Стивен Альтшул - Stephen Altschul

Стивен Альтшул
Родился
Стивен Франк Альтшул

(1957-02-28) 28 февраля 1957 г. (63 года)
ГражданствоСоединенные Штаты
Альма-матерГарвардский университет (А.Б., математика)
Массачусетский Институт Технологий (Кандидат математических наук)
ИзвестенВЗРЫВ
Супруг (а)Кэролайн Кершоу Джеймс (м. 1994)
Научная карьера
ПоляБиоинформатика
УчрежденияNCBI
ТезисАспекты сравнения биологических последовательностей  (1987)
ДокторантДаниэль Клейтман[1]
Интернет сайтwww.ncbi.nlm.Национальные институты здравоохранения США.gov/исследование/штат сотрудников/ altschul

Стивен Франк Альтшул (родился 28 февраля 1957 г.) - американец математик кто разработал алгоритмы которые используются в области биоинформатика (алгоритм Карлина-Альтшуля[2] и его преемники[3]). Альтшул является соавтором ВЗРЫВ алгоритм, используемый для анализ последовательности из белки и нуклеотиды.[4][5]

Образование

Altschul окончил с отличием[6] от Гарвардский университет, где он был избран Пхи Бета Каппа в математика и имеет Кандидат наук. в том же поле из Массачусетский Институт Технологий.[7]

Исследование

Его исследовательский интерес сосредоточен на алгоритмах выравнивания последовательностей, статистике сравнения последовательностей и измерении сходства последовательностей.[4][5]

Задний план

Он сын Стефани Розмари (урожденная Вагнер) и Артур Альтшул, бывший партнер в Голдман Сакс.[8][9] В 1994 году он женился на Кэролайн Кершоу Джеймс, дочери Кэролайн Джеймс-Приц. Цинциннати и Гарри Кейтан Джеймс из Дейтон, Огайо. Преподобный Лютер Д. Миллер-младший провел церемонию в епископальной церкви Святого Давида в Вашингтоне.[6]

Его сводная сестра - журналист Серена Альтшул известна своим пребыванием в MTV. Со стороны отца он является членом Семья Леман.

У него двое сыновей, Джеймс и Уильям Альтшул. Уильям Альтшул - бывший игрок в Ultimate Вашингтонского университета в Сент-Луисе. [10]

От математики до биоинформатики

В студенческие годы Альтшул проявил интерес к биологии. В результате он начал читать книги о ДНК. Одна из книг, которые он прочитал, была Двойная спираль пользователя Watson.[нужна цитата ] Кроме того, он также прошел курс эволюционной биологии.[нужна цитата ] Альтшул также провел два лета, работая в лабораториях Университета Рокфеллера, где он помогал писать компьютерные коды для проекта рентгеновской кристаллографии.[нужна цитата ]

Из-за своего интереса Альтшул подумывал о поступлении в аспирантуру по биологии.[нужна цитата ] Вместо этого он решил подать заявку на участие в программах по прикладной математике в надежде найти приложения математики к биологии, над которыми можно было бы работать.

Заметные назначения / занимаемые должности

По окончании учебы Стивен Франк Альтшул работал в отделении математических исследований Национального института диабета, болезней органов пищеварения и почек в качестве постдокторской стипендии IRTA. С 1990 г. по настоящее время он работал в отделении вычислительной биологии NCBI, занимая должность старшего исследователя.

использованная литература

  1. ^ Стивен Альтшул на Проект "Математическая генеалогия"
  2. ^ Альтшул, С.; Гиш, В.; Миллер, В.; Майерс, Э.; Липман, Д. (1990). «Базовый инструмент поиска местного выравнивания». Журнал молекулярной биологии. 215 (3): 403–410. Дои:10.1016 / S0022-2836 (05) 80360-2. PMID  2231712.
  3. ^ Альтшул, С.; Madden, T. L .; Schäffer, A. A .; Zhang, J .; Zhang, Z .; Миллер, В.; Липман, Д. Дж. (1997). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базе данных белков». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (17): 3389–3402. Дои:10.1093 / nar / 25.17.3389. ЧВК  146917. PMID  9254694.
  4. ^ а б Список публикаций от Microsoft Academic
  5. ^ а б Стивен Ф. Альтшул в DBLP Сервер библиографии Отредактируйте это в Викиданных
  6. ^ а б New York Times: «Свадьбы; Кэролайн Джеймс, Стивен Альтшул» 17 апреля 1994 г.
  7. ^ Альтшул, Стивен Франк (1987). Аспекты сравнения биологической последовательности (Кандидатская диссертация). Массачусетский Институт Технологий.
  8. ^ Уведомление о смерти Артура Гудхарта Альтшула
  9. ^ https://www.nytimes.com/1956/03/18/archives/trota-announced-of-miss-wagner-to-be-wed-in-may.html
  10. ^ https://play.usaultimate.org/teams/events/Eventteam/?TeamId=x%2f0V5EX9wIVnzxDyk7NGO5XjowKF%2boMV0pElxx1dgY8%3d

внешние ссылки