Неомура - Neomura

Эта статья посвящена таксономическому рангу, которого не придерживается большинство научного сообщества. Для получения более общепринятой классификации см. Бактериальный тип.
Кластер ячеек Галобактерии sp. штамм NRC-1, an архей

Неомура возможно клады состоит из двух области жизни из Археи и Эукариоты. Группа была названа Томас Кавалье-Смит в 2002.[1] Его название означает «новые стены», что отражает его гипотезу о том, что он развился из Бактерии, и одним из основных изменений стала замена пептидогликан клеточные стенки с другим гликопротеины. По состоянию на август 2017 г., гипотеза неомурана не принимается большинством исследователей; молекулярная филогения предполагает, что эукариоты наиболее тесно связаны с одной группой архей и произошли от них, а не образуют кладу со всеми археями.

Морфология

Рассматриваемые как клады, Neomura представляют собой очень разнообразную группу, включающую в себя все многоклеточные виды, а также все самые экстремофильный видов, но все они имеют определенные молекулярные характеристики. У всех неомуранцев есть гистоны помочь с хромосома упаковка, и у большинства есть интроны. Все используют молекулу метионин как инициатор аминокислота за синтез белка (бактерии используют формилметионин ). Наконец, все неомуранцы используют несколько видов РНК полимераза, тогда как бактерии используют только один.

Филогения

Существует несколько гипотез филогенетических взаимоотношений между археями и эукариотами.

Просмотр трех доменов

Когда Карл Вёзе впервые опубликовал свой трехдоменная система[когда? ], считалось, что домены Бактерии, Археи и эукариоты были одинаково древними и одинаково родственниками на древе жизни. Однако некоторые данные начали предполагать, что эукариоты и археи были более тесно связаны друг с другом, чем с бактериями. Это свидетельство включало обычное использование холестерины и протеасомы, которые представляют собой сложные молекулы, которые не встречаются у большинства бактерий, что позволяет сделать вывод, что корень жизни лежит между бактериями, с одной стороны, и архей и эукариот, вместе взятых, с другой, то есть существуют две основные ветви жизни, следующие за LUCA - Бактерии и Неомура (тогда так не назывались).

 
 

Бактерии

 
(Неомура)
 

Эукариоты

 
 

Археи

 
 
 

Сценарий «трех основных доменов» (3D) был одной из двух гипотез, которые считались правдоподобными в обзоре происхождения эукариот в 2010 году.[2]

Производный вид клады

В статье 2002 г. и последующих работах Томас Кавалье-Смит и коллеги выдвинули гипотезу, что Neomura был кладой, глубоко вложенной в Eubacteria с Актинобактерии как его сестринская группа. Он писал: «Эукариоты и архебактерии образуют кладу neomura и являются сестрами, что решительно демонстрируют гены, фрагментированные только в архебактериях, и многие деревья последовательностей. Это сестринство опровергает все теории о том, что эукариоты произошли в результате слияния архебактерий и α-протеобактерий, которые также не учитывают многочисленные особенности, присущие эукариотам и актинобактериям ».[1]

К ним относятся наличие холестерины и протеасомы в Actinobacteria, а также в Neomura. Особенности такой сложности вряд ли развиваться более одного раза в отдельных ветках, так что либо горизонтальный перенос из этих двух путей, или Neomura произошла от этой конкретной ветви бактериального дерева.

LUCA  
 

Хлоробактерии

 
 
 

Hadobacteria

 
 
 

Цианобактерии

 
 
 

Gracilicutes

 
 
 

Эврибактерии

 
 
 

Эндобактерии

 
 
 

Актинобактерии

 
Неомура
 

Археи

 
 

Эукариоты

 
 
 
 
 
 
 
 
 

Просмотр двух доменов

Еще в 2010 г. основным конкурентом сценария трех доменов для происхождения эукариот был сценарий «двух доменов» (2D), в котором эукариоты возникли из архей.[2] Открытие основной группы архей, Lokiarchaeota, с которым эукариоты более генетически похожи, чем на других архей, не согласуется с гипотезой Неомуры. Вместо этого он поддерживает гипотезу о том, что эукариоты возникли из одной группы архей:[3]

 
 

Бактерии

 
 
 
 

Эукариоты

 
 

археи

 
 
 

археи

 
 
 
Археи

Исследование 2016 г. с использованием 16 универсально сохраняемых рибосомальные белки поддерживает 2D-вид. Его «новый взгляд на древо жизни» показывает эукариот как небольшую группу, гнездящуюся внутри архей, в частности внутри TACK superphylum. Однако происхождение эукариот остается нерешенным, и сценарии с двумя доменами и тремя доменами остаются жизнеспособными гипотезами.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Кавальер-Смит Т. (март 2002 г.). «Фаготрофное происхождение эукариот и филогенетическая классификация простейших». Int. J. Syst. Evol. Микробиол. 52 (Pt 2): 297–354. Дои:10.1099/00207713-52-2-297. PMID  11931142.
  2. ^ а б Грибальдо, Симонетта; Пул, Энтони М .; Добин, Винсент; Фортер, Патрик и Брошье-Армане, Селин (01.10.2010). «Происхождение эукариот и их отношения с археями: мы в филогеномном тупике?». Обзоры природы Микробиология. 8 (10): 743–752. Дои:10.1038 / nrmicro2426. PMID  20844558.
  3. ^ Лопес-Гарсия, Пурификасьон и Морейра, Дэвид (2015). «Открытые вопросы о происхождении эукариот». Тенденции в экологии и эволюции. 30 (11): 697–708. Дои:10.1016 / j.tree.2015.09.005. ЧВК  4640172. PMID  26455774.
  4. ^ Hug, Laura A .; Бейкер, Бретт Дж .; Анантараман, Картик; Браун, Кристофер Т .; Probst, Alexander J .; Кастель, Синди Дж .; Баттерфилд, Кристина Н .; Hernsdorf, Alex W .; Амано, Юки; Исэ, Котаро; Сузуки, Йохей; Дудек, Наташа; Relman, David A .; Finstad, Kari M .; Амундсон, Рональд; Томас, Брайан К. и Бэнфилд, Джиллиан Ф. (11 апреля 2016 г.). «Новый взгляд на древо жизни». Природная микробиология. 1 (5): 16048. Дои:10.1038 / nmicrobiol.2016.48. PMID  27572647.

дальнейшее чтение