Элемент стимуляции сдвига рамки считывания антизимной РНК - Antizyme RNA frameshifting stimulation element

Элемент стимуляции сдвига рамки считывания антизимной РНК
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности Antizyme_FSE
Идентификаторы
Символ	Antizyme_FSE
Рфам	RF00381
Прочие данные
РНК тип	Снг; framehift_element
Домен (ы)	Эукариоты
ТАК	ТАК: 0000233
PDB структуры	PDBe

Элемент стимуляции сдвига рамки считывания антизимной РНК это структурный элемент который находится в антизим мРНК и, как известно, способствует сдвиг кадров. Гены антизимов имеют два частично перекрывающихся открытые рамки для чтения, второй, который кодирует функциональный (антизимный) белок, требует сдвига рамки трансляции +1. Этот сдвиг кадра стимулируется псевдоузел присутствует 3 'сайта сдвига рамки в мРНК антизима. Эффективность смены кадров зависит от концентрации полиамины в клетке, когда концентрация полиамина высока, более вероятно возникновение сдвига рамки, что приводит к увеличению количества продуцируемого функционального антизима. Функциональный антизим снижает орнитиндекарбоксилаза (ODC), что приводит к снижению количества полиаминов, присутствующих в клетке. Таким образом, эту семью можно рассматривать как биосенсор для внутриклеточных свободных полиаминов, которые функционируют через петлю отрицательной обратной связи.^[1]

Рекомендации

1. Иванов И.П., Андерсон CB, Гестеланд РФ, Аткинс Дж.Ф. (2004). «Идентификация нового антизимного псевдоузла мРНК +1, изменяющего рамку рамки, в подмножестве различных беспозвоночных и его очевидное отсутствие у промежуточных видов». Дж Мол Биол. 339 (3): 495–504. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.03.082. ЧВК  7125782. PMID  15147837.

внешняя ссылка

• Страница для элемента стимуляции сдвига рамки считывания Antizyme RNA в Рфам