Obazoa - Obazoa

	Archaeplastida

	Хакробия

	SAR супергруппа


	Экскавата

	CRuM

	Амебозоа

	Breviatea

	Апусомонадида

	Опистоспоридии

	Настоящие грибы


	Nucleariida

	Фонтикулида



	Ихтиоспорея

	Syssomonas

	Кораллохитрий


	Filasterea

	Чоанофлагеллятея

	Animalia








	Униконц

Obazoa; Временной диапазон: Поздний Стениан - Подарок, 1031.4–0 млн лет Pha. Протерозойский Архейский Had'n
Научная классификация
(без рейтинга):	Unikonta
(без рейтинга):	Obazoa; Коричневый, 2013
Clades
	Breviatea; Апусомонадида; Опистоконц;

Obazoa (Браун и др., 2013)^[1] предложенная сестра клады из Амебозоа (которые вместе образуют Аморфея ). Obazoa состоит из Breviatea, Апусомонадида и Опистоконта, и, в частности, исключает Амебозоа. Термин Obazoa основан на OBA акроним за Опистоконта BReviatea и Аpusomonadida.^[1]

Определение места расположения Breviatea и Apusomonadida и их свойств представляет интерес для развития опистоконтов, в которых основные линии происхождения животные и грибы появился.^[1] Отношения между опистоконтами, бревиатами и апусомонадами окончательно не выяснены (по состоянию на 2018 год), хотя Breviatea обычно считается самой базовой из трех линий.^[2]^[3]^[4]^[5]^[6] Филогении рибосомных РНК обычно не выделяют Obazoa как кладу (см., Например:^[7]), что, вероятно, отражает их происхождение от очень древнего общего предка, а в наборах данных, состоящих из одного или нескольких генов, остается мало филогенетических сигналов.

Рекомендации

^ ^а ^б ^c Браун, Мэтью У .; Шарп, Сьюзен С.; Зильберман, Джеффри Д .; Heiss, Aaron A .; Ланг, Б. Франц; Симпсон, Аластер Г. Б.; Роджер, Эндрю Дж. (2013-10-22). «Филогеномика демонстрирует, что жгутиковые родственны опистоконтам и апусомонадам». Труды Лондонского королевского общества B: биологические науки. 280 (1769): 20131755. Дои:10.1098 / rspb.2013.1755. ISSN 0962-8452. ЧВК 3768317. PMID 23986111.
^ Эме, Лаура; Шарп, Сьюзен С.; Браун, Мэтью У .; Роджер, Эндрю Дж. (2014). «О возрасте эукариот: оценка свидетельств окаменелостей и молекулярных часов». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 6 (8): a016139. Дои:10.1101 / cshperspect.a016139. ISSN 1943-0264. ЧВК 4107988. PMID 25085908.
^ Ruggiero, Michael A .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М. (2015-06-11). «Коррекция: классификация всех живых организмов более высокого уровня». PLOS ONE. 10 (6): e0130114. Bibcode:2015PLoSO..1030114R. Дои:10.1371 / journal.pone.0130114. ISSN 1932-6203. ЧВК 5159126. PMID 26068874.
^ Кавальер-Смит, Томас; Фиоре-Донно, Анна Мария; Чао, Эма; Кудрявцев Александр; Берни, Седрик; Snell, Elizabeth A .; Льюис, Родри (01.02.2015). «Мультигенная филогения разрешает глубокое ветвление амебозоа». Молекулярная филогенетика и эволюция. 83: 293–304. Дои:10.1016 / j.ympev.2014.08.011. PMID 25150787.
^ Кавалер-Смит Т. (2009). «Мегафилогения, планы клеточного тела, адаптивные зоны: причины и время базальных излучений эукариот». J. Eukaryot. Микробиол. 56 (1): 26–33. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2008.00373.x. PMID 19340985.
^ Браун, Мэтью В.; Хейсс, Аарон А; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К; Ширатори, Такаши; Исида, Кен-Ичиро; Хасимото, Тецуо (19 января 2018). «Филогеномика помещает сиротские линии протистанского происхождения в новую эукариотическую супергруппу». Геномная биология и эволюция. 10 (2): 427–433. Дои:10.1093 / gbe / evy014. ЧВК 5793813. PMID 29360967.
^ Орр, Рассел Дж. С .; Чжао, Сен; Клавенесс, Даг; Ябуки, Акинори; Икеда, Кейджи; Макото, Ватанабэ М .; Шалчян-Тебризи, Камран (2017-10-08). «Загадочные эукариоты Diphyllatea: культивирование и целевое секвенирование ампликона PacBio RS выявляют более высокое таксономическое разнообразие и глобальное распространение». bioRxiv 10.1101/199125.
^
Филогения основана на:
- Eichinger, L .; Pachebat, J. A .; Glöckner, G .; Rajandream, M.A .; Sucgang, R .; Berriman, M .; Song, J .; Olsen, R .; и другие. (2005). "Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum". Природа. 435 (7038): 43–57. Дои:10.1038 / природа03481. ЧВК 1352341. PMID 15875012.
- Steenkamp, E.T .; Wright, J .; Балдауф, С. Л. (2005). «Происхождение животных и грибов в Протистане». Молекулярная биология и эволюция. 23 (1): 93–106. Дои:10.1093 / molbev / msj011. PMID 16151185.

[Brown2013-1] а ^б ^c Браун, Мэтью У .; Шарп, Сьюзен С.; Зильберман, Джеффри Д .; Heiss, Aaron A .; Ланг, Б. Франц; Симпсон, Аластер Г. Б.; Роджер, Эндрю Дж. (2013-10-22). «Филогеномика демонстрирует, что жгутиковые родственны опистоконтам и апусомонадам». Труды Лондонского королевского общества B: биологические науки. 280 (1769): 20131755. Дои:10.1098 / rspb.2013.1755. ISSN 0962-8452. ЧВК 3768317. PMID 23986111.

[2] Эме, Лаура; Шарп, Сьюзен С.; Браун, Мэтью У .; Роджер, Эндрю Дж. (2014). «О возрасте эукариот: оценка свидетельств окаменелостей и молекулярных часов». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 6 (8): a016139. Дои:10.1101 / cshperspect.a016139. ISSN 1943-0264. ЧВК 4107988. PMID 25085908.

[3] Ruggiero, Michael A .; Гордон, Деннис П .; Оррелл, Томас М .; Байи, Николас; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард С .; Кавальер-Смит, Томас; Guiry, Michael D .; Кирк, Пол М. (2015-06-11). «Коррекция: классификация всех живых организмов более высокого уровня». PLOS ONE. 10 (6): e0130114. Bibcode:2015PLoSO..1030114R. Дои:10.1371 / journal.pone.0130114. ISSN 1932-6203. ЧВК 5159126. PMID 26068874.

[4] Кавальер-Смит, Томас; Фиоре-Донно, Анна Мария; Чао, Эма; Кудрявцев Александр; Берни, Седрик; Snell, Elizabeth A .; Льюис, Родри (01.02.2015). «Мультигенная филогения разрешает глубокое ветвление амебозоа». Молекулярная филогенетика и эволюция. 83: 293–304. Дои:10.1016 / j.ympev.2014.08.011. PMID 25150787.

[pmid19340985-5] Кавалер-Смит Т. (2009). «Мегафилогения, планы клеточного тела, адаптивные зоны: причины и время базальных излучений эукариот». J. Eukaryot. Микробиол. 56 (1): 26–33. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2008.00373.x. PMID 19340985.

[6] Браун, Мэтью В.; Хейсс, Аарон А; Камикава, Риома; Инагаки, Юдзи; Ябуки, Акинори; Тайс, Александр К; Ширатори, Такаши; Исида, Кен-Ичиро; Хасимото, Тецуо (19 января 2018). «Филогеномика помещает сиротские линии протистанского происхождения в новую эукариотическую супергруппу». Геномная биология и эволюция. 10 (2): 427–433. Дои:10.1093 / gbe / evy014. ЧВК 5793813. PMID 29360967.

[7] Орр, Рассел Дж. С .; Чжао, Сен; Клавенесс, Даг; Ябуки, Акинори; Икеда, Кейджи; Макото, Ватанабэ М .; Шалчян-Тебризи, Камран (2017-10-08). «Загадочные эукариоты Diphyllatea: культивирование и целевое секвенирование ампликона PacBio RS выявляют более высокое таксономическое разнообразие и глобальное распространение». bioRxiv 10.1101/199125.

[Stem_group_kingdoms-8] Филогения основана на:
Eichinger, L .; Pachebat, J. A .; Glöckner, G .; Rajandream, M.A .; Sucgang, R .; Berriman, M .; Song, J .; Olsen, R .; и другие. (2005). "Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum". Природа. 435 (7038): 43–57. Дои:10.1038 / природа03481. ЧВК 1352341. PMID 15875012.
Steenkamp, E.T .; Wright, J .; Балдауф, С. Л. (2005). «Происхождение животных и грибов в Протистане». Молекулярная биология и эволюция. 23 (1): 93–106. Дои:10.1093 / molbev / msj011. PMID 16151185.

[9] Eichinger, L .; Pachebat, J. A .; Glöckner, G .; Rajandream, M.A .; Sucgang, R .; Berriman, M .; Song, J .; Olsen, R .; и другие. (2005). "Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum". Природа. 435 (7038): 43–57. Дои:10.1038 / природа03481. ЧВК 1352341. PMID 15875012.

[10] Steenkamp, E.T .; Wright, J .; Балдауф, С. Л. (2005). «Происхождение животных и грибов в Протистане». Молекулярная биология и эволюция. 23 (1): 93–106. Дои:10.1093 / molbev / msj011. PMID 16151185.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]