ФАКТ (биология) - FACT (biology)

ФАКТ (фасмягчает cхроматин ттранскрипция) является гетеродимерный белок комплекс, который влияет эукариотический РНК-полимераза II (Pol II) элонгация транскрипции in vitro и in vivo. Он был открыт в 1998 году как очищенный от человеческих клеток фактор, необходимый для продуктивной, in vitro Транскрипция Pol II на хроматизированный Шаблон ДНК.[1]

ФАКТ состоит из 140 и 80 килодальтон (кДа) субъединицы. Субъединица 140 кДа кодируется геном человека (SUPT16H ), что на 36% идентично С. cerevisiae ген Spt16 и субъединица 80 кДа являются человеческими SSRP1 (POB3 в С. cerevisiae). Обе эти субъединицы в дрожжах влияют на элонгацию транскрипции Pol II, а очищенный человеческий FACT специфически связывается с мононуклеосомами и димером гистона H2A / H2B, но не с тетрамером H3 / H4 (см .: Частица ядра нуклеосомы ) или Pol II.[2]

Анализы коиммунопреципитации с мечеными рекомбинантными белками показали, что субъединица Spt16 взаимодействует с димерами H2A / H2B и мононуклеосомами, но не с тетрамерами H3 / H4, тогда как субъединица SSRP1 взаимодействует только с тетрамерами H3 / H4, а не с мононуклеосомами. Делеция высококислотного карбоксиконца Spt16 (общая черта известных гистоновых шаперонов) не мешает Spt16 формировать стабильный комплекс с SSRP1, но устраняет взаимодействие с мононуклеосомами и способность стимулировать транскрипцию in vitro на хроматинированных матрицах. Две субъединицы вместе, но ни одна из них по отдельности, могут стимулировать образование нуклеосом из свободных гистонов и ДНК (гистонов сопровождающий Мероприятия). Эти две субъединицы высоко консервативны у всех эукариот, и, как было показано, помимо транскрипции, они также влияют на репарацию и репликацию ДНК.[3]

В клетках FACT обогащен в частях генома, участвующих в активном удлинении Pol II, как видно по окрашиванию флуоресцентными антителами Дрозофила политенные хромосомы и иммунопреципитация хроматина (ChIP) анализы на Дрозофила Экстракты клеток Kc.[4]

Рекомендации

  1. ^ Орфанид, Джордж; Лерой, Гэри; Чанг, Чунь-Сян; Luse, Donal S .; Рейнберг, Дэнни (1998). «ФАКТ, фактор, который способствует удлинению транскрипта через нуклеосомы». Клетка. 92 (1): 105–116. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80903-4. PMID  9489704. S2CID  11248520.
  2. ^ Орфанид, Джордж; Ву, Вэй-Хуа; Lane, William S .; Хэмпси, Майкл; Рейнберг, Дэнни (1999). «Хроматин-специфический фактор элонгации транскрипции FACT включает человеческие белки SPT16 и SSRP1». Природа. 400 (6741): 284–288. Дои:10.1038/22350. PMID  10421373. S2CID  4300397.
  3. ^ Белоцерковская, Римма; О, Сангтэк; Бондаренко, Владимир А .; Орфанид, Джордж; Студицкий, Василий; Рейнберг, Дэнни (2003). «FACT способствует транскрипционно-зависимому изменению нуклеосом». Наука. 301 (5636): 1090–1093. Дои:10.1126 / science.1085703. PMID  12934006. S2CID  26667338.
  4. ^ Сондерс, Эбби; Вернер, Янис; Андрулис, Эрик Д .; Накаяма, Такахиро; Хиросе, Сусуму; Рейнберг, Дэнни; Лис, Джон Т. (2003). «Отслеживание FACT и комплекса элонгации РНК-полимеразы II через хроматин in vivo». Наука. 301 (5636): 1094–1096. Дои:10.1126 / science.1085712. PMID  12934007. S2CID  10064786.

дальнейшее чтение

Рейнберг, Д., Симс, Р. (2006). de FACTo динамика нуклеосом. Журнал биологической химии, 281(33) 23297-23391.