РНК roX дрозофилы - Drosophila roX RNA

Дрозофила roX1 нкРНК
Rox1 SS.png
Сохранено вторичная структура roX1 РНК
Идентификаторы
СимволroX1
РфамRF01667
Прочие данные
РНК типСНГ-регулирующий элемент
Домен (ы)Дрозофила
PDB структурыPDBe

RoX РНК это некодирующая РНК (нкРНК) присутствует в специфическом для мужчин летальном комплексе (MSL) и требуется для определения пола компенсация дозировки в Дрозофила. Поскольку самцы содержат только один Х хромосома доза самцов мух компенсирует Х-хромосому за счет гипер-транскрипции Х-хромосомы. Это достигается за счет связывания комплекса MSL с Х-хромосомой и индукции гистон H4 лизин 16 ацетилирование и позволяет формировать эухроматин.[1][2] Эти нкРНК были впервые обнаружены в РНК, выделенной из нейрональных клеток.[3][4]

Две roX РНК были идентифицированы в комплексе MSL из Drosophila melanogaster и было показано, что они сохраняются у разных видов дрозофил. Было показано, что две roX РНК, известные как roX1 и roX2, различаются по первичной последовательности и длине последовательности, но, несмотря на эти различия, обе они содержат сайт связывания MSL и функционально избыточны.[5][6] Клонирование гены roX и последующие выравнивание последовательностей от ряда различных видов дрозофил идентифицировано несколько консервированные регионы также было замечено, что roX РНК присутствует только у самцов мух.[7]

Вторичная структура предсказания предсказали стержень петля присутствовать на 3' конец транскриптов РНК roX. Мутагенез в пределах этой области, которая либо изменяла последовательность, либо предотвращала образование петли ствола, как было показано, была смертельной для самцов мух, поскольку они не могли компенсировать дозу, поскольку эти мутации предотвращали связывание MSL с X-хромосомой. Также было показано, что в присутствии мутант roX РНК, комплекс MSL не может локализоваться на Х-хромосоме и неправильно локализоваться в гетерохроматическом хромоцентре. Это говорит о том, что roX РНК играет роль в направлении комплекса MSL к Х-хромосоме.[7] Выравнивание последовательности roX2 идентифицировал несколько областей сохранение последовательности известны как регионы Gub и отсутствуют в roX1. Многие из этих областей Gub считаются избыточными, поскольку мутации не имеют эффекта, однако Gub1, который присутствует в области 3'-стволовой петли, считается ключевым мотивом, необходимым для roX2, поскольку мутации Gub1, как было показано, являются летальными. Эти исследования показывают, что roX-РНК важна для дозовой компенсации там, где 3 ' стержень петля области в roX РНК являются критическими для локализации MSL, и считается, что это мотив, который позволяет двум roX РНК быть функционально избыточными.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Meller, V .; Гордадзе, П .; Park, Y .; Чу, X .; Stuckenholz, C .; Kelley, R .; Курода, М. (февраль 2000 г.). «Упорядоченная сборка РНК roX в комплексы MSL на Х-хромосоме с компенсированной дозировкой у дрозофилы». Текущая биология. 10 (3): 136–143. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00311-0. ISSN  0960-9822. PMID  10679323.
  2. ^ Hamada, N .; Park, J .; Гордадзе, Р .; Курода, И. (октябрь 2005 г.). «Глобальная регуляция генов Х-хромосомы комплексом MSL у Drosophila melanogaster» (Бесплатный полный текст). Гены и развитие. 19 (19): 2289–2294. Дои:10.1101 / gad.1343705. ISSN  0890-9369. ЧВК  1240037. PMID  16204180.
  3. ^ Меллер V; Wu K; Роман Г .; Курода М; Дэвис Р. (1997). «РНК roX1 окрашивает Х-хромосому самцов дрозофилы и регулируется системой компенсации доз». Клетка. 88 (4): 445–457. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81885-1. PMID  9038336.
  4. ^ Амрейн Х., Аксель Р. (1997). «Гены, экспрессируемые в нейронах взрослых самцов дрозофилы». Клетка. 88 (4): 459–469. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81886-3. PMID  9038337.
  5. ^ Franke, A .; Бейкер, Б. (июль 1999 г.). «РНК rox1 и rox2 являются важными компонентами компенсасомы, которая обеспечивает компенсацию дозировки у дрозофилы». Молекулярная клетка. 4 (1): 117–122. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80193-8. ISSN  1097-2765. PMID  10445033.
  6. ^ Meller, H .; Раттнер, П. (март 2002 г.). «Гены roX кодируют избыточные специфические для мужчин летальные транскрипты, необходимые для нацеливания на комплекс MSL». Журнал EMBO (Бесплатный полный текст). 21 (5): 1084–1091. Дои:10.1093 / emboj / 21.5.1084. ISSN  0261-4189. ЧВК  125901. PMID  11867536.
  7. ^ а б Park, W .; Kang, E .; Sypula, G .; Choi, J .; Ох.; Парк Ю. (ноябрь 2007 г.). «Эволюционно законсервированный домен roX2 РНК достаточен для индукции ацетилирования H4-Lys16 на X-хромосоме дрозофилы» (Бесплатный полный текст). Генетика. 177 (3): 1429–1437. Дои:10.1534 / genetics.107.071001. ISSN  0016-6731. ЧВК  2147973. PMID  18039876.

внешняя ссылка