Тетрапарвовирус - Tetraparvovirus

Тетрапарвовирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Parvovirinae
Род:Тетрапарвовирус
Типовой вид
Примат тетрапарвовирус 1

Тетрапарвовирус представляют собой род вирусов в семье Parvoviridae.[1][2] В настоящее время существует шесть признанных видов: Тетрапарвовирус рукокрылых 1, Примат тетрапарвовирус 1, Тетрапарвовирус копытных 1, Тетрапарвовирус копытных 2, Тетрапарвовирус копытных 3, и Тетрапарвовирус копытных 4.[3]

История

Первый представитель этого рода был идентифицирован в 2001 году в сыворотке крови свиней и обозначен как парвовирус свиней 2.[4] Первый тетрапарвовирус человека, PARV4, был описан в 2005 году.[5] Эти новые вирусы были признаны родственными, но отличными от известных парвовирусов. Они были изолированы от группы пациентов, которые вели рискованное поведение. Остальные члены этой группы были изолированы от животных источников в Гонконге.[6] Эти изоляты первоначально назывались Хоковирусы. Их изолировали от кабанов в Германии.[7] и шимпанзе и павианы.[8] Их также изолировали от овец.[9] и свиньи.[10] Наконец, они были обнаружены и у летучих мышей.[11]

Описание

Тетрапарвовирусы - это небольшие вирусы животных без оболочки с геномом одноцепочечной ДНК длиной от 4 до 6 т.п.н.[2] Есть 2 открытые рамки для чтения (ORF) присутствует в геноме. ORF1 кодирует неструктурный белок (NS1), а ORF2 кодирует белки вирусного капсида (VP1 / VP2). Инвертированные концевые повторы присутствуют на 5'- и 3'-концах генома. В этом семействе есть третья ORF, лежащая в VP1.

Белок NS1 обладает как геликаза и АТФаза домены. Он имеет ~ 652 аминокислотных остатка и молекулярную массу 70–75 килодальтон (кДа). Белок VP1 содержит 900–950 аминокислотных остатков и имеет молекулярную массу ~ 100 кДа. VP1 имеет сохраненный фосфолипаза Домен A2, который используется вирионом для выхода из эндосома.

Третья ORF кодирует небольшой белок с единственной трансмембранной спиралью, охватывающей 20 аминокислотных остатков в центре. Его молекулярная масса составляет ~ 10 кДа. Функция этого белка неизвестна.

Вирусология

Эти вирусы были выделены из крови, печени, селезенки, лимфатических узлов и костного мозга.

Клинический

Эти вирусы до сих пор не были связаны с заболеванием ни у одного из известных им хозяев.

Рекомендации

  1. ^ Котмор, Сан-Франциско; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (3): 367–368. Дои:10.1099 / jgv.0.001212. ЧВК  6537627. PMID  30672729.
  2. ^ а б «10-й отчет ICTV (2018)».
  3. ^ "10-й отчет ICTV (2018)" Тетрапарвовирус"".
  4. ^ Хидзиката М., Абэ К., Вин К.М., Симидзу Ю.К., Кейчо Н., и другие (2001) Идентификация новой последовательности ДНК парвовируса в сыворотке крови свиней из Мьянмы. Jpn J. Infect. Дис. 54: 244-245.
  5. ^ Джонс М.С., Капур А., Лукашов В.В., Симмондс П., Хехт Ф., и другие (2005) Новые ДНК-вирусы, выявленные у пациентов с синдромом острой вирусной инфекции. J Virol 79: 8230–8236.
  6. ^ Лау СК, Ву ПК, Цзе Х, Фу СТ, Ау WK, и другие (2008) Идентификация новых парвовирусов свиней и крупного рогатого скота, тесно связанных с парвовирусом человека 4. J Gen Virol 89: 1840–1848
  7. ^ Adlhoch C, Kaiser M, Ellerbrok H, Pauli G (2010) Высокая распространенность хоковируса свиней в популяциях немецких кабанов. Вирол J 7: 171
  8. ^ Sharp CP, LeBreton M, Kantola K, Nana A, Diffo Jle D и др. (2010) Широко распространенная инфекция гомологами парвовирусов человека B19, PARV4 и бокавируса человека шимпанзе и горилл в дикой природе. J Virol 84: 10289–10296
  9. ^ Tse H, Tsoi HW, Teng JL, Chen XC, Liu H, Zhou B, Zheng BJ, Woo PC, Lau SK, Yuen KY (2011) Открытие и геномная характеристика нового партетравируса овец и нового генотипа партетравируса крупного рогатого скота. PLoS One 6 (9): e25619.
  10. ^ Li B, Ma J, Xiao S, Wen L, Ni Y, Zhang X, Fang L, He KJ (2012) Последовательность генома широко распространенного партетравируса свиней в материковом Китае. Вирол 86 (3): 1899
  11. ^ Канути, Марта; Эйс-Хюбингер, Анна Мария; Дейс, Мартин; де Вриз, Мишель; Дрекслер, Ян Феликс; Oppong, Samuel K .; Мюллер, Марсель А .; Klose, Stefan M .; Веллингхаузен, Неле (27 декабря 2011 г.). «Два новых парвовируса у плодоядных летучих мышей Нового и Старого Света». PLoS ONE. 6 (12): e29140. Дои:10.1371 / journal.pone.0029140. ЧВК  3246463. PMID  22216187.