Открытое Древо Жизни - Open Tree of Life - Wikipedia

Открытое Древо Жизни
Доступно ванглийский
URLopentreeoflife.org
Коммерческийнет
Постановка на учетне требуется
ЗапущенСентябрь 2015 г.
Текущее состояниеактивный
Лицензия на контент
BSD с двумя предложениями (FreeBSD)[1]

В Открытое Древо Жизни это онлайн филогенетический Дерево жизни - совместные усилия, финансируемые Национальный фонд науки.[2][3] Первый проект, включающий 2,3 миллиона видов, был выпущен в сентябре 2015 года.[4] Интерактивный граф позволяет пользователю увеличивать масштаб таксономических классификаций, филогенетических деревьев и информации об узле. При нажатии на вид будет возвращена его исходная и справочная таксономия.

Древо жизни в узле Eukaryota

Подход

В проекте используется супердерево подход к созданию единого филогенетического дерева (обслуживается на tree.opentreeoflife.org[5]) из комплексного таксономия и тщательно подобранный набор опубликованных филогенетических оценок.

Таксономия представляет собой комбинацию нескольких крупных классификаций, созданных другими проектами; он создается с помощью программного инструмента под названием "smasher"[6] Полученная таксономия называется таксономией открытого дерева (OTT), и ее можно просматривать в Интернете.[7]

История

Проект стартовал в июне 2012 г. с трехлетним NSF награда исследователям десяти университетов. В 2015 году исследователям трех институтов была присуждена дополнительная двухлетняя награда.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ «Лицензия OpenTreeOfLife».
  2. ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, ​​Coghill LM и др. (Октябрь 2015 г.). «Синтез филогении и систематики в единое древо жизни». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (41): 12764–9. Bibcode:2015ПНАС..11212764H. Дои:10.1073 / pnas.1423041112. ЧВК  4611642. PMID  26385966.
  3. ^ «Сборка, визуализация и анализ древа жизни». Национальный научный фонд (NSF). Получено 2016-02-11.
  4. ^ Pennisi E (21 сентября 2015 г.). «Первое всеобъемлющее древо жизни показывает, насколько вы связаны с миллионами видов». Научный журнал.
  5. ^ , разработчики Open Tree of Life. "opentree".
  6. ^ Рис Дж. А., Крэнстон К. (2017). «Автоматизированная сборка справочной таксономии для синтеза филогенетических данных». Журнал данных о биоразнообразии. 5 (5): e12581. Дои:10.3897 / BDJ.5.e12581. ЧВК  5515096. PMID  28765728.
  7. ^ "tree.opentreeoflife.org".