Домен C4 коллагена IV типа - Type IV collagen C4 domain - Wikipedia
| C4 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура 1.9-a неколлагенового (nc1) домена коллагена плаценты человека iv демонстрирует стабилизацию за счет нового типа ковалентных поперечных связей met-lys | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | C4 | ||||||||
| Pfam | PF01413 | ||||||||
| Pfam клан | CL0056 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001442 | ||||||||
| УМНАЯ | C4 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00031 | ||||||||
| МЕРОПЫ | C47 | ||||||||
| SCOP2 | 1 час / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| TCDB | 2.A.16 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен C4 коллагена IV типа (или домен NC1 коллагена IV) является дублированным домен присутствует на C-конце коллагены IV типа. Каждый коллаген типа IV содержит длинный трехспиральный коллагеновый домен, фланкированный коротким 7S-доменом из 25 аминокислоты и глобулярный неколлагеновый домен C4 из ~ 230 аминокислот на N- и C-конце соответственно. При сборке протомера домены C4 трех цепей взаимодействуют, образуя тример C4, чтобы выбрать и зарегистрировать цепи для тройная спираль формирование. В сетевой сборке C4 тримеры двух протомеров взаимодействуют, образуя структуру гексамера C4, чтобы выбрать и соединить протомеры.[1][2][3]
Домен C4 коллагена IV содержит 12 цистеины, и все они участвуют в дисульфидные связи. Это складки в третичная структура с преимущественно бета-цепями. Домен C4 коллагена IV состоит из двух аналогичных сложенный субдомены, стабилизированные тремя внутрицепочечными дисульфидными связями с участием следующих пар: C1-C6, C2-C5 и C3-C4. Каждая подобласть представляет собой компактную, стабилизированную дисульфидом треугольную структуру, из которой пальцеобразный петля для шпильки проекты в не до конца сформированный шестинитевой бета-лист смежной подобласти той же самой или соседней цепи, плотно зажимающей подобласти вместе.[1][2][3]
Рекомендации
- ^ а б Than ME, Хенрих С., Хубер Р., Рис А., Манн К., Кун К., Тимпл Р., Буренков Г. П., Бартуник HD, Боде В. (май 2002 г.). «Кристаллическая структура 1.9-A неколлагенового (NC1) домена коллагена IV плаценты человека демонстрирует стабилизацию за счет нового типа ковалентной поперечной связи Met-Lys». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (10): 6607–12. Дои:10.1073 / pnas.062183499. ЧВК 124450. PMID 12011424.
- ^ а б Сундарамурти М., Мейаппан М., Тодд П., Хадсон Б.Г. (август 2002 г.). «Кристаллическая структура доменов NC1. Структурная основа сборки коллагена IV типа в базальных мембранах». J. Biol. Chem. 277 (34): 31142–53. Дои:10.1074 / jbc.M201740200. PMID 11970952.
- ^ а б Ванакор Р. М., Шанмугасундарарадж С., Фридман Д. Б., Бондар О., Хадсон Б. Г., Сундарамурти М. (октябрь 2004 г.). «Сеть alpha1.alpha2 коллагена IV. Усиленная стабилизация неколлагенового домена-1 нековалентными силами и отсутствием поперечных связей Met-Lys». J. Biol. Chem. 279 (43): 44723–30. Дои:10.1074 / jbc.M406344200. PMID 15299013.