Термометр с цианобактериальной РНК - Cyanobacterial RNA thermometer

Термометр Авашорт 5 'UTR
RF02699.svg
Идентификаторы
РфамRF02699
Прочие данные
Домен (ы)Бактерии
ИДТИGO: 0009266,ИДТИ: 0045974
ТАКSO: 0005836,ТАК: 0000204
PDB структурыPDBe
Термометр Avalong 5 'UTR
RF02698.svg
Идентификаторы
РфамRF02698
Прочие данные
Домен (ы)Бактерии
ИДТИGO: 0009266,ИДТИ: 0045974
ТАКSO: 0005836,ТАК: 0000204
PDB структурыPDBe

Первый термометр для цианобактериальной РНК (РНАТ ) Hsp17 был обнаружен в 5'UTR Synechocystis тепловой удар hsp17 мРНК.[1] Дальнейшее исследование показало, что цианобактерии обычно используют RNAT для контроля трансляции своих гены теплового шока. HspA является гомологом Hsp17 в термофильных Thermosynechococcus elongatus. Еще два термометра были обнаружены в 5'UTR мезофильных цианобактерий. A. variabilis и Носток зр. Первый РНАТ позвонил Avashort было показано, что он регулирует перевод путем маскировки сайта начала перевода AUG. Второй РНАТ позвонил лавина, поскольку он имеет расширенную начальную шпильку, может включать третичные взаимодействия и имеет сходство с РОЗА элемент.[2]

Рекомендации

  1. ^ Kortmann J, Sczodrok S, Rinnenthal J, Schwalbe H, Narberhaus F (апрель 2011 г.). «Перевод по запросу простым термодатчиком на основе РНК». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (7): 2855–2868. Дои:10.1093 / nar / gkq1252. ЧВК  3074152. PMID  21131278.
  2. ^ Cimdins A, Klinkert B, Aschke-Sonnenborn U, Kaiser FM, Kortmann J, Narberhaus F (01.01.2014). «Трансляционный контроль малых генов теплового шока у мезофильных и термофильных цианобактерий с помощью РНК-термометров». РНК Биология. 11 (5): 594–608. Дои:10.4161 / rna.28648. ЧВК  4152365. PMID  24755616.