ЕсыН - EsyN
Оригинальный автор (ы) | Кембриджский центр системной биологии |
---|---|
изначальный выпуск | Сентябрь 2014 г. |
Стабильный выпуск | 2.1 / 17 января 2016 |
Написано в | JavaScript |
Тип | Программное обеспечение для биоинформатики |
Интернет сайт | www |
esyN (Простые сети)[1][2] это биоинформатика веб-инструмент для визуализация, построение и анализ сети молекулярного взаимодействия. esyN основан на cytoscape.js, и его цель - упростить всем выполнение сетевого анализа. esyN связан с рядом баз данных, а именно с pombase, база, и большинство InterMine хранилища данных, DrugBank, и BioGRID из которого можно загрузить белок-белок или генетические взаимодействия для любого белка или гена в ряде различных организмов.
Сети, опубликованные в esyN, могут быть легко опубликованы на других сайтах с использованием методологии
использование
По состоянию на январь 2016 года esyN просматривают 1500 уникальных пользователей в день (около 16000 в месяц) по данным Гугл Аналитика.
Возможности внедрения esyN используются рядом баз данных для отображения данных о взаимодействии:
Смотрите также
- Вычислительная геномика
- Моделирование метаболической сети
- Прогнозирование белок-белкового взаимодействия
Рекомендации
- ^ Фасоль; и другие. (2014). «ESYN: построение, совместное использование и публикация сети». PLoS ONE. 9 (9): e106035. Дои:10.1371 / journal.pone.0106035. ЧВК 4152123. PMID 25181461.
- ^ Хоффман; и другие. (2015). "Древние дрожжи для молодых генетиков: учебник по модельной системе Schizosaccharomyces pombe". Генетика. 201 (2): 403–423. Дои:10.1534 / genetics.115.181503. ЧВК 4596657. PMID 26447128.
- ^ «Учебник: Добро пожаловать в esyN». esyN.org. 2018. Получено 10 февраля 2019.
- ^ "Отчет о физическом взаимодействии". FlyBase. 21 декабря 2018 г.. Получено 10 февраля 2019.
- ^ "Аллель: ttk [MI01174] D. melanogaster". FlyMine. Ноябрь 2018. Получено 10 февраля 2019.
- ^ "Страница отчета". HumanMine. Ноябрь 2018. Получено 10 февраля 2019.
- ^ «Дрожжи деления GO slim». PomBase. Получено 10 февраля 2019.