Genome @ home - Genome@home
Genome @ home был распределенных вычислений проект в ведении Стефан Ларсон из Стэндфордский Университет, и родственный проект Складной @ дома. Его целью была белковый дизайн и его приложений, которые имели значение во многих областях, включая лекарство. Genome @ home управляла Панде Лаборатория в Стэндфордский Университет, некоммерческое учреждение, занимающееся научными исследованиями и образованием.[1]
Функция
После Проект "Геном человека", ученым необходимо было знать биологические и медицинские последствия полученного богатства генетической информации. Genome @ home использовала дополнительную вычислительную мощность персональные компьютеры виртуально проектировать гены которые соответствуют существующим белки, хотя он также может создавать новые белки, которые не были обнаружены в природе.[2] Этот процесс требует больших вычислительных ресурсов, поэтому распределенные вычисления являются жизнеспособным вариантом. Исследователи могут использовать результаты проекта, чтобы лучше понять эволюция естественного геномы и белки, и их функции. Этот проект нашел применение в лечебная терапия, новый фармацевтические препараты и присвоение функций вновь секвенированным генам.[2]
Genome @ home непосредственно изучала геномы и белки, виртуально создавая новые последовательности для существующих трехмерных белковых структур, которые другие ученые получили с помощью Рентгеновская кристаллография или ЯМР техники. Понимая взаимосвязь между последовательностями и конкретными белковыми структурами, лаборатория Панде решила современные проблемы в структурная биология, генетика, и лекарство.[1]
В частности, проект Genome @ home помог понять, почему тысячи разных аминокислота все последовательности образуют одни и те же структуры и помогают полям протеомика и Структурная геномика путем прогнозирования функций вновь открытых генов и белков. Это также имело значение в лечебная терапия путем разработки и виртуального создания новых версий существующих белков.[1] Программное обеспечение Genome @ home было разработано для однопроцессор системы. Он начинается с большого набора потенциальных последовательностей и многократно просматривает и уточняет эти последовательности, пока не будет найдена хорошо продуманная последовательность. Затем он отправляет эту последовательность на сервер и повторяет процесс.[1]
Заключение
По финансовым причинам проект был официально завершен 8 марта 2004 г., хотя данные собирались до 15 апреля. После его завершения пользователей попросили вместо этого сделать пожертвование в Folding @ home.[1][3]
Результаты
В нем собрана большая база данных последовательностей белков, которая в течение многих лет будет использоваться в важных научных целях лабораторией Панде и другими учеными по всему миру.[1][3]
Четыре рецензируемый научные публикации являются результатом Genome @ home.[4]
Смотрите также
внешние ссылки
использованная литература
- ^ а б c d е ж Pande lab. "Genome @ home FAQ". Стэндфордский Университет. Архивировано из оригинал (ВОПРОСЫ-ОТВЕТЫ) на 2011-07-27. Получено 2011-09-05.
- ^ а б Pande lab. "Что такое Genome @ home?". Стэндфордский Университет. В архиве из оригинала 2011-12-04. Получено 2011-11-30.
- ^ а б "Обновления Genome @ home". 2004-03-04. В архиве из оригинала от 21.09.2012. Получено 2011-11-30.
- ^ Pande lab. "Genome @ home Научные результаты". Стэндфордский Университет. В архиве из оригинала 2011-12-04. Получено 2011-11-30.