Десульфоспоросинус - Desulfosporosinus

Десульфоспоросинус
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Учебный класс:
Clostridia
Заказ:
Clostridiales
Семья:
Peptococcaceae
Род:
Десульфоспоросинус

Stackebrandt и другие. 1997[1] исправить. Вацурина и другие. 2008[2]
Разновидность

D. acididurans
D. acidiphilus
D. auripigmenti
D. burensis
D. hippei
D. lacus
D. meridiei
D. orientis
D. youngiae

Десульфоспоросинус это род строго анаэробных, сульфатредуцирующие бактерии, часто встречается в почва.

В типовой вид D. orientis был изолирован в 1959 г.[3] с предложенным именем Десульфовибрион восточный, а позже был отнесен к роду Desulfotomaculum.[4] На основе 16S рРНК данные последовательности генов Desulfotomaculum orientis был реклассифицирован как Desulfosporosinus orientis в 1997 г.[1]

Разновидность

Этот список неполный; вы можете помочь добавление недостающих предметов с надежные источники.
РазновидностьТип штаммаИзолированный отПримечанияРекомендации
D. acididuransM1 (DSM 27692 )Кислый осадокумеренно ацидофильный[5]
D. acidiphilusSJ4 (DSM 22704 )Кислотный осадок шахтного дренажаумеренно ацидофильный[6]
D. auripigmentiОРЕКС-4 (DSM 13351 )Пресноводный осадок([7]) [8]
D. burensisBSREI1 (DSM 24089 )Скважина[9]
D. hippei343 (DSM 8344 )Вечномерзлый грунт[2]
D. lacusSTP12 (DSM 15449 )Пресноводный осадок[10]
D. meridieiS10 (DSM 13257 )Загрязненные газолином грунтовые воды[11]
D. orientisСингапур I (DSM 765 )Почва([3][4]) [1]
D. youngiaeJW / YJL-B18 (DSM 17734 )Построенные водно-болотные угодья / дренаж кислых отложений[12]

Геномы

Пять полных Десульфоспоросинус доступны геномы, а еще два генома находятся в процессе секвенирования.

НапряжениеПоложение делГодРегистрационный номерРекомендации
D. acididurans M1Опубликованный черновик2015LDZY00000000[13]
D. acidiphilus SJ4Завершено и опубликовано2012CP003639[14]
D. meridiei S10Завершено и опубликовано2012CP003629[14]
D. orientis Сингапур IЗавершено и опубликовано2011CP003108[14]
D. sp. ОТЗавершено и опубликовано2011AGAF00000000[15]
D. youngiae JW / YJL-B18Завершено и опубликовано2011CM001441[14]

Рекомендации

  1. ^ а б c Stackebrandt, E; C Sproer; Ф. А. Рейни; Дж. Бургхардт; О Пойкер! H Hippe (1997). «Филогенетический анализ рода Desulfotomaculum: доказательства ошибочной классификации Desulfotomaculum guttoideum и описание Desulfotomaculum orientis в качестве Desulfosporosinus orientis ген. нов., греб. ноя ". Международный журнал систематической бактериологии. 47 (4): 1134–1139. Дои:10.1099/00207713-47-4-1134. PMID  9336920.
  2. ^ а б Вацурина, А; Д Бадрутдинова; П. Шуман; S Весна; М. Вайнштейн (2008). "Desulfosporosinus hippei sp. nov., мезофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из вечной мерзлоты ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 58 (5): 1228–1232. Дои:10.1099 / ijs.0.65368-0. PMID  18450718.
  3. ^ а б Адамс, Мэри Э; Дж. Р. Постгейт (1959). «Новый сульфатредуцирующий вибрион». Журнал общей микробиологии. 20 (2): 252–257. Дои:10.1099/00221287-20-2-252.
  4. ^ а б Кэмпбелл, L L; Дж. Р. Постгейт (1965). «Классификация спорообразующих сульфатредуцирующих бактерий». Бактериологические обзоры. 29 (3): 359–363.
  5. ^ Санчес-Андреа, Ирен; Альфонс Дж. М. Стамс; Сабрина Хедрих; Иван Чанкучео; Д. Барри Джонсон (2014). "Desulfosporosinus acididurans sp. nov .: ацидофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из кислых отложений ». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях. 19: 39–47. Дои:10.1007 / s00792-014-0701-6.
  6. ^ Алазар, Дидье; Манон Джозеф; Фабьен Батталья-Брюне; Жан-Люк Кайоль; Бернар Оливье (2010). "Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov .: умеренно ацидофильная сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из кислых дренажных отложений ». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях. 14 (3): 305–312. Дои:10.1007 / s00792-010-0309-4.
  7. ^ Ньюман, Дайан К .; Эрин К. Кеннеди; Джон Д. Коутс; Дайан Ахманн; Дебра Дж. Эллис; Дерек Р. Ловли; Франсуа М. М. Морель (1997). "Диссимиляционное восстановление арсената и сульфата в Desulfotomaculum auripigmentum sp. ноя ". Архив микробиологии. 168 (5): 380–388. Дои:10.1007 / s002030050512.
  8. ^ Стакебрандт, Эрко; Питер Шуман; Эстер Шюлер; Ханс Хиппе (2003). "Реклассификация Desulfotomaculum auripigmentum в качестве Desulfosporosinus auripigmenti корриг., греб. ноя ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 53 (5): 1439–1443. Дои:10.1099 / ijs.0.02526-0. PMID  13130030.
  9. ^ Майе, Бруно; Мари-Лор Фардо; Манон Бартоли-Джозеф; Лори Казало; Аньес Винсо; Марк Лабат (2012). "Desulfosporosinus burensis sp. nov .: спорообразующая, мезофильная, сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из глубокой глинистой среды ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 63: 593–598. Дои:10.1099 / ijs.0.035238-0. PMID  22544786.
  10. ^ Рамамурти, S; H Sass; H Langner; П. Шуман; Р. М. Кроппенштедт; S Весна; Дж. Оверманн; Р. Ф. Розенцвейг (2006). "Desulfosporosinus lacus sp. nov., сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из нетронутых пресноводных озерных отложений ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 56 (12): 2729–2736. Дои:10.1099 / ijs.0.63610-0. PMID  17158969.
  11. ^ Робертсон, В. Дж .; Дж. П. Боуман; П. Д. Францманн; Би Джей Ми (2001). "Desulfosporosinus meridiei sp. nov., спорообразующая сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из загрязненных газолином грунтовых вод ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (1): 133–140. Дои:10.1099/00207713-51-1-133. PMID  11211250.
  12. ^ Ли, Ён-Джин; Кристофер С. Романек; Юрген Вигель (2009). "Desulfosporosinus youngiae sp. nov., спорообразующая сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из построенного водно-болотного угодья, обрабатывающего кислые дренажные системы шахт ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 59 (11): 2743–2746. Дои:10.1099 / ijs.0.007336-0. PMID  19625426.
  13. ^ Петч, Патрик; Похлейн, Аня; Джонсон, Д. Барри; Даниэль, Рольф; Шлеманн, Михаэль; Мюлинг, Мартин (2015). «Последовательность генома умеренно ацидофильного сульфатредуцирующего вещества FirmicuteDesulfosporosinus acididurans (штамм M1T)». Анонсы генома. 3 (4): e00881-15. Дои:10.1128 / genomeA.00881-15. ISSN  2169-8287. ЧВК  4541271. PMID  26251501.
  14. ^ а б c d Пестер, Майкл; Эвелин Брамбилла; Дидье Алазар; Томас Раттей; Томас Вайнмайер; Джеймс Хан; Сьюзан Лукас; Алла Лапидус; Ян-Фанг Ченг; Линн Гудвин; Сэм Питлак; Лин Петерс; Галина Овчинникова; Хадзуки Тешима; Джон К. Деттер; Клифф С. Хан; Роксана Тапиа; Мириам Л. Лэнд; Лорен Хаузер; Никос С. Кирпидес; Наталья Н. Иванова; Иоанна Пагани; Марсель Хантманн; Чиа-Линь Вэй; Карен В. Давенпорт; Хайналка Далиго; Patrick S.G. Chain; Эми Чен; Константинос Мавроматис; Виктор Марковиц; Эрнест Сзето; Наталья Михайлова; Амрита Пати; Майкл Вагнер; Таня Войке; Бернар Оливье; Ханс-Петер Кленк; Стефан Спринг; Александр Лой (2012). "Полные последовательности генома Desulfosporosinus orientis DSM765Т, Desulfosporosinus youngiae DSM17734Т, Desulfosporosinus meridiei DSM13257Т, и Desulfosporosinus acidiphilus DSM22704Т". Журнал бактериологии. 194 (22): 6300–6301. Дои:10.1128 / JB.01392-12. ЧВК  3486391. PMID  23105050.
  15. ^ Abicht, Helge K .; Стефано Манчини; Ольга Васильевна Карначук; Марк Солиоз (2011). «Последовательность генома Desulfosporosinus sp. OT, ацидофильной сульфатредуцирующей бактерии из отходов медной добычи в Норильске, Северная Сибирь». Журнал бактериологии. 193 (21): 6104–6105. Дои:10.1128 / JB.06018-11. ЧВК  3194917. PMID  21994931.

внешняя ссылка