Элемент FIE3 (элемент нестабильности ftz 3 ') - FIE3 (ftz instability element 3′) element

Элемент FIE3 (элемент нестабильности ftz 3 ')
RF00227.jpg
Идентификаторы
СимволFIE3
РфамRF00227
Прочие данные
РНК типСнг
Домен (ы)Эукариоты
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

В Элемент FIE3 (элемент нестабильности ftz 3 ') является Элемент РНК найдено в 3 ′ UTR из фуши таразу мРНК Ген fushi tarazu необходим для создания Дрозофила эмбриональный план тела. При первом проявлении в начале эмбриогенез мРНК fushi tarazu равномерно распределена по большей части эмбрион. Впоследствии экспрессия мРНК fushi tarazu быстро превращается в паттерн из семи полос, окружающих эмбрион. Нестабильность мРНК fushi tarazu может способствовать локализации этого паттерна выражение, но это вряд ли будет доминирующим эффектом, поскольку элемент полосы зебры ftz из 744 пар оснований может управлять эктопической экспрессией репортерной конструкции (со структурой мРНК, полностью не связанной с транскриптом ftz) в качественно очень похожем паттерне.[1] Эксперименты подтверждают наличие как минимум двух дестабилизирующих элементов в мРНК fushi tarazu, один из которых расположен внутри 5′ одна треть мРНК, а другая около 3 ′ конец (названный FIE3 для элемента неустойчивости ftz 3 '). FIE3 находится в пределах 201-нуклеотид последовательность прямо перед полиаденилирование сигнал и может действовать автономно, дестабилизируя гетерологичную мРНК. Дальше удаление конструкции идентифицировали существенный 68-нуклеотидный элемент в FIE3.[2] Хотя предполагается, что этот элемент будет содержать вторичную структуру, он также содержит последовательность с высоким содержанием GU (UGUUUUGUUU), которая аналогична элементам нестабильности с высоким содержанием GU, впоследствии идентифицированным в других системах.[3]

Рекомендации

  1. ^ Браун Дж. Л., Сонода С., Уэда Х., Скотт М. П., Ву С. (март 1991 г.). «Подавление гена сегментации Drosophila fushi tarazu (ftz)». Журнал EMBO. 10 (3): 665–674. ЧВК  452699. PMID  2001679.
  2. ^ Ридл А., Якобс-Лорена М. (июнь 1996 г.). «Детерминанты нестабильности мРНК Drosophila fushi tarazu». Молекулярная и клеточная биология. 16 (6): 3047–3053. Дои:10.1128 / mcb.16.6.3047. ЧВК  231299. PMID  8649416.
  3. ^ Власова-Сент-Людовик I, Бохьянен PR (август 2011 г.). «Координированная регуляция сетей распада мРНК с помощью GU-богатых элементов и CELF1». Текущее мнение в области генетики и развития. 21 (4): 444–451. Дои:10.1016 / j.gde.2011.03.002. ЧВК  3146975. PMID  21497082.

внешняя ссылка