Захват генов - Gene trapping - Wikipedia

Захват генов это высокая пропускная способность подход, который используется для введения инсерционного мутации по геному организма.

Метод

Захват осуществляется с помощью векторов-ловушек для генов, основным элементом которых является кассета для улавливания генов, состоящая из репортерного гена без промотора и / или выбираемого генетический маркер, фланкированный восходящим 3 'сайтом сплайсинга (акцептор сплайсинга; SA) и нижележащим транскрипционный последовательность завершения (полиаденилирование последовательность; полиА).

При вставке в интрон экспрессируемого гена кассета-ловушка для гена транскрибируется с эндогенного промотора этого гена в форме слитого транскрипта, в котором экзон (ы), расположенный выше сайта вставки, сплайсирован в рамке с геном-репортером / селективным маркером. Поскольку транскрипция преждевременно обрывается на вставленном сайте полиаденилирования, обработанный гибридный транскрипт кодирует усеченную и нефункциональную версию клеточного белок и репортер / выбираемый маркер. Таким образом, генные ловушки одновременно инактивируют и сообщают об экспрессии захваченного гена в сайте встраивания и обеспечивают ДНК tag (тег последовательности генной ловушки, GTST) для быстрой идентификации нарушенного ген.^[1][2]

Доступ

Международный консорциум генных ловушек централизует данные и поставляет модифицированные клеточные линии.^[3]

Рекомендации

1. Cobellis, G; Николаус, G; и другие. (2005). «Маркировка генов с помощью сайтов обмена кассет». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (4): e44. Дои:10.1093 / nar / gni045. ЧВК  552971. PMID  15741177.
2. Де-Золт, С; Schnutgen, F; и другие. (2006). «Высокая пропускная способность улавливания генов секреторного пути в эмбриональных стволовых клетках мыши». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (3): 25.
3. "IGTC, Международный консорциум генных ловушек". www.genetrap.org. Получено 2018-02-11.

дальнейшее чтение

• Госслер А., Джойнер А.Л., Россант Дж., Скарнес В.К. (апрель 1989 г.). «Эмбриональные стволовые клетки мыши и репортерные конструкции для обнаружения генов, регулируемых развитием». Наука. 244 (4903): 463–5. Дои:10.1126 / science.2497519. PMID  2497519.
• фон Мельхнер Х., Рулей Х.Э. (август 1989 г.). «Идентификация клеточных промоторов с помощью ловушки промотора ретровируса». Журнал вирусологии. 63 (8): 3227–33. ЧВК  250892. PMID  2545900.
• Фридрих Г., Сориано П. (сентябрь 1991 г.). «Промоторные ловушки в эмбриональных стволовых клетках: генетический скрининг для выявления и мутации генов развития у мышей». Гены и развитие. 5 (9): 1513–23. Дои:10.1101 / gad.5.9.1513. PMID  1653172.
• Замбрович Б.П., Фридрих Г.А., Бакстон Э.С., Лиллеберг С.Л., человек С., Сэндс А.Т. (апрель 1998 г.). «Нарушение и идентификация последовательности 2000 генов в эмбриональных стволовых клетках мыши». Природа. 392 (6676): 608–11. Дои:10.1038/33423. PMID  9560157.
• Wiles MV, Vauti F, Otte J, Füchtbauer EM, Ruiz P, Füchtbauer A, Arnold HH, Lehrach H, Metz T, von Melchner H, Wurst W (январь 2000 г.). «Создание библиотеки тегов последовательности генной ловушки для создания мутантных мышей из эмбриональных стволовых клеток». Природа Генетика. 24 (1): 13–4. Дои:10.1038/71622. PMID  10615117.
• Стэнфорд В.Л., Кон Дж. Б., Кордес С. П. (октябрь 2001 г.). «Мутагенез генных ловушек: прошлое, настоящее и будущее». Обзоры природы. Генетика. 2 (10): 756–68. Дои:10.1038/35093548. PMID  11584292.
• Скарнес В.К., фон Мельхнер Х., Вурст В., Хикс Г., Норд А.С., Кокс Т., Янг С.Г., Руис П., Сориано П., Тессье-Лавин М., Конклин Б.Р., Стэнфорд В.Л., Россант Дж. (Июнь 2004 г.). «Общедоступный ресурс по генной ловушке для функциональной геномики мышей». Природа Генетика. 36 (6): 543–4. Дои:10.1038 / ng0604-543. ЧВК  2716026. PMID  15167922.
• Хансен Дж., Флосс Т., Ван Слоун П., Фюхтбауэр Е.М., Ваути Ф., Арнольд Х. Х., Шнютген Ф., Вурст В., фон Мельхнер Х., Руис П. (август 2003 г.). «Крупномасштабный подход к генному мутагенезу для функционального анализа генома мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (17): 9918–22. Дои:10.1073 / pnas.1633296100. ЧВК  187885. PMID  12904583.
• Замбрович Б.П., Абуин А., Рамирес-Солис Р., Рихтер Л.Дж., Пигготт Дж., БелтранделРио Х. и др. (Ноябрь 2003 г.). «Дефицит киназы Wnk1 снижает кровяное давление у мышей: скрининг генных ловушек для выявления потенциальных целей для терапевтического вмешательства». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (24): 14109–14. Дои:10.1073 / pnas.2336103100. ЧВК  283554. PMID  14610273.
• Schnütgen F, De-Zolt S, Van Sloun P, Hollatz M, Floss T., Hansen J, Altschmied J, Seisenberger C, Ghyselinck NB, Ruiz P, Chambon P, Wurst W., von Melchner H (май 2005 г.). «Полногеномное производство многоцелевых аллелей для функционального анализа генома мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (20): 7221–6. Дои:10.1073 / pnas.0502273102. ЧВК  1129123. PMID  15870191.
• Springer PS (июль 2000 г.). «Генные ловушки: инструменты для развития растений и геномики». Растительная клетка. 12 (7): 1007–20. Дои:10.2307/3871251. JSTOR  3871251. ЧВК  149045. PMID  10899970.