GeneSweep - GeneSweep

GeneSweep: Gene Sweepstake
Дата10 мая 2000 г. - 30 мая 2003 г. (2000-05-10 – 2003-05-30)
Продолжительность3 года и 20 дней
Место проведенияЛаборатория Колд-Спринг-Харбор
Проект базы данных генома ансамбля
РасположениеГлобальный
ТипЛотерея
Научная ставка
ТемаГенетика
Геномика
МотивОценка общего количества генов в человеческий геном
ОрганизованоЮэн Бирни
Дэвид Стюарт
Участников460 ставок[1]
НаградыПриз 1200 долларов
Интернет сайтwww.ensembl.org/ genesweep.html[2]

GeneSweep или Джин Свипстейк был лотерея и научная ставка чтобы ученые могли делать ставки на общее количество гены в человеческий геном.[3][4][5][6][7][8] Розыгрыш был начат в Лаборатория Колд-Спринг-Харбор конференция 2000 г.[2][9][10][11][12] Первоначально ставки можно было делать на 1 доллар, который был увеличен до 5 долларов в 2001 году и до 20 долларов в 2002 году.[2] Стоимость размещения ставки значительно увеличилась, поскольку предполагалось, что в дальнейшем участники получат гораздо более точную информацию для своих предположений.[13] К 23 мая 2000 года было сделано 228 ставок, при этом среднее количество предсказанных генов среди них составило 62 598.[14]

Выигрышные ставки в 2003 году

30 мая 2003 г. Юэн Бирни из Европейский институт биоинформатики, который организовал бассейн,[2] объявил победителя: Ли Роуэн из Институт системной биологии.[15] Роуэн предположил, что геном человека будет содержать 25 947 генов, что было самым близким к предполагаемому количеству 24 847 генов, определенному Проект базы данных генома ансамбля. Это была не только выигрышная догадка, но и самая низкая из более чем 460 сделанных ставок.[1] Роуэн поделил призовой фонд в $ 1200 с Полом Диром из Совет медицинских исследований (MRC) и Оливье Жайон из Геноскоп. Роуэн зачислен Жан Вайссенбах Genoscope, убедив ее, что истинное количество человеческих генов будет относительно низким. Все трое победителей разделили приз, потому что они были единственными игроками, которые угадали меньше 30 000, и Бирни был уверен, что общее количество генов меньше этого.[16] В розыгрыши всегда планировалось завершить в 2003 году, потому что Бирни ожидал, что Ensembl к тому времени завершит подсчет количества человеческих генов. Когда стало ясно, что им потребуется больше времени, чтобы прийти к точному количеству, Бирни первоначально планировал продлить розыгрыши еще на пять лет. Однако Дэвид Стюарт убедил Бирни выбрать победителя, указав на правила, согласно которым победитель должен быть выбран в 2003 году без каких-либо исключений. Бирни отметил, что, хотя точное число еще неизвестно, нет никаких сомнений в том, что количество человеческих генов намного меньше 26 000, и объявил, что 21 000 - это наилучшая оценка в своем выступлении в 2003 году.[17]

Продолжающиеся дебаты после 2003 года

По состоянию на 2018 год Среди ученых продолжаются споры об общем количестве генов в геноме человека, большинство оценок колеблются от 19 000 до 22 000.[18][19]

использованная литература

  1. ^ а б Пирсон, Хелен (2003). «Генетики напрасно играют в числа». Природа. 423 (6940): 576. Дои:10.1038 / 423576a. ISSN  0028-0836. PMID  12789304.
  2. ^ а б c d Бирни, Юэн (2000). "Gene Sweepstake (" Genesweep ")". ensembl.org. Архивировано из оригинал на 2000-08-16.
  3. ^ Анон (2002). «Лучшие исследователи генома собираются в Колд-Спринг-Харбор». cshl.edu. Лаборатория Колд-Спринг-Харбор.
  4. ^ Чжан, Цзяньчжи (2007). «Дрейфующий геном человека». Труды Национальной академии наук. 104 (51): 20147–20148. Дои:10.1073 / pnas.0710524104. ISSN  0027-8424.
  5. ^ Чой, Чарльз Q (2003). «Кто выиграет Джин-тотализатор?». Геномная биология. 4. Дои:10.1186 / gb-spotlight-20030430-01. ISSN  1465-6906.
  6. ^ Лич, Мартин (2004). «Информатика экспрессии генов». 258: 153–166. Дои:10.1385/1-59259-751-3:153. Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  7. ^ Джайлз, Джим (2002). «Хочешь поспорить?». Природа. 420 (6914): 354–355. Дои:10.1038 / 420354a. ISSN  0028-0836.
  8. ^ Пенниси, Элизабет (2003). «Биоинформатика: генные счетчики борются за правильный ответ». Наука. 301 (5636): 1040–1041. Дои:10.1126 / science.301.5636.1040. ISSN  0036-8075.
  9. ^ Семпл, Колин (2000). «Генное предсказание: конец начала». Геномная биология. 1 (2). Дои:10.1186 / gb-2000-1-2-reports4012.
  10. ^ Харрис, Ричард Ф. (2000). «Генофонд». Текущая биология. 10 (14): R506. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00590-X. ISSN  0960-9822.
  11. ^ Анон (2000). «Природа числа». Природа Генетика. 25 (2): 127–128. Дои:10.1038/75946. ISSN  1061-4036.
  12. ^ Смаглик, Пол (2000). «Исследователи делают ставку на геном человека». Природа. 405 (6784): 264–264. Дои:10.1038/35012771. ISSN  0028-0836.
  13. ^ Анон (2000). «Азартные игры на геноме». Журнал Национального института рака. 92 (17): 1373. Дои:10.1093 / jnci / 92.17.1373. PMID  10974068.
  14. ^ Уэйд, Николас (2000). "Ученые делают ставку на человеческие гены; победитель будет выбран в 2003 году". nytimes.com. Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 2019-10-21.
  15. ^ Пирсон, Хелен (2003). "Ставка на число гена человека выиграна". Природа. Дои:10.1038 / news030602-3. ISSN  0028-0836.
  16. ^ Пенниси, Элизабет (2003). "Маленькие числа выигрывают пул GeneSweep". sciencemag.org. Наука. Получено 2019-10-21.
  17. ^ Уэйд, Николас (2003). «Тотализатор гена заканчивается, но победитель вполне может оказаться неправ». nytimes.com. Нью-Йорк Таймс. ISSN  0362-4331. Получено 2019-10-21.
  18. ^ Виллиард, Кассандра (2018). «Новые человеческие гены возрождают споры». Природа. 558 (7710): 354–355. Дои:10.1038 / d41586-018-05462-w. ISSN  0028-0836. PMID  29921859.
  19. ^ Пертя, Михаэла; Зальцберг, Стивен Л. (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества генов человека». Геномная биология. 11 (5): 206. Дои:10.1186 / gb-2010-11-5-206. ISSN  1465-6906. ЧВК  2898077. PMID  20441615.