Таксономия (биология) - Taxonomy (biology)

Для использования в других целях см. Таксономия (значения).
«Научная классификация» перенаправляется сюда. Для использования в других целях см. Научная классификация (значения).
Эта статья о биологии. Для получения информации о чучелах и посадке животных см. Таксидермия.

Часть серии по
Эволюционная биология
Зяблики Дарвина, автор Gould.jpg

В биология, таксономия (из Древнегреческий τάξις (Таксис ) 'аранжировка' и -νομία (-номия ) 'метод ') это научный изучение наименования, определения (ограничивающий ) и классификации групп биологических организмы на основе общих характеристик. Организмы сгруппированы в таксоны (единственное число: таксон), и этим группам дается таксономический ранг; группы данного ранга могут быть объединены в супергруппу более высокого ранга, создавая таким образом таксономическую иерархию. Основные ранги в современном использовании: домен, Королевство, филюм (разделение иногда используется в ботанике вместо филума), учебный класс, порядок, семья, род, и разновидность. Шведский ботаник Карл Линней считается основателем нынешней системы таксономии, поскольку он разработал систему, известную как Линнеевская таксономия для классификации организмов и биноминальная номенклатура для наименования организмов.

С появлением таких областей науки, как филогенетика, кладистика, и систематика система Линнея превратилась в систему современной биологической классификации, основанную на эволюционный отношения между организмами, как живыми, так и вымершими.

Определение

Точное определение таксономии варьируется от источника к источнику, но суть дисциплины остается: концепция, наименование и классификация групп организмов.[1] В качестве ориентира ниже представлены недавние определения таксономии:

  1. Теория и практика группирования особей в виды, объединения видов в более крупные группы и присвоения этим группам названий, таким образом производя классификацию.[2]
  2. Область науки (и главный компонент систематика ), который включает описание, идентификацию, номенклатуру и классификацию[3]
  3. Наука классификации, в биологии расположение организмов в классификации[4]
  4. «Наука о классификации применительно к живым организмам, включая изучение способов образования видов и т. Д.»[5]
  5. «Анализ характеристик организма с целью классификации»[6]
  6. "Систематика исследования филогения чтобы предоставить шаблон, который можно перевести в классификацию и названия более всеобъемлющей области таксономии "(внесено в список желательных, но необычных определений)[7]

Разнообразные определения либо помещают таксономию как подобласть систематики (определение 2), либо инвертируют эту связь (определение 6), либо, кажется, считают эти два термина синонимичными. Есть некоторые разногласия относительно того, биологическая номенклатура считается частью таксономии (определения 1 и 2) или частью систематики вне таксономии.[8] Например, определение 6 сочетается со следующим определением систематики, которое выводит номенклатуру за пределы таксономии:[6]

  • Систематика: «Изучение идентификации, таксономии и номенклатуры организмов, включая классификацию живых существ с учетом их естественных взаимоотношений, а также изучение вариаций и эволюции таксонов».

Полный набор терминов, включая таксономию, систематическая биология, систематика, биосистематика, научная классификация, биологическая классификация и филогенетика иногда имели перекрывающиеся значения - иногда одинаковые, иногда немного разные, но всегда связанные и пересекающиеся.[1][9] Здесь используется самое широкое значение слова «таксономия». Сам термин был введен в 1813 г. de Candolle, в его Теория élémentaire de la botanique.[10]

Монография и таксономическая редакция

А таксономическая ревизия или же таксономический обзор представляет собой новый анализ паттернов вариаций в конкретном таксон. Этот анализ может быть выполнен на основе любой комбинации различных доступных типов признаков, таких как морфологические, анатомические, палинологические, биохимические и генетические. А монография или полная редакция - это пересмотр, который является исчерпывающим для таксона в отношении информации, предоставленной в определенное время и для всего мира. Другие (частичные) версии могут быть ограничены в том смысле, что они могут использовать только некоторые из доступных наборов символов или иметь ограниченный пространственный диапазон. Пересмотр приводит к согласованию или новому пониманию взаимосвязей между субтаксонами в рамках изучаемого таксона, что может привести к изменению классификации этих субтаксов, идентификации новых субтаксов или слиянию предыдущих субтаксов.[11]

Таксономия альфа и бета

Не путать с Альфа-разнообразие.

Период, термин "альфа-таксономия"в основном используется сегодня для обозначения дисциплины поиска, описания и присвоения имен таксоны, особенно виды.[12] В более ранней литературе этот термин имел другое значение, относящееся к морфологической таксономии и результатам исследований конца XIX века.[13]

Уильям Бертрам Террилл ввел термин «альфа-таксономия» в серии статей, опубликованных в 1935 и 1937 гг., в которых он обсуждал философию и возможные будущие направления таксономии.[14]

... среди систематиков растет желание рассматривать свои проблемы с более широких точек зрения, исследовать возможности более тесного сотрудничества со своими цитологическими, экологическими и генетическими коллегами и признать, что некоторый пересмотр или расширение, возможно, радикального характера, их целей и методов, может быть желательным ... Turrill (1935) предположил, что, принимая старую бесценную таксономию, основанную на структуре и удобно обозначенную как "альфа", можно увидеть далекую таксономию, основанную на как можно более широкую основу морфологических и физиологических фактов, и такую, в которой «найдется место для всех данных наблюдений и экспериментов, относящихся, даже если косвенно, к конституции, подразделению, происхождению и поведению видов и других таксономических групп». Можно сказать, что идеалы никогда не могут быть реализованы полностью. Однако они обладают огромной ценностью действовать как постоянные стимуляторы, и если у нас есть какой-то, даже нечеткий, идеал таксономии «омега», мы можем немного продвинуться вниз по греческому алфавиту. Некоторые из нас радуют себя, думая, что сейчас мы нащупываем таксономию «бета».[14]

Таким образом, Туррилл явно исключает из альфа-таксономии различные области исследования, которые он включает в таксономию в целом, такие как экология, физиология, генетика и цитология. Далее он исключает филогенетическую реконструкцию из альфа-таксономии (стр. 365–366).

Более поздние авторы использовали этот термин в другом смысле, чтобы обозначить определение границ видов (не подвидов или таксонов других рангов), используя любые доступные исследовательские методы, включая сложные вычислительные или лабораторные методы.[15][12] Таким образом, Эрнст Майр в 1968 г. определил "бета-таксономия"как классификация рангов выше видов.[16]

Понимание биологического значения изменчивости и эволюционного происхождения групп родственных видов еще более важно для второго этапа таксономической деятельности, разделения видов на группы родственников («таксонов») и их расположения в иерархии высшие категории. Эту деятельность обозначает термин «классификация»; ее также называют «бета-таксономией».

Микротаксономия и макротаксономия

Основная статья: Видовая проблема

То, как должны быть определены виды в определенной группе организмов, порождает практические и теоретические проблемы, которые называются проблема вида. Научная работа по определению видов называется микротаксономией.[17][18][12] В более широком смысле, макротаксономия - это изучение групп на высшем уровне. таксономические ранги подрод и выше.[12]

История

В то время как некоторые описания таксономической истории пытаются датировать таксономию древними цивилизациями, по-настоящему научная попытка классификации организмов не предпринималась до 18 века. Ранние работы были в основном описательными и касались растений, которые были полезны в сельском хозяйстве или медицине. В этом научном мышлении есть несколько этапов. Ранняя таксономия основывалась на произвольных критериях, так называемых «искусственных системах», включая систему половой классификации Линнея. Позже появились системы, основанные на более полном рассмотрении характеристик таксонов, названных «естественными системами», такими как системы de Jussieu (1789), де Кандоль (1813) и Бентам и Хукер (1862–1863). Это были до-эволюционный в мышлении. Публикация Чарльз Дарвин с О происхождении видов (1859) привел к новым взглядам на классификацию, основанную на эволюционных отношениях. Это была концепция филетический систем, начиная с 1883 года. Типичным примером этого подхода были подходы Эйхлер (1883) и Энглер (1886–1892). Появление молекулярная генетика и статистическая методология позволили создать современную эпоху «филогенетических систем» на основе кладистика, скорее, чем морфология один.[19][страница нужна ][20][страница нужна ][21][страница нужна ]

Предлиннеевский

Ранние систематики

Имена и классификация нашего окружения, вероятно, имели место с тех пор, пока человечество могло общаться. Всегда было важно знать названия ядовитых и съедобных растений и животных, чтобы передать эту информацию другим членам семьи или группы. Иллюстрации лекарственных растений появляются на египетских настенных росписях ок. 1500 г. до н.э., что указывает на понимание использования различных видов и наличие базовой систематики.[22]

Древние времена

Дальнейшая информация: Биология Аристотеля § Классификация
Описание редких животных (写生 珍禽 图), автор: Династия Сун художник Хуан Цюань (903–965)

Организмы были впервые классифицированы Аристотель (Греция, 384–322 гг. До н.э.) во время пребывания на Остров Лесбос.[23][24][25] Он классифицировал существа по их частям, или в современных терминах атрибуты, например, живорождение, наличие четырех ног, откладывание яиц, наличие крови или теплоту.[26] Он разделил все живое на две группы: растения и животных.[24] Некоторые из его групп животных, такие как Anhaima (животные без крови, переводится как беспозвоночные ) и Энхайма (животные с кровью, примерно позвоночные ), а также такие группы, как акулы и китообразные, до сих пор широко используются.[27] Его ученик Теофраст (Греция, 370–285 гг. До н.э.) продолжил эту традицию, упомянув около 500 растений и их использование в своих работах. Historia Plantarum. Опять же, несколько групп растений, все еще признанных в настоящее время, восходят к Теофрасту, например, Cornus, Крокус, и Нарцисс.[24]

Средневековый

Таксономия в Средний возраст во многом основывался на Аристотелевская система,[26] с дополнениями, касающимися философского и экзистенциального порядка существ. Это включало такие концепции, как Великая цепочка бытия в западных схоластический традиция[26] снова происходящее в конечном счете от Аристотеля. Аристотелевская система не классифицировала растения или грибы из-за отсутствия микроскопа в то время.[25] поскольку его идеи были основаны на организации всего мира в едином континууме, согласно scala naturae (Естественная лестница).[24] Это тоже принималось во внимание в Великой цепи бытия.[24] Успехи были достигнуты такими учеными, как Прокопий, Тимофей из Газы, Деметриос Пепагоменос, и Фома Аквинский. Средневековые мыслители использовали абстрактные философские и логические классификации, более подходящие для абстрактной философии, чем для прагматической систематики.[24]

Ренессанс и ранний модерн

Вовремя эпоха Возрождения, то Возраст разума, и Просвещение, категоризация организмов стала более распространенной,[24]таксономические работы стали достаточно масштабными, чтобы заменить древние тексты. Иногда это приписывают разработке сложных оптических линз, которые позволили изучать морфологию организмов гораздо более подробно. Одним из первых авторов, воспользовавшихся этим технологическим скачком, был итальянский врач. Андреа Чезальпино (1519–1603), которого называли «первым систематиком».[28] Его magnum opus Де Плантис вышла в 1583 году и описала более 1500 видов растений.[29][30] Два больших семейства растений, которые он впервые обнаружил, все еще используются сегодня: Сложноцветные и Brassicaceae.[31] Затем в 17 веке Джон Рэй (Англия, 1627–1705) написал много важных таксономических работ.[25] Возможно, его величайшим достижением было Methodus Plantarum Nova (1682),[32] в котором он опубликовал подробную информацию о более чем 18 000 видов растений. В то время его классификации были, пожалуй, самыми сложными, из когда-либо созданных любым систематиком, поскольку он основывал свои таксоны на множестве комбинированных признаков. Следующие основные таксономические работы были выполнены Джозеф Питтон де Турнефор (Франция, 1656–1708 гг.).[33] Его работы с 1700 г., Institutiones Rei Herbariae, включал более 9000 видов в 698 родов, что напрямую повлияло на Линнея, поскольку это был текст, который он использовал в молодости.[22]

Линнеевская эпоха

Основная статья: Линнеевская таксономия
Титульный лист Systema Naturae, Лейден, 1735 г.

Шведский ботаник Карл Линней (1707–1778)[26] открыли новую эру таксономии. С его основными работами Systema Naturae 1-е издание 1735 г.,[34] Виды Plantarum в 1753 г.,[35] и Systema Naturae 10-е издание,[36] он произвел революцию в современной таксономии. В его работах реализована стандартизированная биномиальная система именования видов животных и растений,[37] который оказался изящным решением хаотичной и неорганизованной таксономической литературы. Он не только ввел стандарт класса, порядка, рода и вида, но также дал возможность идентифицировать растения и животных из своей книги, используя меньшие части цветка.[37] Таким образом Линнея система родился и до сих пор используется по существу так же, как и в 18 веке.[37] В настоящее время систематики растений и животных рассматривают работу Линнея как «отправную точку» для правильных названий (в 1753 и 1758 годах соответственно).[38] Имена, опубликованные до этих дат, называются «долиннеевскими» и не считаются действительными (за исключением пауков, опубликованных в Svenska Spindlar[39]). Даже таксономические названия, опубликованные самим Линнеем до этих дат, считаются предлиннеевскими.[22]

Современная система классификации

Основные статьи: Эволюционная таксономия и Филогенетическая номенклатура
Эволюция позвоночные на уровне класса - ширина шпинделей, указывающая количество семейств. Схемы шпинделя типичны для эволюционная таксономия
Те же отношения, выраженные как кладограмма типично для кладистика

В то время как Линней стремился просто создать легко идентифицируемые таксоны, идея Линнеевская таксономия как перевод в своего рода дендрограмма животных и растений королевства был сформулирован ближе к концу 18 века, задолго до О происхождении видов был опубликован.[25] Среди ранних работ, исследующих идею трансмутация видов мы Эразм Дарвин 1796 год Зоономия и Жан-Батист Ламарк с Philosophie Zoologique 1809 г.[12] Идея была популяризирована в англоязычном мире спекулятивными, но широко читаемыми Остатки естественной истории творения, анонимно опубликовано Роберт Чемберс в 1844 г.[40]

С теорией Дарвина быстро появилось общее признание того, что классификация должна отражать дарвиновский принцип общее происхождение.[41] Дерево жизни представления стали популярными в научных работах, включая известные группы ископаемых. Одной из первых современных групп, связанных с ископаемыми предками, была птицы.[42] Используя недавно обнаруженные окаменелости Археоптерикс и Гесперорнис, Томас Генри Хаксли объявили, что они произошли от динозавров, группы, официально названной Ричард Оуэн в 1842 г.[43][44] Полученное в результате описание динозавров, «породивших» птиц или являющихся «предками» птиц, является основным признаком эволюционная таксономия мышление. Поскольку все больше и больше групп окаменелостей было обнаружено и признано в конце 19 - начале 20 веков, палеонтологи работал, чтобы понять историю животных на протяжении веков, объединив известные группы.[45] С современный эволюционный синтез В начале 1940-х годов существовало по существу современное понимание эволюции основных групп. Поскольку эволюционная таксономия основана на таксономических рангах Линнея, в современном использовании эти два термина в значительной степени взаимозаменяемы.[46]

В кладистический Метод появился с 1960-х годов.[41] В 1958 г. Джулиан Хаксли использовал термин клад.[12] Позже, в 1960 году, Каин и Харрисон ввели термин кладистический.[12] Отличительной особенностью является иерархическая организация таксонов. эволюционное дерево, игнорируя звания.[41] Таксон называется монофилетическим, если он включает всех потомков предковой формы.[47][48] Группы, из которых удалены дочерние группы, называются парафилетический,[47] в то время как группы, представляющие более одной ветви древа жизни, называются полифилетический.[47][48] В Международный кодекс филогенетической номенклатуры или же Филокод предназначен для регулирования формального наименования клады.[49][50] Линнеевские ранги будут необязательными при Филокод, который предназначен для сосуществования с текущими кодами на основе рангов.[50]

Королевства и владения

Базовая схема современной классификации. Можно использовать многие другие уровни; домен, высший уровень в жизни, является новым и спорным.
Основная статья: Королевство (биология)

Задолго до Линнея растения и животные считались отдельными царствами.[51] Линней использовал это как высший ранг, разделив физический мир на царства растений, животных и минералов. По мере того, как достижения в области микроскопии сделали возможной классификацию микроорганизмов, число царств увеличилось, причем системы из пяти и шести царств были наиболее распространенными.

Домены - относительно новая группа. Впервые предложено в 1977 г. Карл Вёзе с трехдоменная система не было общепринятым позже.[52] Одной из основных характеристик трехдоменного метода является разделение Археи и Бактерии, ранее сгруппированные в единое царство бактерий (царство, также иногда называемое Monera ),[51] с Эукариоты для всех организмов, клетки которых содержат ядро.[53] Небольшое количество ученых включает шестое царство, Археи, но не принимает доменный метод.[51]

Томас Кавалье-Смит, который много публиковал по классификации протисты, недавно предложил, чтобы Неомура, клада, объединяющая архей и Эукария, произошли от бактерий, точнее от Актинобактерии. Его классификация 2004 года относилась к археобактерии как часть субцарства королевства Бактерии, то есть он полностью отверг трехдоменную систему.[54] Стефан Лукета в 2012 году предложил систему пяти «доминионов», добавив: Прионобиота (бесклеточный и без нуклеиновой кислоты) и Вирусобиота (бесклеточный, но с нуклеиновой кислотой) к традиционным трем доменам.[55]

Линней
1735[56]		Геккель
1866[57]		Chatton
1925[58]		Copeland
1938[59]		Whittaker
1969[60]		Woese и другие.
1990[61]		Кавалер-Смит
1998[54]		Кавалер-Смит
2015[62]
2 королевства3 королевства2 империи4 королевства5 королевств3 домена2 империи, 6 королевств2 империи, 7 королевств
(не лечится)ПротистаПрокариотаMoneraMoneraБактерииБактерииБактерии
АрхеиАрхеи
ЭукариотыПротоктистаПротистаЭукарияПростейшиеПростейшие
ChromistaChromista
VegetabiliaPlantaePlantaePlantaePlantaePlantae
ГрибыГрибыГрибы
AnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimalia
Основная статья: Царство (биология) § Резюме

Последние всеобъемлющие классификации

Для многих отдельных групп организмов существуют частичные классификации, которые пересматриваются и заменяются по мере поступления новой информации; однако исчерпывающие опубликованные исследования большей части или всей жизни встречаются реже; недавние примеры - это Adl et al., 2012 и 2019,[63][64] который охватывает только эукариот с акцентом на протистов, а Ruggiero et al., 2015,[65] охватывающих как эукариот, так и прокариоты в ранг Ордена, хотя оба исключают ископаемых представителей.[65] Отдельная компиляция (Ruggiero, 2014)[66] охватывает дошедшие до нас таксоны до ранга семейства. Другие методы лечения, основанные на базе данных, включают Энциклопедия жизни, то Глобальный информационный фонд по биоразнообразию, то База данных таксономии NCBI, то Временный реестр морских и неморских родов, то Открытое Древо Жизни, а Каталог Жизни. В База данных палеобиологии это источник окаменелостей.

Заявление

Биологическая таксономия - это дисциплина биология, и обычно практикуется биологами, известными как "систематики", хотя и с энтузиазмом натуралисты также часто участвуют в публикации новых таксонов.[67] Поскольку таксономия направлена ​​на описание и организацию жизнь, работа систематиков важна для изучения биоразнообразие и результирующее поле биология сохранения.[68][69]

Классификация организмов

Основная статья: Таксономический ранг

Биологическая классификация - важнейший компонент таксономического процесса. В результате он информирует пользователя о предполагаемых родственниках таксона. В биологической классификации используются таксономические ранги, в том числе, среди прочего (в порядке от наиболее инклюзивного до наименее инклюзивного): Домен, Королевство, Тип, Учебный класс, Заказ, Семья, Род, Разновидность, и Напряжение.[70][примечание 1]

Таксономические описания

Смотрите также: Описание вида
Тип образца за Nepenthes smilesii, тропический кувшин

«Определение» таксона инкапсулируется его описанием или диагнозом, либо обоими вместе взятыми. Не существует установленных правил, регулирующих определение таксонов, но присвоение названий и публикация новых таксонов регулируется набором правил.[8] В зоология, то номенклатура для наиболее часто используемых рангов (надсемейство к подвид ), регулируется Международный кодекс зоологической номенклатуры (Кодекс ICZN).[71] В полях психология, микология, и ботаника, наименование таксонов регулируется Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (ICN).[72]

Первоначальное описание таксона включает пять основных требований:[73]

  1. Таксону необходимо дать название, основанное на 26 буквах латинского алфавита (a биномиальный для новых видов или одночленов для других рангов).
  2. Имя должно быть уникальным (т.е. не омоним ).
  3. Описание должно быть основано хотя бы на одном именном тип образец.
  4. Он должен включать утверждения о соответствующих атрибутах либо для описания (определения) таксона, либо для дифференциации его от других таксонов (диагноз, Кодекс ICZN, Статья 13.1.1, ICN, Статья 38). Оба кода намеренно разделяют определение содержания таксона (его ограничение ) от определения его имени.
  5. Эти первые четыре требования должны быть опубликованы в работе, доступной в большом количестве идентичных копий, в качестве постоянной научной записи.

Однако часто включается гораздо больше информации, например, о географическом ареале таксона, экологических заметках, химии, поведении и т. Д. То, как исследователи приходят к своим таксонам, варьируется: в зависимости от имеющихся данных и ресурсов методы варьируются от простых количественный или же качественный сравнения поразительных характеристик, чтобы разработать компьютерный анализ большого количества Последовательность ДНК данные.[74]

Ссылка на автора

Основные статьи: Цитирование автора (ботаника) и Цитирование автора (зоология)

После научного названия может стоять «авторитет».[75] Авторитет - это имя ученого или ученых, которые первыми официально опубликовали это имя.[75] Например, в 1758 году Линней дал Азиатский слон научное название Elephas maximus, поэтому имя иногда пишут как "Elephas maximus Линней, 1758 г. ».[76] Имена авторов часто сокращаются: аббревиатура Л., для Линнея, обычно используется. Фактически в ботанике существует регламентированный список стандартных сокращений (см. список ботаников по аббревиатуре автора ).[77] Система назначения полномочий немного отличается между ботаника и зоология.[8] Однако стандартно, что если род вида был изменен с момента первоначального описания, первоначальное название источника помещается в круглые скобки.[78]

Фенетика

Основная статья: Фенетика

В фенетике, также известной как таксиметрия или числовая таксономия, организмы классифицируются на основе общего сходства, независимо от их филогении или эволюционных отношений.[12] Результатом является мера эволюционного «расстояния» между таксонами. Фенетические методы стали относительно редкими в наше время, в значительной степени вытесненными кладистическими анализами, поскольку фенетические методы не различают общих предков (или плезиоморфный ) признаков от новых общих (или апоморфных) признаков.[79] Однако некоторые фенетические методы, такие как присоединение соседа, нашли свое применение в кладистике, как разумное приближение филогении, когда более продвинутые методы (такие как Байесовский вывод ) слишком затратны в вычислительном отношении.[80]

Базы данных

Основная статья: Таксономическая база данных

Современная таксономия использует база данных технологии поиска и каталогизации классификаций и документации к ним.[81] Хотя обычно не используется база данных, существуют всеобъемлющие базы данных, такие как Каталог Жизни, который пытается перечислить все задокументированные виды.[82] По состоянию на апрель 2016 года в каталоге было перечислено 1,64 миллиона видов для всех королевств, что составляет более трех четвертей предполагаемых видов, известных современной науке.[83]

Смотрите также

Примечания

  1. ^ Эту систему ранжирования можно запомнить по мнемонике «Играют ли короли в шахматы на изящном стекле?»

Рекомендации

  1. ^ а б Уилкинс, Дж. (5 февраля 2011 г.). «Что такое систематика и что такое таксономия?». В архиве из оригинала 27 августа 2016 г.. Получено 21 августа 2016.
  2. ^ Джадд, W.S .; Campbell, C.S .; Kellogg, E.A .; Стивенс, П.Ф .; Донохью, М.Дж. (2007). «Таксономия». Систематика растений: филогенетический подход (3-е изд.). Сандерленд: Sinauer Associates.
  3. ^ Симпсон, Майкл Г. (2010). «Глава 1 Систематика растений: обзор». Систематика растений (2-е изд.). Академическая пресса. ISBN  978-0-12-374380-0.
  4. ^ Кирк П.М., Кэннон П.Ф., Минтер Д.В., Сталперс Дж. ред. (2008) «Таксономия». В Словарь грибов, 10-е изд. CABI, Нидерланды.
  5. ^ Уокер, П.М.Б., изд. (1988). Словарь Вордсворта по науке и технологиям. W.R. Chambers Ltd. и Cambridge University Press.
  6. ^ а б Лоуренс, Э. (2005). Биологический словарь Хендерсона. Пирсон / Прентис Холл. ISBN  978-0-13-127384-9.
  7. ^ Уилер, Квентин Д. (2004). «Таксономическая сортировка и бедность филогении». В H.C.J. Годфрей и С. Кнапп (ред.). Таксономия двадцать первого века. Философские труды Королевского общества. 359. С. 571–583. Дои:10.1098 / rstb.2003.1452. ЧВК  1693342. PMID  15253345.
  8. ^ а б c «Номенклатура, названия и таксономия». Межгорный гербарий - УрГУ. 2005. Архивировано с оригинал 23 ноября 2016 г.
  9. ^ Маленький, Эрнест (1989). «Систематика биологической систематики (или таксономия таксономии)». Таксон. 38 (3): 335–356. Дои:10.2307/1222265. JSTOR  1222265.
  10. ^ Сингх, Гурчаран (2004). Систематика растений: комплексный подход. Научные издательства. п. 20. ISBN  978-1-57808-351-0 - через Google Книги.
  11. ^ Макстед, Найджел (1992). «К определению методологии таксономической ревизии». Таксон. 41 (4): 653–660. Дои:10.2307/1222391. JSTOR  1222391.
  12. ^ а б c d е ж грамм час «Таксономия: значение, уровни, периоды и роль». Обсуждение биологии. 27 мая 2016. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.[ненадежный источник? ]
  13. ^ Росселло-Мора, Рамон; Аманн, Рудольф (1 января 2001 г.). «Видовая концепция прокариот». Обзор микробиологии FEMS. 25 (1): 39–67. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2001.tb00571.x. ISSN  1574-6976. PMID  11152940.
  14. ^ а б Turrill, W.B. (1938). «Расширение таксономии с особым вниманием к сперматофитам». Биологические обзоры. 13 (4): 342–373. Дои:10.1111 / j.1469-185X.1938.tb00522.x. S2CID  84905335.
  15. ^ Стейскал, Г. (1965). «Трендовые кривые скорости описания видов в зоологии». Наука. 149 (3686): 880–882. Bibcode:1965Научный ... 149..880С. Дои:10.1126 / science.149.3686.880. PMID  17737388. S2CID  36277653.
  16. ^ Майр, Эрнст (9 февраля 1968 г.), «Роль систематики в биологии: изучение всех аспектов разнообразия жизни - одна из самых важных задач в биологии», Наука, 159 (3815): 595–599, Bibcode:1968Научный ... 159..595М, Дои:10.1126 / science.159.3815.595, PMID  4886900
  17. ^ Майр, Эрнст (1982). «Глава 6: Микротаксономия, наука о видах». Рост биологической мысли: разнообразие, эволюция и наследование. Belknap Press издательства Гарвардского университета. ISBN  978-0-674-36446-2.
  18. ^ «Результат вашего запроса». www.biological-concepts.com. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  19. ^ Датта 1988.
  20. ^ Стэйс 1989.
  21. ^ Стюесси 2009.
  22. ^ а б c Манктелоу, М. (2010) История таксономии В архиве 29 мая 2015 года в Wayback Machine. Лекция кафедры систематической биологии Уппсальского университета.
  23. ^ Майр, Э. (1982) Рост биологической мысли. Белкнап П. из Гарвардского университета, Кембридж (Массачусетс)
  24. ^ а б c d е ж грамм «Палеос: Таксономия». palaeos.com. Архивировано из оригинал 31 марта 2017 г.
  25. ^ а б c d "таксономия | биология". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  26. ^ а б c d "Биология 101, гл. 20". www.cbs.dtu.dk. 23 марта 1998 г. В архиве с оригинала от 28 июня 2017 г.
  27. ^ Леруа, Арман Мари (2014). Лагуна: как Аристотель изобрел науку. Блумсбери. С. 384–395. ISBN  978-1-4088-3622-4.
  28. ^ "Андреа Чезальпино | Итальянский врач, философ и ботаник". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  29. ^ Чезальпино, Андреа; Марескотти, Джорджо (1583). Растение либри XVI. Флоренция: Apud Georgium Marescottum - через Интернет-архив.
  30. ^ "Андреа Чезальпино | Итальянский врач, философ и ботаник". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  31. ^ Хайме, Проэнс (2010). International Edition Vegetables I: Asteraceae, Brassicaceae, Chenopodicaceae и Cucurbitaceae (Справочник по селекции растений). ISBN  978-1-4419-2474-2.
  32. ^ Джон, Рэй (1682). «Methodus plantarum nova». impensis Хенрици Фэйторн и Джоаннис Керси, ad insigne Rof Coemeterio D. Pauli. В архиве из оригинала от 29 сентября 2017 г. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  33. ^ "Джозеф Питтон де Турнефор | Французский ботаник и врач". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  34. ^ Линней, К. (1735) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita по классам, порядкам, родам и видам. Хаак, Лейден
  35. ^ Линней, К. (1753) Виды Plantarum. Стокгольм, Швеция.
  36. ^ Линней, К. (1758) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita по классам, порядкам, родам и видам, 10-е издание. Хаак, Лейден
  37. ^ а б c "таксономия - Линнеевская система | биология". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  38. ^ Донк, М.А. (декабрь 1957 г.). «Типизация и последующие отправные точки» (PDF). Таксон. 6 (9): 245–256. Дои:10.2307/1217493. JSTOR  1217493. В архиве (PDF) из оригинала 18 мая 2015 г.
  39. ^ Карл, Клерк; Карл, Бергквист; Эрик, Борг; Л., Готтман; Ларс, Сальвиус (1757). "Свенский шпиндель". Литерис Лаур. Salvii. В архиве с оригинала на 1 декабря 2017 года. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  40. ^ Секорд, Джеймс А. (2000). Викторианская сенсация: необычайная публикация, получение и тайное авторство пережитков естественной истории творения. Издательство Чикагского университета. ISBN  978-0-226-74410-0. Архивировано из оригинал 16 мая 2008 г.
  41. ^ а б c "систематика - Классификация со времен Линнея | биология". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  42. ^ «Ископаемые останки самых ранних современных птиц в мире могут помочь нам понять исчезновение динозавров». В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.[нужен лучший источник ]
  43. ^ Хаксли, Т. (1876 г.): Лекции по эволюции. New York Tribune. Дополнительный. нет. 36. In Collected Essays IV: pp. 46–138. исходный текст с рисунками В архиве 28 июня 2011 г. Wayback Machine
  44. ^ "Томас Генри Хаксли | Британский биолог". Энциклопедия Британника. В архиве из оригинала от 6 февраля 2018 г.
  45. ^ Рудвик, M.J.S. (1985). Значение окаменелостей: эпизоды в истории палеонтологии. Издательство Чикагского университета. п. 24. ISBN  978-0-226-73103-2.
  46. ^ Патерлини, Марта (сентябрь 2007 г.). «Должен быть порядок. Наследие Линнея в век молекулярной биологии». EMBO отчеты. 8 (9): 814–816. Дои:10.1038 / sj.embor.7401061. ЧВК  1973966. PMID  17767191.
  47. ^ а б c Тейлор, Майк. «Что означают такие термины, как монофилетический, парафилетический и полифилетический?». www.miketaylor.org.uk. В архиве из оригинала от 1 августа 2010 г.
  48. ^ а б «Полифилетический против монофилетического». ncse.com. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.
  49. ^ Queiroz, Филип Д. Кантино, Кевин де. «Филокод». www.ohio.edu. В архиве из оригинала 10 мая 2016 г.
  50. ^ а б «Филокод: концепция, история и преимущества | Таксономия». Обсуждение биологии. 12 июля 2016 г. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.[ненадежный источник? ]
  51. ^ а б c «Царственная классификация живых организмов». Обсуждение биологии. 2 декабря 2014 г. В архиве из оригинала от 5 апреля 2017 г.[ненадежный источник? ]
  52. ^ "Карл Вёзе | Институт геномной биологии Карла Р. Вёзе". www.igb.Illinois.edu. Архивировано из оригинал 28 апреля 2017 г.
  53. ^ Крафт, Джоэл и Донахью, Майкл Дж. (ред.) (2004). Сборка Древа Жизни. Оксфорд, Англия: Издательство Оксфордского университета. ISBN  0-19-517234-5. стр.45, 78, 555
  54. ^ а б Кавальер-Смит, Т. (1998). «Пересмотренная система жизни шести царств». Биологические обзоры. 73 (03): 203–66. Дои:10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID  9809012.
  55. ^ Лукета, С. (2012). «Новые взгляды на мегаклассификацию жизни» (PDF). Протистология. 7 (4): 218–237. В архиве (PDF) из оригинала от 2 апреля 2015 г.
  56. ^ Линней, К. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, систематика предложений по классам, порядкам, родам и видам.
  57. ^ Геккель, Э. (1866). Generelle Morphologie der Organismen. Реймер, Берлин.
  58. ^ Чаттон, Э. (1925). "Панспорелла перплекса. Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires ". Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale. 10-VII: 1–84.
  59. ^ Коупленд, Х. (1938). «Царства организмов». Ежеквартальный обзор биологии. 13: 383–420. Дои:10.1086/394568.
  60. ^ Уиттакер, Р. Х. (январь 1969 г.). «Новые представления о царствах организмов». Наука. 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci ... 163..150W. Дои:10.1126 / science.163.3863.150. PMID  5762760.
  61. ^ Woese, C .; Kandler, O .; Уилис, М. (1990). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS ... 87,4576 Вт. Дои:10.1073 / pnas.87.12.4576. ЧВК  54159. PMID  2112744.
  62. ^ Ruggiero, Michael A .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М .; Туэзен, Эрик В. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня». PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. Дои:10.1371 / journal.pone.0119248. ЧВК  4418965. PMID  25923521.
  63. ^ Adl, S.M .; Simpson, A.G.B .; Lane, C.E .; Lukeš, J .; Бас, D .; Bowser, S.S .; и другие. (Декабрь 2015 г.). «Пересмотренная классификация эукариот». Журнал эукариотической микробиологии. 59 (5): 429–493. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. ЧВК  3483872. PMID  23020233.
  64. ^ Adl, S.M .; Бас, D .; Lane, C.E .; Lukeš, J .; Schoch, C.L .; Смирнов, А .; и другие. (2019). «Изменения в классификации, номенклатуре и разнообразии эукариот». Журнал эукариотической микробиологии. 66 (1): 4–119. Дои:10.1111 / jeu.12691. ЧВК  6492006. PMID  30257078.
  65. ^ а б Ruggiero, M.A .; Гордон, Д.П .; Оррелл, Т.М.; Байи, Н .; Bourgoin, T .; Brusca, R.C .; и другие. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня». PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. Дои:10.1371 / journal.pone.0119248. ЧВК  4418965. PMID  25923521.
  66. ^ Руджеро, Майкл А. (2014). Семейства всех живых организмов, Версия 2.0.а.15, (26.04.14). Эксперт Солюшнс Интернешнл, ООО, Рестон, Вирджиния. 420 стр. Включенные данные доступны для скачивания через https://www.gbif.org/dataset/8067e0a2-a26d-4831-8a1e-21b9118a299c (DOI: 10.15468 / tfp6yv)
  67. ^ "Несколько плохих ученых угрожают свергнуть таксономию". Смитсоновский институт. Получено 24 февраля 2019.
  68. ^ "Что такое таксономия?". Лондон: Музей естественной истории. Архивировано из оригинал 1 октября 2013 г.. Получено 23 декабря 2017.
  69. ^ Макнили, Джеффри А. (2002). «Роль таксономии в сохранении биоразнообразия» (PDF). J. Nat. Консервировать. 10 (3): 145–153. Дои:10.1078/1617-1381-00015. S2CID  16953722. В архиве (PDF) из оригинала от 24 декабря 2017 г. - через Semantic Scholar.
  70. ^ "Мнемоническая таксономия / биология: Порядок класса типа Царства ..." В архиве из оригинала от 6 июня 2017 г.
  71. ^ «Кодекс ICZN». www.animalbase.uni-goettingen.de.
  72. ^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений». Международная ассоциация таксономии растений. В архиве из оригинала от 11 января 2013 г.
  73. ^ "Как я могу описать новые виды?". Международная комиссия по зоологической номенклатуре. Архивировано из оригинал 6 марта 2012 г.. Получено 21 мая 2020.
  74. ^ «Таксономия - Оценка таксономических знаков». Британская энциклопедия. В архиве с оригинала 22 апреля 2019 г.
  75. ^ а б "Совет редакции: научные названия видов | AJE | Эксперты американских журналов". www.aje.com. В архиве из оригинала от 9 апреля 2017 г.
  76. ^ "Карол Линней: классификация, таксономия и вклад в биологию - видео и стенограмма урока | Study.com". Study.com. В архиве из оригинала от 9 апреля 2017 г.
  77. ^ Biocyclopedia.com. «Биологическая классификация». www.biocyclopedia.com. В архиве из оригинала 14 мая 2017 года.
  78. ^ «Зоологическая номенклатура: основное руководство для авторов, не относящихся к систематике». Annelida.net. В архиве из оригинала 16 марта 2017 г.
  79. ^ «Классификация». Университет штата Северная Каролина. В архиве из оригинала 14 апреля 2017 г.. Получено 27 апреля 2017.
  80. ^ Макдональд, Дэвид (осень 2008 г.). «Глоссарий молекулярных маркеров». Университет Вайоминга. В архиве из оригинала 10 июня 2007 г.
  81. ^ Вуд, Дилан; Король, Маргарет; Лэндис, Дрю; Кортни, Уильям; Ван, Рунтан; Келли, Росс; Тернер, Джессика А .; Калхун, Винс Д. (26 августа 2014 г.). «Использование современных технологий веб-приложений для создания интуитивно понятных и эффективных инструментов визуализации и обмена данными». Границы нейроинформатики. 8: 71. Дои:10.3389 / fninf.2014.00071. ISSN  1662-5196. ЧВК  4144441. PMID  25206330.
  82. ^ «О компании - Список растений». www.theplantlist.org.
  83. ^ «О Каталоге Жизни: Ежегодный контрольный список на 2016 год». Каталог Жизни. Интегрированная система таксономической информации (ЭТО). В архиве из оригинала 15 мая 2016 г.. Получено 22 мая 2016.

Библиография

внешняя ссылка