Семейство холинов актинобактериальных фагов - Actinobacterial phage holin family
В Семейство актинобактериальных фагов холинов (APH) (TC № 1.E.57 ) представляет собой довольно большое семейство белков длиной от 105 до 180 аминоацильных остатков, обычно демонстрирующих единственный трансмембранный сегмент (TMS) около N-конца. Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству APH, можно найти в База данных классификации транспортеров.[1]
Одним из архетипных белков этого семейства является холин Gp5 микобактериофаг Ms6. Микобактериофаг Ms6 представляет собой двухцепочечную ДНК (дцДНК) бактериофаг который, в дополнение к предсказанной системе лизиса эндолизина (LysA) -холина (Gp4), кодирует три дополнительных белка в своем модуле лизиса: Gp1, LysB и Gp5.[2]
Ms6 Gp4 (ТК № 1.Е.18.1.2 ) был ранее описан как холиноподобный белок класса II. Второй предполагаемый ген холина (gp5), кодирующий белок (Gp5) с предсказанным одиночным N-концевым TMS, был идентифицирован в конце литического оперона Ms6. Ни предполагаемый холин класса II, ни отдельный полипептид TMS не могли вызвать лизис в парных комбинациях с эндолизином LysA в кишечная палочка. Однако дальнейшие исследования показали, что Gp4 и Gp5 Ms6 взаимодействуют друг с другом. Это говорит о том, что при инфекции Ms6 правильное и запрограммированное время лизиса достигается за счет комбинированного действия Gp4 и Gp5.[2]
Смотрите также
дальнейшее чтение
- Петровский, Стив; Севиур, Роберт Дж .; Тиллетт, Дэниел (2011). «Характеристика генома поливалентного литического бактериофага GTE2, который имеет потенциал для биоконтроля пены, стабилизированной гордонией, родококком и нокардией, в установках с активированным илом». Прикладная и экологическая микробиология. 77 (12): 3923–3929. Дои:10.1128 / AEM.00025-11. ЧВК 3131622. PMID 21498753.
- Reddy, Bhaskara L .; Сайер-младший, Милтон Х. (2013). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1828 (11): 2654–2671. Дои:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. ЧВК 3788059. PMID 23856191.
- Saier, Milton H .; Редди, Бхаскара Л. (2015). «Холины в бактериях, эукариотах и архее: многофункциональные ксенологи с потенциальным биотехнологическим и биомедицинским применением». Журнал бактериологии. 197 (1): 7–17. Дои:10.1128 / JB.02046-14. ЧВК 4288690. PMID 25157079.
- Wang, I. N .; Smith, D. L .; Янг, Р. (2000). «Холины: белковые часы бактериофаговых инфекций». Ежегодный обзор микробиологии. 54: 799–825. Дои:10.1146 / annurev.micro.54.1.799. PMID 11018145.
Рекомендации
- ^ "1.E.57. Семейство холинов актинобактериальных фагов (APH)". TCDB. Получено 2016-03-29.
- ^ а б Каталао, Мария Жоао; Гил, Филипа; Мониш-Перейра, Хосе; Пиментел, Мадалена (01.06.2011). «Функциональный анализ холиноподобных белков микобактериофага Ms6». Журнал бактериологии. 193 (11): 2793–2803. Дои:10.1128 / JB.01519-10. ISSN 1098-5530. ЧВК 3133122. PMID 21441511.
По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "1.E.57. Семейство холинов актинобактериальных фагов (APH)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.