Полиомавирус WU - WU polyomavirus

Полиомавирус человека 4
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Papovaviricetes
Заказ:Сеполивиралес
Семья:Polyomaviridae
Род:Бетаполиомавирус
Разновидность:
Полиомавирус человека 4

Полиомавирус WU (также известен как WU вирус, WUPyV, или же Полиомавирус человека 4) это вирус семьи Polyomaviridae. Он был обнаружен в 2007 году в образцах выделений из дыхательных путей человека, первоначально у ребенка-пациента из Австралии, у которого были клинические признаки пневмония и у кого не были обнаружены другие распространенные респираторные вирусы. Последующие исследования выявили присутствие вируса WU в образцах респираторного секрета пациентов в Австралии и США, что позволяет предположить, что, как и другие полиомавирусы человека, вирус WU широко распространен.[1]

Открытие

Вирус WU был обнаружен секвенирование дробовика нуклеиновых кислот, обнаруженных в респираторном секрете молодого пациента с диагнозом пневмония у которых не были обнаружены другие известные респираторные вирусы. Гомология последовательностей был обнаружен среди последовательностей, обнаруженных в клиническом образце, и известных геномы других полиомавирусов человека.[1] Вирус WU был одним из двух новых полиомавирусов человека, обнаруженных в 2007 г .; другой был KI вирус.[2]

Геном

Структура генома вируса WU.[1]

Полный геном вируса WU был секвенирован и оказался двухцепочечная ДНК геном 5229 пар оснований содержащий генетический материал, характерный для полиомавирусов, кодирующий пять вирусные белки: три капсид составные части, главный капсидный белок VP1, VP2 и VP3; и два дополнительных белка, участвующих в репликации, большой опухолевый антиген и небольшой опухолевый антиген.[1]

Распространенность

Хотя вирус WU был обнаружен во многих местах по всему миру, что указывает на глобальное распространение, оценки его распространенности различаются. В первом отчете, описывающем вирус, его ДНК была обнаружена в 0,7% образцов респираторного секрета в популяции в Сент-Луис, штат Миссури и 3,0% образцов в Брисбен, Австралия.[1] Об аналогичных показателях распространенности менее 5% сообщалось в различных местах и ​​среди разных групп населения, с некоторыми указаниями на возрастную зависимость.[3] Напротив, в одном исследовании 2009 г. серологическая распространенность - то есть преобладание антитела против вируса (в данном случае белка оболочки VP1) - 69% среди взрослого населения Америки и 54% среди населения Америки детей.[4] Другое исследование 2009 года выявило около 80% распространенности серотипов среди взрослых, при этом возрастные особенности указывают на то, что младенцы могут наследовать материнские антитела против WU и KI.[5] Исследование серологической распространенности полиомавируса в 2016 году обнаружило вирус WU в 97,4% образцов из другой американской популяции.[6] Считается, что первичная инфекция возникает в детстве.[6]

Ассоциация болезней

Первоначально вирус WU был обнаружен в респираторном секрете пациента с диагнозом пневмония неизвестного происхождения.[1] Однако общий уровень коинфекции другими респираторными вирусами высок,[1][3] и неясно, вызывает ли заболевание сам вирус WU.[7] Вирус WU в моче не обнаружен,[1] хотя многие полиомавирусы заражают почки и мочеиспускательный канал и один полиомавирус человека, BK вирус, связан с нефропатия в почечный трансплантат пациенты.[8] Некоторые полиомавирусы хорошо известны как канцерогенный, включая полиомавирус человека Полиомавирус клеток Меркеля, но вирус WU также не был связан с раком.[9] Хотя четкой связи с клиническими симптомами не выявлено, имеется слабое свидетельство того, что вирусы WU и KI могут иметь патогенный потенциал в с ослабленным иммунитетом пациенты.[10]

Номенклатура и классификация

Вирус WU получил свое название от Вашингтонский университет, институциональная принадлежность исследователей, которые обнаружили и сообщили о вирусе.[1]

Как было первоначально описано, вирус WU был наиболее похож на KI вирус и несколько отличается от других полиомавирусов человека, известных в то время, JC вирус и BK вирус. Предложенная в 2010 году классификация рекомендовала разделить полиомавирусы на три рода, включая один род вирусов птиц и два вируса млекопитающих; один из последних был назначен Вукиполёмовирус чтобы указать двух его членов-основателей.[11] В обновленной системе классификации семейства полиомавирусов, предложенной в 2016 г., вирус WU классифицируется как член род Бетаполиомавирус вместе с BK, JC и KI.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я Гейнор, AM; Nissen, MD; В то время как DM; Mackay, IM; Lambert, SB; Wu, G; Бреннан, округ Колумбия; Сторч, Джорджия; Слоты, TP; Ван, Д. (4 мая 2007 г.). «Выявление нового полиомавируса у пациентов с острыми респираторными инфекциями». PLoS Патогены. 3 (5): e64. Дои:10.1371 / journal.ppat.0030064. ЧВК  1864993. PMID  17480120.
  2. ^ Алландер, Тобиас; Андреассон, Калле; Гупта, Шавон; Бьеркнер, Аннели; Богданович, Гордана; Persson, Mats A. A .; Далианис, Тина; Рамквист, Торбьорн; Андерссон, Бьорн (2007-04-01). «Выявление третьего полиомавируса человека». Журнал вирусологии. 81 (8): 4130–4136. Дои:10.1128 / JVI.00028-07. ISSN  0022-538X. ЧВК  1866148. PMID  17287263.
  3. ^ а б Абеди Киасари, B; Валлели, П.Дж.; Корлесс, CE; Аль-Хаммади, М. Клаппер, ЧП (сентябрь 2008 г.). «Возрастная картина полиомавирусной инфекции KI и WU». Журнал клинической вирусологии. 43 (1): 123–5. Дои:10.1016 / j.jcv.2008.05.003. ЧВК  7108349. PMID  18573691.
  4. ^ Кин, JM; Рао, S; Ван, М; Гарси, Р.Л. (март 2009 г.). «Сероэпидемиология полиомавирусов человека». PLoS Патогены. 5 (3): e1000363. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000363. ЧВК  2655709. PMID  19325891.
  5. ^ Nguyen, Nang L .; Ле, Бинь Минь; Ван, Дэвид (2009-08-01). «Серологические свидетельства частого инфицирования людей полиомавирусами WU и KI». Возникающие инфекционные заболевания. 15 (8): 1199–1205. Дои:10.3201 / eid1508.090270. ISSN  1080-6059. ЧВК  2815979. PMID  19751580.
  6. ^ а б Госсай, А; Waterboer, T; Нельсон, HH; Мишель, А; Willhauck-Fleckenstein, M; Фарзан, СФ; Hoen, AG; Кристенсен, Британская Колумбия; Келси, KT; Marsit, CJ; Павлита, М; Карагас, М.Р. (1 января 2016 г.). «Сероэпидемиология полиомавирусов человека в популяции США». Американский журнал эпидемиологии. 183 (1): 61–9. Дои:10.1093 / aje / kwv155. ЧВК  5006224. PMID  26667254.
  7. ^ Norja, P; Убиллос, I; Темплтон, К; Симмондс, П. (декабрь 2007 г.). «Нет доказательств связи между инфекциями полиомавирусами WU и KI и респираторными заболеваниями». Журнал клинической вирусологии. 40 (4): 307–11. Дои:10.1016 / j.jcv.2007.09.008. ЧВК  7172997. PMID  17997354.
  8. ^ а б Группа по изучению полиомавирусов Международного комитета по таксономии вирусов; Кальвиньяк-Спенсер, S; Фельткамп, MC; Догерти, доктор медицины; Moens, U; Рамквист, Т; Johne, R; Элерс, Б. (июнь 2016 г.). «Обновление таксономии семейства Polyomaviridae». Архив вирусологии. 161 (6): 1739–50. Дои:10.1007 / s00705-016-2794-у. PMID  26923930.
  9. ^ Далианис, Т; Hirsch, HH (15 марта 2013 г.). «Полиомавирусы человека при болезнях и раках». Вирусология. 437 (2): 63–72. Дои:10.1016 / j.virol.2012.12.015. PMID  23357733.
  10. ^ Бабакир-Мина, М; Чиккоцци, М; Perno, CF; Чиотти, М. (август 2013 г.). «Полиомавирусы человека KI и WU: вирусологические предпосылки и клинические последствия». APMIS. 121 (8): 746–54. Дои:10.1111 / apm.12091. PMID  23782405.
  11. ^ Johne, R; Бак, CB; Allander, T; Этвуд, WJ; Гарсиа, Р.Л .; Империале, MJ; Майор, ЭО; Рамквист, Т; Норкин, Л.С. (сентябрь 2011 г.). «Таксономические изменения в семействе Polyomaviridae». Архив вирусологии. 156 (9): 1627–34. Дои:10.1007 / s00705-011-1008-х. ЧВК  3815707. PMID  21562881.