ARHGAP29 - ARHGAP29

ARHGAP29 это ген расположен на хромосоме 1p22, который кодирует белок, активирующий ГТФазу Rho (GAP) 29,[1] а белок который опосредует циклическую регуляцию малых GTP-связывающих белков, таких как RhoA.[2]

Функция

ARHGAP29 экспрессируется в развивающемся лице и может действовать ниже по течению IRF6 в черепно-лицевом развитии.[3]

Структура

ARHGAP29 содержит четыре домена, включая область спиральной спирали, которая, как известно, взаимодействует с Rap2,[4] домен C1, домен Rho GTPase и небольшая C-концевая область, которая взаимодействует с PTPL1.[2]

Клиническое значение

Локус 1p22, содержащий ARHGAP29, был ассоциирован с несидромными заячья губа / нёбо по общегеномной ассоциации[5] и метаанализ.[6] Последующее исследование[3] идентифицировали редкие варианты кодирования, включая бессмысленный вариант и вариант со сдвигом рамки считывания, у пациентов с несидромными заячья губа / нёбо. Обнаружение роли ARHGAP29 в черепно-лицевом развитии было обнаружено после того, как ABCA4 у гена отсутствовали функциональные данные или данные об экспрессии, чтобы подтвердить его как этиологический ген для несидромных заячья губа / нёбо даже несмотря на то, что SNP в гене ABCA4 были связаны с расщелиной губы / неба.

Рекомендации

  1. ^ Heasman, SJ; Ридли, AJ (2008). «Rho GTPases млекопитающих: новое понимание их функций из исследований in vivo». Нат Рев Мол Cell Biol. 9 (9): 690–701. Дои:10.1038 / nrm2476. PMID  18719708.
  2. ^ а б Сарас, Дж; Franzen, P; Аспенстром, П; Hellman, U; Gonez, LJ; Хелдин, CH (1997). «Новый белок, активирующий ГТФазу для Rho, взаимодействует с доменом PDZ протеин-тирозинфосфатазы PTPL1». J Biol Chem. 272 (39): 24333–24338. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24333. PMID  9305890.
  3. ^ а б Лесли, EJ; Mansilla MA; Biggs LC; Schuette K; Bullard S; Купер М; Dunnwald M; Лидрал АС; Маразита МЛ; Beaty TH; Мюррей JC (2012). «Анализ экспрессии и мутаций указывает на ARHGAP29 как этиологический ген для заячьей губы с локусом волчьей пасти или без него, идентифицированный общегеномной ассоциацией на хромосоме 1p22». Исследование врожденных пороков, часть A: клиническая и молекулярная тератология. 94: 934–942. Дои:10.1002 / bdra.23076. ЧВК  3501616. PMID  23008150.
  4. ^ Myagmar, BE; Умикава, М; Асато, Т; Тайра, К; Оширо, М; Хино, А; Takei, K; Uezato, H; Кария, К. (2005). «PARG1, RhoGAP, связанный с протеин-тирозинфосфатазой, в качестве предполагаемого эффектора Rap2». Biochem Biophys Res Commun. 329 (3): 1046–1052. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.02.069.
  5. ^ Beaty TH, Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I, Hetmanski JB, Liang KY, Wu T, Murray T., Fallin MD, Redett RA, Raymond G, Schwender H, Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M, Mansilla MA , Leslie E, Bullard S, Lidral AC, Moreno LM, Menezes R, Vieira AR, Petrin A, Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H, Ye X, Huang S, Yeow V , Chong SS, Jee SH, Shi B, Christensen K, Melbye M, Doheny KF, Pugh EW, Ling H, Castilla EE, Cheizel AE, Ma L, Field LL, Brody L, Pangilinan F, Mills JL, Molloy AM, Kirke PN, Скотт Дж. М., Аркос-Бургос М., Скотт А. Ф. (2010). «Полногеномное исследование ассоциации заячьей губы с волчьей пастью и без нее выявляет варианты риска рядом с MAFB и ABCA4». Природа Генетика. 42 (6): 525–529. Дои:10,1038 / нг.580. ЧВК  2941216. PMID  20436469.
  6. ^ Людвиг К.Ю., Мангольд Э., Хермс С., Новак С., Ройттер Х., Пауль А., Беккер Дж., Герберц Р., Аль-Чава Т., Нассер Э., Бёмер А.С., Маттейзен М., Альблас М.А., Барт С., Клюк Н., Лаустер К., Брауман Б. , Reich RH, Hemprich A, Pötzsch S, Blaumeiser B, Daratsianos N, Kreusch T., Murray JC, Marazita ML, Ruczinski I, Scott AF, Beaty TH, Kramer FJ, Wienker TF, Steegers-Theunissen RP, Rubini M, Mossey PA , Хоффманн П., Ланге С., Цишон С., Проппинг П., Кнапп М., Нётен М.М. (2012). «Полногеномный метаанализ несиндромной заячьей губы с волчьей пастью или без нее, выявил шесть новых локусов риска». Природа Генетика. 44 (9): 968–971. Дои:10,1038 / нг. 2360. ЧВК  3598617. PMID  22863734.


внешняя ссылка