Дэвид Бартель - David Bartel

Дэвид П. Бартель
НациональностьАмериканец
Альма-матерГошенский колледж, Гарвардский университет
ИзвестенМикроРНК
НаградыGrand Prix scientifique de la Fondation Louis D.(2005)
Премия NAS в области молекулярной биологии (2005)
Научная карьера
ПоляБиохимия, Молекулярная биология
УчрежденияИнститут Уайтхеда, Массачусетский Институт Технологий
ДокторантДжек Шостак

Дэвид П. Бартель американский молекулярный биолог, наиболее известный своей работой над микроРНК. Бартель - это Профессор из Биология на Массачусетский Институт Технологий, Член Институт Уайтхеда, и следователь Медицинский институт Говарда Хьюза (HHMI).

биография

Бартель заслужил свое Б.А. степень в области Биология из Гошенский колледж в 1982 году и его Кандидат наук. степень в области Вирусология из Гарвардский университет в 1993 г. под руководством Джек В. Шостак.[1]

Находясь в лаборатории Шостака, Бартель выделил первые рибозимы непосредственно из случайной последовательности, используя in vitro эволюция (среди них лигаза I класса).[2] После того, как он стал независимым в Институте Уайтхеда, он развил этот рибозим, чтобы он функционировал как РНК-зависимая РНК-полимераза для расширения праймеров на внешние РНК-матрицы, поддерживая теорию «мира РНК».[3][4]

Позже Бартель сместил свои исследования в сторону биологии микроРНК и, в частности, на понимание их регуляторных функций.[5] МикроРНК представляют собой короткие фрагменты РНК длиной около 22 нуклеотидов, которые подавляют экспрессию генов за счет подавления информационные РНК (мРНК). Его лаборатория была одной из трех, которые обнаружили, что у животных есть много таких малых регуляторных РНК,[6][7][8] и он был первым, кто описал микроРНК в растениях.[9][10] Работая с микроРНК, он разработал методологию, которая прогнозирует их регуляторные цели, и создал веб-инструмент. TargetScan, что делает эти прогнозы доступными для исследовательского сообщества.[11][12][13][14][15] Его исследование также показало, что большинство мРНК человека регулируются микроРНК и что микроРНК преимущественно действуют, снижая уровни своих мРНК-мишеней.[13][16]

Бартель также открыл несколько других типов регуляторных РНК, включая гетерохроматические миРНК, которые заглушают ДНК вместо РНК.[17] Кроме того, Бартел изучает роль длинных некодирующих РНК (lncRNAs) и то, как нетранслируемые области и хвосты мРНК задействуют и опосредуют регуляторные явления.[5]

Бартел является основателем и научным консультантом Alnylam Pharmaceuticals, компании, основанной в 2002 году с целью продвижения «терапии РНКи (РНК-интерференция) как нового класса инновационных лекарств».[18]

В 2006 году Бартель занял второе место по версии Thomson Reuters в рейтинге цитируемости в области молекулярной биологии / генетики, получил несколько наград и был избран в Национальная Академия Наук в 2011.[19]

Рекомендации

  1. ^ "Дэвид П. Бартель '82". Бюллетень Гошен. 2007. Получено 8 марта 2014.
  2. ^ Наука. 1993 10 сентября; 261 (5127): 1411-8. "Выделение новых рибозимов из большого пула случайных последовательностей. "Бартель Д.П., Шостак JW.
  3. ^ Trends Cell Biol. 1999 декабрь; 9 (12): M9-M13. "Построение мира РНК. "Бартель Д.П., Унрау П.Дж.
  4. ^ Johnston, WK; Unrau, PJ; Лоуренс, MS; Glasner, ME; Бартель, Д.П. (18 мая 2001 г.). «Катализируемая РНК полимеризация РНК: точное и общее расширение праймера на основе шаблонов РНК». Наука. 292 (5520): 1319–25. Bibcode:2001Sci ... 292.1319J. CiteSeerX  10.1.1.70.5439. Дои:10.1126 / science.1060786. PMID  11358999. S2CID  14174984.
  5. ^ а б "Давид Бартель". HHMI. Получено 7 октября 2016.
  6. ^ "Наука". 2001 26 октября; 294 (5543): 853-8. «Идентификация новых генов, кодирующих небольшие экспрессируемые РНК». Лагос-Кинтана M1, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T.
  7. ^ "Наука". 2001 26 октября; 294 (5543): 858-62. "Обильный класс крошечных РНК с вероятной регуляторной ролью у Caenorhabditis elegans. »Лау NC1, Лим Л.П., Вайнштейн Э.Г., Бартель Д.П.
  8. ^ "Наука". 2001 26 октября; 294 (5543): 862-4. "Обширный класс малых РНК у Caenorhabditis elegans. Ли RC1, Амброс В.
  9. ^ "Genes Dev." 2002, 1 июля; 16 (13): 1616-26. "МикроРНК в растениях. »Рейнхарт BJ1, Вайнштейн Э.Г., Родес М.В., Бартель Б., Бартель Д.П.
  10. ^ "Клетка". 2002, 23 августа; 110 (4): 513-20 ».Прогнозирование мишеней микроРНК растений. »Роудс MW1, Рейнхарт Б.Дж., Лим LP, Бердж CB, Бартель Б., Бартель Д.П.
  11. ^ "Клетка". 2005 14 января; 120 (1): 15-20. "Консервативное спаривание семян, часто фланкированное аденозинами, указывает на то, что тысячи генов человека являются мишенями для микроРНК.. »Льюис Б.П., Бердж CB, Бартель Д.П.
  12. ^ «Мол Cell». 6 июля 2007 г.; 27 (1): 91-105. "Нацеленная специфичность микроРНК у млекопитающих: детерминанты, выходящие за рамки спаривания семян. »Гримсон А1, Фар К.К., Джонстон В.К., Гарретт-Энджеле П., Лим LP, Бартель Д.П.
  13. ^ а б "Genome Res." 2009 Янв; 19 (1): 92-105. "Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями для микроРНК.. »Фридман RC1, Фарх К.К., Бердж CB, Бартель Д.П.
  14. ^ Агарвал, Викрам; Белл, Джордж В .; Нам, Джин-Ву; Бартель, Дэвид П. (2015-08-12). «Предсказание эффективных сайтов-мишеней микроРНК в мРНК млекопитающих». eLife. 4: e05005. Дои:10.7554 / eLife.05005. ISSN  2050-084X. ЧВК  4532895. PMID  26267216.
  15. ^ Agarwal, V; Субтельный, АО; Thiru, P; Улицкий, я; Бартель, Д.П. (4 октября 2018 г.). «Прогнозирование эффективности нацеливания на микроРНК у дрозофилы». Геномная биология. 19 (1): 152. Дои:10.1186 / s13059-018-1504-3. ЧВК  6172730. PMID  30286781.
  16. ^ Guo, H; Инголия, Северная Каролина; Weissman, JS; Бартель, Д.П. (12 августа 2010 г.). «МикроРНК млекопитающих преимущественно снижают уровни целевой мРНК». Природа. 466 (7308): 835–40. Bibcode:2010Натура.466..835Г. Дои:10.1038 / природа09267. ЧВК  2990499. PMID  20703300.
  17. ^ Рейнхарт, Б. Дж.; Бартель, Д.П. (13 сентября 2002 г.). «Малые РНК соответствуют центромерным гетерохроматическим повторам». Наука. 297 (5588): 1831. Дои:10.1126 / science.1077183. PMID  12193644. S2CID  42288846.
  18. ^ «Научно-консультативный совет». Alnylam.com. Получено 5 октября 2016.
  19. ^ «Член Уайтхеда Дэвид Бартель избран в Национальную академию наук». Получено 25 января 2015.

внешняя ссылка