CXorf67 - CXorf67

ЕЖИП
Идентификаторы
ПсевдонимыЕЖИП, открытая рамка считывания 67 хромосомы X, CXorf67, ингибирующий белок EZH, KIP75, CATACOMB
Внешние идентификаторыГенные карты: ЕЖИП
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение EZHIP
Геномное расположение EZHIP
ГруппаXp11.22Начинать51,406,948 бп[1]
Конец51,408,843 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_203407

н / д

RefSeq (белок)

NP_981952

н / д

Расположение (UCSC)Chr X: 51.41 - 51.41 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Неохарактеризованный белок CXorf67 это белок что у людей кодируется CXorf67 ген. Регистрационный номер гена человека - NM_203407.[3] Псевдонимы включают MGC47837 и LOC340602.[4] Ген расположен на положительной цепи Х-хромосомы в Xp11.22.[4] В мРНК 1939 год пар оснований длинный и содержит 1 экзон и нет интроны.[5]

Выражение

«Экспрессия CXorf67 во время преимплантационного эмбрионального развития человека»

Экспрессия CXorf67 у человека обычно низкая во всех тканях. Сообщалось о более высокой экспрессии РНК в семенниках и плаценте, а относительно более высокая экспрессия ядерных белков наблюдалась в плаценте, семенниках и фолликулах яичников.[6]

Протеин

Переведенный человеческий CXorf67 белок 503 аминокислоты в длину.[5] Белок имеет молекулярный вес 51,9 кДал и изоэлектрическая точка из 10.432[7]

Взаимодействия

Белковое взаимодействие CXorf67 с UBC (полиубиквитин-C) у людей было идентифицировано с использованием двухгибридный скрининг.[8] В настоящее время у человека не выявлено никаких других белковых взаимодействий.

Функция

Функция CXorf67 в настоящее время неизвестна, однако слияние CXorf67 с геном MBTD1 было связано с саркомой стромы эндометрия низкой степени злокачественности у людей.[9] Также предполагается, что варианты последовательности хромосомной области Xp11.22 придают человеку предрасположенность к раку простаты.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187690 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Открытая рамка считывания 67 хромосомы X CXorf67 [Homo sapiens (человек)]». NCBI - Национальный центр биотехнологической информации.
  4. ^ а б "Открытая рамка чтения 67 хромосомы X". GeneCards - Справочник генов человека.
  5. ^ а б «Ген CXorf67 человека Homo sapiens, кодирующий открытую рамку считывания 67 хромосомы X». NCBI-AceView.
  6. ^ "CXorf67". Атлас белков человека.
  7. ^ «Верстак биологии». SDSC Biology Workbench. Совет попечителей Иллинойского университета.[постоянная мертвая ссылка ]
  8. ^ Даниэльсен Дж. М., Сильвестерсен КБ, Беккер-Йенсен С., Шкларчик Д., Поульсен Дж. В., Хорн Х., Йенсен Л. Дж., Майланд Н., Нильсен М.Л. (март 2011 г.). «Масс-спектрометрический анализ убиквитилирования лизина выявляет беспорядочные связи на уровне сайта». Молекулярная и клеточная протеомика. 10 (3): M110.003590. Дои:10.1074 / mcp.M110.003590. ЧВК  3047152. PMID  21139048.
  9. ^ Деваэле Б., Пшибил Дж., Кваттрон А, Финалет Феррейро Дж., Ванспаувен В., Герденс Э, Джанфеличи В., Календер З., Возняк А., Моэрман П., Скиот Р., Кроче С., Амант Ф, Ванденберге П., Охлаждающий Дж., Дебик-Рихтер М. (Март 2014 г.). «Идентификация нового рецидивирующего слияния MBTD1-CXorf67 при стромальной саркоме эндометрия низкой степени злокачественности». Международный журнал рака. 134 (5): 1112–1122. Дои:10.1002 / ijc.28440. PMID  23959973.
  10. ^ Гудмундссон Дж., Сулем П., Рафнар Т., Бергторссон Дж. Т., Манолеску А., Гудбьяртссон Д., Агнарссон Б. А., Сигурдссон А., Бенедиктсдоттир К. Р., Блондал Т., Якобсдоттир М., Стейси С. Н., Костич Дж., Кристингисдоттир, Кристингисдоттир, Бриджоттир , Thorlacius S, Thorleifsson G, Zheng SL, Sun J, Chang BL, Elmore JB, Breyer JP, McReynolds KM, Bradley KM, Yaspan BL, Wiklund F, Stattin P, Lindström S, Adami HO, McDonnell SK, Schaid DJ, Cunningham JM, Wang L, Cerhan JR, St Sauver JL, Isaacs SD, Wiley KE, Partin AW, Walsh PC, Polo S, Ruiz-Echarri M, Navarrete S, Fuertes F, Saez B, Godino J, Weijerman PC, Swinkels DW, Aben KK, Witjes JA, Suarez BK, Helfand BT, Frigge ML, Kristjansson K, Ober C, Jonsson E, Einarsson GV, Xu J, Gronberg H, Smith JR, Thibodeau SN, Isaacs WB, Catalona WJ, Mayordomo JI, Kiemeney LA , Barkardottir RB, Gulcher JR, Thorsteinsdottir U, Kong A, Stefansson K (март 2008 г.). «Варианты общей последовательности на 2p15 и Xp11.22 придают предрасположенность к раку простаты». Природа Генетика. 40 (3): 281–283. Дои:10,1038 / нг.89. ЧВК  3598012. PMID  18264098.

внешняя ссылка