Гаплогруппа M18 - Haplogroup M18

Гаплогруппа M18
Возможное время происхождения17 100 ± 4 700 лн (Мецпалу),[1] 20,800 ± 8,900 лн (Тангарадж) [2]
Возможное место происхожденияИндия / Южная Азия
ПредокM4'30
Определение мутаций12498 и 15942 (кодирующая область) и 194 (контрольная область)

В митохондриальная генетика человека, гаплогруппа M18 это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Это родословная, специфическая для Индии.[1][2][3]

Источник

M18 является потомком макро-Гаплогруппа M (мтДНК) и древнеиндийский вариант M.[1][3] Гаплогруппа M18 имеет общую мутацию кодирующей области (12007) вместе с M4, M30, Гаплогруппы M37 и M38 из корня гаплогруппа M (супергаплогруппа M4'30).[2][3][4] Суперклада M4'30 является единственной кладой, которая разделяет промежуточную линию между 2 гаплогруппами, в то время как остальные все линии M произошли независимо от корня макрогаплогруппы M; таким образом поддерживая идею быстрого рассеивания современные люди вдоль Азиатский побережье после того, как они ушли Африка с последующим длительным периодом изоляции.[3]

В ожидании дополнительной информации из полных последовательностей мтДНК, гаплогруппа M18 была впервые определена Metspalu et al. В 2004 году с использованием трансверсии по np 16318.[1] Позже это было исправлено Тангараджем и др. В 2006 году.[2] В настоящее время гаплогруппа характеризуется двумя мутациями кодирующей области, 12498 и 15942, и дополнительной мутацией контрольной области 194.[2]

Распределение

В исследовании 2004 года Metspalu et al. Проанализировали вариацию мтДНК в образцах 796 индейцев, 436 иранцев и сравнили их между образцами из Европы, Китая и Таиланда. Исследование показало распространенность M18 на низких частотах в широком географическом районе, включающем юго-восточные части Саудовская Аравия, широко по Иран, Пакистан, Индия, Непал, Бангладеш и Мьянма.[1]

Исследование Мецпалу показало, что пространственное распределение M18 достигло пика в части Пенджаб Пакистан, Пенджаб, Индия, Раджастхан и через большую часть Андхра-Прадеш (См. Панель M18 на [1] ).

Высокая частота (33%) узлового гаплотипа M18 среди Австроазиатский -Говорящий Лодха из Западной Бенгалии предположил возможный эффект основателя в этой популяции.[1] Это также объяснило почти двукратную разницу между оценками слияния для этого кластера, рассчитанными с учетом и без данных о племенах в исследовании Мецпалу.[1]

Поскольку интенсивный генетический дрейф (особенно эффекты основателя) может внести систематическую ошибку в расчет времени слияния, Метспалу и др. Вычислили время слияния гаплогруппы M18 с образцом Lodha и без него и обнаружили, что оно составляет 9400 ± 3200 лн и 17,100 ± 4,700 лн соответственно.[1] Thangaraj et al., Оценили слияние гаплогруппы M18 в 20,800 ± 8900 лн (Thangaraj и другие., 2006).[2]

Подводя итог, можно сказать, что люди гаплогруппы M18 были обнаружены в

  • Саудовская Аравия
  • Иран
  • Афганистан
  • Пакистан
  • Индия
  • Непал
  • Бутан
  • Китай
  • Бангладеш
  • Мьянма

Распространение в Индии

Относительно высокая частота гаплогруппы M18 наблюдалась в Пардхан Андхра-Прадеш, в то время как он полностью отсутствовал в Найкпод Гонд и Andh (Thanseem и другие., 2006).[2] M18 был найден в Брамины из Уттар-Прадеш (Солнце и другие., 2006), Десастх Брамин из Махараштра (Gaikwad and Kashyap, 2005), Хандаяц Ориссы (Саху и Кашьяп, 2006) и Ораон из Бихара (Тангарадж и другие., 2006).[2]

Чандрасекар А. и Рагхавендра Рао и др. Подтвердили монофилетическое происхождение гаплогруппы M18 и обнаружили, что она часто встречается у Люди мал пахарии (при 29% размера выборки).[5]

Исследование, проведенное Мецпалу и др., Обнаружило гаплогруппу M18 в Андхра-Прадеш и юго-восточной части Тамил Наду, но полностью отсутствует в соседних Карнатаке и Керале. Возможное объяснение - облегчение примеси вдоль берегов Аравийского моря и Бенгальского залива.[1] Однако, поскольку абсолютная частота этой гаплогруппы довольно низкая, нельзя исключать, что увеличение размера выборки нарушит наблюдаемую картину распространения.[1]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я j Мецпалу, Майт; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Эне; Парик, Юри; Худжашов, Георгий; Калдма, Катрин; Серк, Пия; Кармин, Моника; Бехар, Дорон М; Гилберт, М. Томас П.; Эндикотт, Филипп; Мастана, Сарабджит; Папиха, Суриндер С; Скорецкий, Карл; Торрони, Антонио; Виллемс, Ричард (2004). «Большинство существующих границ мтДНК в Южной и Юго-Западной Азии, вероятно, были сформированы во время первоначального заселения Евразии анатомически современными людьми». BMC Genetics. 5: 26. Дои:10.1186/1471-2156-5-26. ЧВК  516768. PMID  15339343.
  2. ^ а б c d е ж грамм час Maji, S; Krithika, S; Васулу, Т.С. (апрель 2009 г.). «Филогеографическое распространение макрогаплогруппы M митохондриальной ДНК в Индии» (PDF). Журнал генетики. 88 (1): 127–39. Дои:10.1007 / s12041-009-0020-3. PMID  19417557. S2CID  28080968.
  3. ^ а б c d Тангарадж, Кумарасами; Чаубей, Гианешвер; Сингх, Виджай; Ванниараджан, Айясами; Тансим, Исмаил; Редди, Алла Г; Сингх, Лалджи (2006). «Происхождение in situ глубоко укоренившихся линий митохондриальной макрогаплогруппы« M »в Индии». BMC Genomics. 7: 151. Дои:10.1186/1471-2164-7-151. ЧВК  1534032. PMID  16776823.
  4. ^ Сунь, Чанг; Конг, Цин-Пэн; Паланичамы, землекоп Маллия; Агравал, Суракша; Бандельт, Ханс-Юрген; Яо, Юн-Ган; Хан, Фейсал; Чжу, Чун-Линг; и другие. (2005). «Великолепный массив базальных ветвей в макрогаплогруппе M мтДНК из Индии, как следует из полных геномов». Молекулярная биология и эволюция. 23 (3): 683–90. Дои:10.1093 / molbev / msj078. PMID  16361303.
  5. ^ А, Чандрасекар; др., др .; Шринатх, Джвалапурам; Саркар, Бишва Натх; Ураде, Бхаскар Пралхад; Маллик, Суджит; Бандопадхьяй, Шьям Сундар; Баруа, Пинума; Барик, Субихра Санкар; Басу, Дебасиш; Киран, Уттаравалли; Гангопадхьяй, Продёт; Сахани, Рамеш; Прасад, Бхагаватула Венката Рави; Гангопадхьяй, Шампа; Лакшми, Гандикота Рама; Равури, Раджасекхара Редди; Падмаджа, Конеру; Venugopal, Pulamaghatta N .; Шарма, Мадху Бала; Рао, Вадламуди Рагхавендра (2009). «Обновление филогении макрогаплогруппы M митохондриальной ДНК в Индии: расселение современного человека в южноазиатском коридоре». PLOS ONE. 4 (10): e7447. Bibcode:2009PLoSO ... 4.7447C. Дои:10.1371 / journal.pone.0007447. ЧВК  2757894. PMID  19823670.