрансгидроксиметилаза, может отвечать за наблюдение путем превращения цистеина в серин остаток. Однако это предположение не подтвердилось, так как администрация 13C-серин не продуцировал меченый спарсомицин. В этом исследовании авторы окончательно пришли к выводу, что S-метил-D-цистеин должен быть прекурсором для этой части молекула. В этой статье они также предложили L-триптофан как источник урацил -содержащая часть молекулы.

Изучение биосинтез спарсомицина более подробно выявило, что L-цистеин и S-метильная группа метионин являются реальными предшественниками монооксодитиоацетальной группы.[8] Эти исследования также подтвердили, что L-триптофан является предшественником урацила. часть спарсомицина. Однако до сих пор оставалось неясным, идет ли трансформация по кинуреиновому пути или нет. Следующая статья, опубликованная той же исследовательской группой, показала, что этот путь не отвечает за трансформации L-трипофан в биосинтезе спарсомицина. В этой статье авторы также подтвердили (E) -3- (4-оксо-6-метил-5-пиримидинил) акриловую кислоту (PCA) и (E) 3- (2,4-диоксо-6-метил-5 -пиримидинил) акриловая кислота (UCA) является промежуточным звеном в изученном пути биосинтеза.[9] Спустя несколько лет был обнаружен фермент, катализирующий превращение PCA в UCA.[10]

Спарсомицин retro.png
Спарсомицин биосинтез.png

Рекомендации

  1. ^ Гарретт Р., Гришэм С.М. (2013). Биохимия. Брукс / Коул, Cengage Learning. ISBN  978-1133106296. OCLC  777722371.
  2. ^ Ермоленко Д.Н., Корниш П.В., Ха Т, Ноллер Х.Ф. (февраль 2013). «Антибиотики, которые связываются с сайтом A большой рибосомной субъединицы, могут вызывать транслокацию мРНК». РНК. 19 (2): 158–66. Дои:10.1261 / rna.035964.112. ЧВК  3543091. PMID  23249745.
  3. ^ а б Лазаро Э., Сан Феликс А., ван ден Брук Л.А., Оттенхейм Х.С., Баллеста Дж. П. (январь 1991 г.). «Взаимодействие антибиотика спарсомицина с рибосомой». Противомикробные препараты и химиотерапия. 35 (1): 10–3. Дои:10.1128 / aac.35.1.10. ЧВК  244933. PMID  2014963.
  4. ^ А. Д. Аргуделис, Р. Р. Герр, Антимикробный. Ag. Chemoth. 780
  5. ^ П. Уайли, Ф. Маккеллар, Варенье. Chem. Soc. 92(2) (1970), стр 417-418 [1]
  6. ^ Полный синтез антибиотика спарсомицина, модифицированной аминокислоты урацила моноксодитиоацеталя, Гарри К. Дж. Оттенхейм, Роб М. Дж. Лискэмп, Саймон П. Дж. М. Ван Ниспен, Ханс А. Бутс, Мэриан В. Тиххейс, J. Org. Chem. 46 (16) (1981), стр 3273-3283 [2]
  7. ^ Парри Р.Дж., Юди М.Э. (1988). «Биосинтез спарсомицина. Выяснение происхождения углеродного скелета». Варенье. Chem. Soc. 110 (7): 2316–2317. Дои:10.1021 / ja00215a060.
  8. ^ Парри Р.Дж., Ли Й., Гомес Е.Е. (1992). «Биосинтез противоопухолевого антибиотика спарсомицина». Варенье. Chem. Soc. 114 (15): 5946–5959. Дои:10.1021 / ja00041a007.
  9. ^ Парри Р.Дж., Хойт Дж.С., Ли Й. (1994). «Биосинтез спарсомицина. Дальнейшие исследования биосинтеза урацилакриловой кислоты». Буквы Тетраэдра. 35 (41): 7497–7500. Дои:10.1016 / s0040-4039 (00) 78327-4.[мертвая ссылка ]
  10. ^ Парри Р.Дж., Хойт Дж.С. (февраль 1997 г.). «Очистка и предварительная характеристика синтазы (E) -3- (2,4-диоксо-6-метил-5-пиримидинил) акриловой кислоты, фермента, участвующего в биосинтезе противоопухолевого агента спарсомицина». Журнал бактериологии. 179 (4): 1385–92. Дои:10.1128 / jb.179.4.1385-1392.1997. ЧВК  178840. PMID  9023226.