Джин Вики - Gene Wiki - Wikipedia

В Джин Вики это проект в Википедии, целью которого является описание отношений и функций всех человеческих гены. Он был создан для передачи информации с научных ресурсов на Википедия статьи-заготовки.[1][2][3]

Проект Gene Wiki также инициировал публикацию в журнале обзорных статей по генам. Генвместе с редактированием специфичных для генов страниц в Википедии.[4]

Цели и объем проекта

Количество статей гена

В человеческий геном содержит примерно 20 000–25 000 гены, кодирующие белок.[5] Цель проекта Gene Wiki - создать исходные статьи для каждого примечательный человеческий ген, то есть каждый ген, функция которого описана в рецензируемой научной литературе. Приблизительно половина человеческих генов имеет назначенную функцию, поэтому общее количество статей, засеянных проектом Gene Wiki, должно находиться в диапазоне 10 000–15 000. На сегодняшний день создано или дополнено около 11 000 статей, в которые включены материалы проекта Gene Wiki.[6]

Расширение

Как только исходные статьи будут созданы, есть надежда и ожидание, что они будут аннотированный и расширен за счет редакторов с различным опытом, от непрофессиональной аудитории до студентов, профессионалов и ученых.[1]

Белки, кодируемые генами

Большинство генов кодируют белки следовательно, понимание функции гена обычно требует понимания функции соответствующего белка. Таким образом, помимо базовой информации о гене, проект также включает информацию о кодируемом геном белке.

Генерируемый контент вики

Заготовки для проекта Gene Wiki создаются бот и содержат ссылки на следующие основные базы данных генов / белков:

Ответ

Согласно отчету, в период с 2013 по 2017 год контент, который Gene Wiki размещал в Википедии, со временем получил краудсорсинговую разработку.[8]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Хус Дж. В., Ороско С., Гудейл Дж., Ву С., Баталов С., Викерс Т. Дж., Валафар Ф., Су А. И. (июль 2008 г.). «Вики-сайт по генам для аннотации функций генов». PLoS Biol. 6 (7): e175. Дои:10.1371 / journal.pbio.0060175. ЧВК  2443188. PMID  18613750.
  2. ^ Хус Дж. В., Ороско К., Гудейл Дж., Ву С., Баталов С., Викерс Т. Дж., Валафар Ф., Су А. И.. "SciVee Pubcast: Gene Wiki для сообщества, аннотации функции генов". Архивировано из оригинал on 2010-07-24. Получено 2008-11-19.
  3. ^ Huss JW; Lindenbaum P; Martone M; и другие. (Январь 2010 г.). "The Gene Wiki: интеллект сообщества в применении к аннотации генов человека". Нуклеиновые кислоты Res. 38 (Выпуск базы данных): D633–9. Дои:10.1093 / нар / gkp760. ЧВК  2808918. PMID  19755503.
  4. ^ Цуэнг Г., Гуд Б.М., Пинг П., Големис Э., Ханукоглу И., ван Вейнен А.Дж., Су А.И. (2 мая 2016 г.). «Обзоры Gene Wiki - Повышение качества и доступности информации о геноме человека». Ген. 592 (2): 235–8. Дои:10.1016 / j.gene.2016.04.053. ЧВК  5944608. PMID  27150585.
  5. ^ Зажим М, Фрай Б., Камал М., Се Х, Манжета Дж, Лин М.Ф., Келлис М., Линдблад-Тох К., Ландер Э.С. (декабрь 2007 г.). «Различение кодирующих и некодирующих белков генов в геноме человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (49): 19428–33. Дои:10.1073 / pnas.0709013104. ЧВК  2148306. PMID  18040051.
  6. ^ "Gene Wiki Pages". Страницы, ссылающиеся на {{PBB }}. Википедия, свободная энциклопедия. Получено 2015-01-27.CS1 maint: лишняя пунктуация (связь)
  7. ^ Су А.И., Уилтшир Т., Баталов С., Лапп Х., Чинг К.А., Блок D, Чжан Дж., Соден Р., Хаякава М., Крейман Г., Кук М.П., ​​Уокер Дж. Р., Хогенеш Дж. Б. (апрель 2004 г.). «Атлас генов транскриптомов, кодирующих белки человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (16): 6062–7. Bibcode:2004ПНАС..101.6062С. Дои:10.1073 / pnas.0400782101. ЧВК  395923. PMID  15075390.
  8. ^ Зиновьев, Андрей; Червинска, Уршула; Кантини, Лаура; Барильо, Эммануэль; Frahm, Klaus M .; Шепелянский, Дима Л .; Ржецкий, Андрей (18 февраля 2020 г.). «Коллективный разум определяет биологические функции в Википедии как сообщества в сети скрытых белковых соединений». PLOS вычислительная биология. 16 (2): e1007652. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1007652.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка