Stemloc - Stemloc

Stemloc
Разработчики)Ян Холмс (Калифорнийский университет в Беркли )
Стабильный выпуск
1
Операционная системаUNIX, Linux, Mac, Cygwin на Windows XP
ТипИнструмент биоинформатики
ЛицензияОткрытый исходный код
Интернет сайтДомашняя страница Stemloc

Stemloc программа для попарного структурного выравнивания РНК на основе вероятностных моделей Структура РНК известный как Парные стохастические контекстно-свободные грамматики. Stemloc реализует ограниченные версии алгоритмов Санкоффа для одновременного предсказания структуры и выравнивание последовательностей множества РНК.

Stemloc можно скачать как часть Пакет программного обеспечения DART. Он принимает входные файлы в любом ФАСТА или же Стокгольмский формат.

Рекомендации

внешняя ссылка