YWTD повторяется - YWTD repeat

Повторение рецептора ЛПНП класса B
Идентификаторы
СимволLdl_recept_b
PfamPF00058
ИнтерПроIPR000033

YWTD повторяет четырехцепочечные повторы бета-пропеллера, обнаруженные в рецепторы липопротеинов низкой плотности (ЛПНП). Шесть повторов YWTD вместе складываются в шестилопастной бета-винт (ИнтерПро: IPR011042 ). Каждая лопасть гребного винта состоит из четырех антипараллельных бета-прядей; самая внутренняя ветвь каждой лопасти обозначена цифрой 1, а самая внешняя ветвь - 4. Повторы последовательности смещены относительно лопастей гребного винта, так что любой заданный повтор YWTD с 40 остатками охватывает жилы 24 одной лопасти гребного винта и ветвь 1 гребного винта. последующее лезвие. Это смещение обеспечивает кольцевую форму гребного винта, поскольку последняя нить последнего повтора последовательности действует как самая внутренняя нить 1 лопасти, в которой находятся нити 24 от первого повтора последовательности. Повторение обнаруживается во множестве белков, включая рецептор вителлогенина из Drosophila melanogaster, рецептор липопротеинов низкой плотности (ЛПНП),[1] препроэпидермальный фактор роста и нидоген (энтактин).[2]

LDLR регулирует холестерин гомеостаз в клетках млекопитающих. ЛПНП связывает холестерин-несущие ЛПНП, связывается с клатриновые ямы, и усваивается кислотными эндосомы где он отделяется от своего лиганда. Лиганд разлагается в лизосомы, а рецептор возвращается на поверхность клетки.[3] LDLR имеет несколько доменов. Лиганд-связывающий домен содержит семь повторов класса А рецепторов ЛПНП, каждый с тремя дисульфидными связями и координированным Ca2+ ион. Вторая консервативная область содержит два повтора EGF, за которыми следуют шесть повторов YWTD или рецептора LDL класса B и еще один повтор EGF.[4] Эта консервативная область имеет решающее значение для высвобождения лиганда и рециклирования рецептора.[5]

Рекомендации

  1. ^ Рассел Д. В., Шнайдер В. Дж., Ямамото Т., Браун М. С., Гольдштейн Дж. Л., Дэвис К. Г., Кейси М. Л. (1984). «Рецептор ЛПНП человека: богатый цистеином белок с множественными последовательностями Alu в его мРНК». Клетка. 39 (1): 27–38. Дои:10.1016/0092-8674(84)90188-0. PMID  6091915.
  2. ^ Эк MJ, Springer TA, Blacklow SC, Takagi J, Jeon H, Meng W. (2001). «Последствия для семейной гиперхолестеринемии из структуры пары доменов рецептора LDL YWTD-EGF». Nat. Struct. Биол. 8 (6): 499–504. Дои:10.1038/88556. PMID  11373616.
  3. ^ Браун MS, Гольдштейн JL (1986). «Рецептор-опосредованный путь гомеостаза холестерина». Наука. 232 (4746): 34–47. Дои:10.1126 / science.3513311. PMID  3513311.
  4. ^ Спрингер Т.А. (1998). «Модуль внеклеточного бета-пропеллера, предсказанный в рецепторах липопротеинов и скавенджеров, тирозинкиназах, предшественниках эпидермального фактора роста и компонентах внеклеточного матрикса». J. Mol. Биол. 283 (4): 837–862. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2115. PMID  9790844.
  5. ^ Рассел Д. В., Браун М. С., Гольдштейн Дж. Л., Дэвис К. Г., Судхоф Т. С., Андерсон Р. Г. (1987). «Кислотно-зависимая диссоциация лиганда и рециклинг рецептора LDL, опосредованные областью гомологии фактора роста». Природа. 326 (6115): 760–765. Дои:10.1038 / 326760a0. PMID  3494949.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000033