Институт молекулярной биотехнологии - Institute of Molecular Biotechnology

Институт молекулярной биотехнологии (ИМБА)
Основан1999
Штаб-квартираДоктор Бор-Гасс 3
1030 Вена
Австрия
РодительАвстрийская Академия Наук  Отредактируйте это в Викиданных
Интернет сайтwww.imba.oeaw.ac

В Институт молекулярной биотехнологии (ИМБА) независимая биомедицинская исследовательская организация, основанная Австрийская Академия Наук в сотрудничестве с фармацевтической компанией Boehringer Ingelheim. В институте работают около 220 человек из более чем 40 стран, которые проводят фундаментальные исследования. IMBA работает в тесном сотрудничестве с НИИ молекулярной патологии (IMP), центр фундаментальных исследований Boehringer Ingelheim. Оба института расположены рядом друг с другом на Венский биоцентр (VBC).[1]

Исследование

Исследование IMBA направлено на понимание фундаментальных молекулярно-биологический процессы, лежащие в основе трехмерной архитектуры геномов, функции малых РНК и восстановление целых органов и эмбрионов in vitro.[2]

В составе института 15 лабораторий, возглавляемых (в алфавитном порядке):

  • Стефан Амерес: Механизм и биология молчания РНК. Разработчик технологии SLAMseq.[3]
  • Юлиус Бреннеке: Подавление транспозонов и образование гетерохроматина малыми РНК.
  • Алехандро Бурга: Молекулярные детерминанты биологической идиосинкразии.
  • Ульрих Эллинг: Функциональная геномика в эмбриональных стволовых клетках. Разработчик Хаплобанк.
  • Даниэль Герлих: Сборка и функции аппарата деления клеток.
  • Антон Голобородько: Теоретические модели строения хромосом.
  • София Град: Механизмы пластичности после черепно-мозговой травмы.
  • Юрген Кноблих: Развитие мозга и болезни. Разработчик церебрального органоида.
  • Бон-Кён Ку: Гомеостатическая регуляция взрослых стволовых клеток.
  • Саша Менджан: Молекулярный контроль органогенеза человека. Разработчик сердечного органоида человека.[4]
  • Йозеф Пеннингер: Моделирование болезней человека.
  • Николя Риврон: Синтетическое развитие. Разработчик бластоидный модель.[5][6][7]
  • Шамбадитья Саха: разделение макромолекулярных фаз в судьбе зародышевых клеток.
  • Кикуэ Тачибана: перепрограммирование хроматина в тотипотентных стволовых клетках.
  • Ноэлия Урбан: Системная регуляция взрослого нейрогенеза.

Сопутствующие проекты: Венский центр РНКи дрозофил (VDRC) расположен в IMBA и доступен исследователям по всему миру.[8] Он собирает библиотеку RNAi из более чем 22000 Дрозофила штаммы.

Основные научные открытия

2020. Определение детерминанты размера мозга с использованием новой технологии скрининга CRISPR в церебральных органоидах[9]

2020. Открытие конформации сестринских хроматид в реплицированном геноме человека[10]

2019. Получение органоидов кровеносных сосудов из плюрипотентных стволовых клеток человека.[11]

2017. Разработка SLAM-Seq для оценки динамики экспрессии РНК[12]

2017. Разработка ресурса биобанка обратимых гаплоидных плюрипотентных стволовых клеток мыши для функциональной геномики.[13]

2013. Получение церебральных органоидов из плюрипотентных стволовых клеток человека для моделирования развития человеческого мозга[14]

2008. Открытие эндогенного пути малых интерферирующих РНК у дрозофилы.[15]

2005. Открытие роли ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) в поражении легких, вызванном коронавирусом SARS.[16]

История

Институт был основан в 1999 году по совместной инициативе Австрийская Академия Наук и Boehringer Ingelheim и при участии правительства Австрии и города Вены.[17] Строительство института началось в 2003 году и завершилось в 2006 году. Здание примыкает к одному из НИИ молекулярной патологии по мосту, чтобы улучшить сотрудничество. Оба института имеют общую столовую и научные помещения. В 2002 году генетик Йозеф Пеннингер начал как научный руководитель и набрал Барри Диксон как первый руководитель группы. В 2007 г. Венский центр РНКи дрозофил (VDRC) открыт в сотрудничестве с НИИ молекулярной патологии. В 2018 году Йозеф Пеннингер был назначен директором Института наук о жизни Ванкуверского университета.[18] а Юрген Кноблих занял должность временного директора IMBA. В 2020 году институт расширился в дополнительном здании (названном VBC6).

Научно-консультативный совет

Чтобы поддерживать высочайший стандарт исследований, IMBA установила процесс обзора и обратной связи, возглавляемый внешним Научно-консультативным советом (SAB), состоящим из всемирно признанных ученых. Совет собирается ежегодно и вместе с исследователями обсуждает качество, значимость и основные направления проводимых исследований. В настоящее время SAB возглавляет Элейн Фукс (Университет Рокфеллера) и включает Грегори Хэннона (Кембриджский университет, лаборатория Колд-Спринг-Харбор), Гвидо Кремера (Парижский университет Декарта), Марии Лептин (директор EMBO), Гэри Рувкуна (Гарвардский университет). ), Фиона Ватт (Королевский колледж) и лауреат Нобелевской премии Эрик Кандел.[19]

Основные научные объекты

Основные ресурсы управляются техническими лидерами, которые оценивают и внедряют широкий спектр новых технологий, инструментов и методов. Эти профессиональные штатные ученые также обучают пользователей, помогают в разработке экспериментов и распространяют экспертные знания. Они адаптируют свой опыт к отдельным вопросам исследования и доступны на любой стадии расследования. Ученым IMBA не выставляются счета за основные услуги, за исключением некоторых расходных материалов, связанных с экспериментами, поэтому эксперименты можно начать практически сразу. Доступ к этим объектам мирового класса позволяет ученым IMBA быстро генерировать, интерпретировать и представлять убедительные высококачественные данные. Это ускоряет темпы их исследований и дает им конкурентное преимущество.

Помимо основных научных объектов института, исследователи также имеют доступ к основным объектам НИОКР. Венский биоцентр (VBCF ).

Семинар и конференции

IMBA представляет собой синергетический форум для академического обмена: серия семинаров, бесед и гостевых лекций для всех преподавателей предлагается в IMBA и Венском биоцентре. Различные мероприятия, начиная от регулярных серий семинаров и заканчивая конкретными симпозиумами, импровизированными семинарами и приглашенными лекциями, приносят свежие перспективы, освещают текущие проблемы и привлекают всемирно известных экспертов, а также перспективных исследователей на ранних этапах.

IMBA и IMP совместно организуют ежегодный симпозиум SY-Stem, посвященный следующему поколению исследователей стволовых клеток.

Программа PhD

В Программа PhD Венского биоцентра это международная программа подготовки докторов наук, осуществляемая совместно четырьмя исследовательскими институтами Венского биоцентра (IMP, IMBA, GMI и MFPL). Прием в программу является конкурсным и основан на официальной процедуре отбора. Каждый год проводится два отбора, крайние сроки - 30 апреля и 15 ноября. Участие в программе является условием для получения докторской степени в IMBA.

Награды

IMBA получил признание в виде 17 грантов ERC и наград своим исследователям.

Йозеф Пеннингер, научный руководитель, был избран действительным членом Австрийской академии наук (ÖAW).[20] Он был награжден Премия Эрнста Юнга для медицины от Jung-Stiftung for Science and Research, Премия Декарта для исследований Европейская комиссия и получил медаль Каруса Немецкая академия наук Леопольдина. В 2012 году Йозеф Пеннингер был награжден премией Innovator за свой проект «Новые подходы к профилактике рака груди и подавлению метастазов» за Министерство обороны США.[21] В 2013 году Йозеф Пеннингер получил второй Европейский исследовательский совет (ERC) Advanced Investigator Grant за его исследования в области гаплоидный стволовые клетки.[22]

Юрген Кноблих, заместитель научного директора IMBA, был удостоен награды Премия Витгенштейна, награжденный австрийским Министерство науки.[23]

Научное общение

В сотрудничестве с акционерным обществом Dialog Gentechnik в 2006 году IMBA открыла Венская открытая лаборатория, практическая биомолекулярная лаборатория, открытая для публики.[24]

Выпускников

  • Фумиё Икеда . Линейное убиквитинирование при воспалении, гибели клеток и аутофагии. В настоящее время профессор Университета Кюсю, Япония.
  • Оливер Белл . Эпигенетическая память о решениях клеточной судьбы. В настоящее время профессор Университета Южной Калифорнии, США.
  • Барри Диксон . Обработка информации в определенных нейронных цепях и сложное поведение у дрозофилы. В настоящее время руководитель группы в исследовательском кампусе Джанелия, США.
  • Томас Марловиц . Устройство и принцип действия молекулярных машин. В настоящее время профессор Гамбургского университета и руководитель группы Центра структурной системной биологии, Германия.
  • Хавьер Мартинес . Метаболизм РНК в клетках млекопитающих. В настоящее время руководитель группы в Max Perutz Labs, Австрия.
  • Кадзуфуми Мотидзуки . Удаление малой РНК-направленной ДНК у Tetrahymena. В настоящее время руководитель группы в Institut de genetique humaine, Франция.
  • Леони Рингроуз . Количественная эпигенетика. В настоящее время руководитель группы Берлинского университета имени Гумбольдта, Германия.
  • Вик Смолл (Emeritus Group). Мобильность клеток. Сейчас на пенсии.

Рекомендации

  1. ^ «Институт молекулярной биотехнологии (ИМБА)». Венский биоцентр. Получено 2019-07-17.
  2. ^ «О ИМБА». IMBA - Институт молекулярной биотехнологии. Получено 2019-07-17.
  3. ^ Лексоген. «Lexogen запускает набор SLAMseq для метаболического секвенирования РНК». Лексоген. Получено 2019-11-19.
  4. ^ Хофбауэр, Пабло; Янель, Стефан; Папай, Нора; Гиссхаммер, Магдалена; Penc, Mirjam; Тавернини, Катерина; Грдселофф, Настасья; Меледет, Кристи; Дейетт, Элисон; Шмидт, Клара; Ctortecka, Claudia (06.07.2020). «Кардиоиды раскрывают принципы самоорганизации кардиогенеза человека». bioRxiv: 2020.07.06.189431. Дои:10.1101/2020.07.06.189431.
  5. ^ Rivron, Nicolas C .; Фриас-Альдегер, Хавьер; Vrij, Erik J .; Буассе, Жан-Шарль; Корвинг, Йерун; Вивье, Юдифь; Truckenmüller, Roman K .; ван Ауденаарден, Александр; van Blitterswijk, Clemens A .; Гейсен, Нильс (май 2018 г.). «Бластоцистоподобные структуры, созданные исключительно из стволовых клеток». Природа. 557 (7703): 106–111. Дои:10.1038 / s41586-018-0051-0. ISSN  1476-4687.
  6. ^ Фриас-Альдегер, Хавьер; Кип, Маартен; Вивье, Юдифь; Ли, Линьфэн; Алемани, Анна; Корвинг, Йерун; Дармис, Фрэнк; Ауденаарден, Александр ван; Гейсен, Нильс; Риврон, Николас К. (13 января 2020 г.). «Эмбриональные сигналы закрепляют полярно-подобные стволовые клетки трофобласта и формируют ось бластоцисты». bioRxiv: 510362. Дои:10.1101/510362.
  7. ^ Vrij, Erik J .; Реймер, Ивонн С. Шольте op; Альдегер, Хавьер Фриас; Геррейро, Изабель Мистели; Добрый, Джоп; Ку, Бон-Кён; Блиттерсвейк, Клеменс А. ван; Риврон, Николас К. (12 апреля 2019 г.). «Химически определенная индукция примитивной энтодермы и эпибластоподобной ниши поддерживает постимплантационное развитие бластоидов». bioRxiv: 510396. Дои:10.1101/510396.
  8. ^ "Fly House". IMBA - Институт молекулярной биотехнологии. Получено 2018-02-17.
  9. ^ Эск, Кристофер; Линденхофер, Доминик; Хенделер, Саймон; Wester, Roelof A .; Пфлуг, Флориан; Шредер, Бенуа; Бэгли, Джошуа А .; Эллинг, Ульрих; Зубер, Йоханнес; Хезелер, Арндт фон; Кноблих, Юрген А. (2020-11-20). «Скрининг тканей человека определяет регулятор секреции ER как детерминант размера мозга». Наука. 370 (6519): 935–941. Дои:10.1126 / science.abb5390. ISSN  0036-8075. PMID  33122427.
  10. ^ Миттер, Майкл; Гассер, Катерина; Такач, Жужанна; Langer, Christoph C.H .; Тан, Вэнь; Джессбергер, Грегор; Билс, Чарли Т .; Нойнер, Ева; Ameres, Stefan L .; Петерс, Ян-Майкл; Голобородько, Антон (2020-10-01). «Конформация сестринских хроматид в реплицированном геноме человека». Природа. 586 (7827): 139–144. Дои:10.1038 / с41586-020-2744-4. ISSN  0028-0836.
  11. ^ Wimmer, Reiner A .; Леопольди, Александра; Айхингер, Мартин; Вик, Николаус; Хантуш, Бриджит; Новачкова Мария; Таубеншмид, Жасмин; Hämmerle, Monika; Эск, Кристофер; Бэгли, Джошуа А .; Линденхофер, Доминик (январь 2019 г.). «Органоиды кровеносных сосудов человека как модель диабетической васкулопатии». Природа. 565 (7740): 505–510. Дои:10.1038 / s41586-018-0858-8. ISSN  0028-0836.
  12. ^ Herzog, Veronika A .; Райххольф, Брайан; Нойман, Тобиас; Решенедер, Филипп; Бхат, Пуджа; Burkard, Thomas R .; Влоцка, Вибке; фон Хезелер, Арндт; Зубер, Йоханнес; Амерес, Стефан Л. (декабрь 2017 г.). «Тиол-связанное алкилирование РНК для оценки динамики экспрессии». Природные методы. 14 (12): 1198–1204. Дои:10.1038 / nmeth.4435. ISSN  1548-7105. ЧВК  5712218. PMID  28945705.
  13. ^ Эллинг, Ульрих; Wimmer, Reiner A .; Лейббрандт, Андреас; Буркард, Томас; Михлиц, Георг; Леопольди, Александра; Мишелер, Томас; Абдин, Дана; Жук, Сергей; Aspalter, Irene M .; Хандл, Корнелия (октябрь 2017 г.). "Ресурс биобанка обратимых гаплоидных эмбриональных стволовых клеток мыши для функциональной геномики". Природа. 550 (7674): 114–118. Дои:10.1038 / природа24027. ISSN  1476-4687. ЧВК  6235111. PMID  28953874.
  14. ^ Ланкастер, Мэдлин А.; Реннер, Магдалена; Мартин, Кэрол-Энн; Венцель, Даниэль; Бикнелл, Луиза С .; Hurles, Matthew E .; Хомфрей, Тесса; Пеннингер, Йозеф М .; Джексон, Эндрю П .; Кноблич, Юрген А. (19.09.2013). «Церебральные органоиды моделируют развитие человеческого мозга и микроцефалию». Природа. 501 (7467): 373–379. Дои:10.1038 / природа12517. ISSN  0028-0836. ЧВК  3817409. PMID  23995685.
  15. ^ Чех, Беньямин; Мэлоун, Колин Д .; Чжоу, Руи; Старк, Александр; Шлингехейде, Екатерина; Дус, Моника; Перримон, Норберт; Келлис, Манолис; Wohlschlegel, James A .; Сачиданандам, Рави; Хэннон, Грегори Дж. (Июнь 2008 г.). «Эндогенный путь малой интерферирующей РНК у дрозофилы». Природа. 453 (7196): 798–802. Дои:10.1038 / природа07007. ISSN  1476-4687. ЧВК  2895258. PMID  18463631.
  16. ^ Куба, Кейджи; Имаи, Юмико; Рао, Шуан; Гао, Хун; Го, Фэн; Гуань, Бин; Хуан, И; Ян, Пэн; Чжан, Яньли; Дэн, Вэй; Бао, Линьлинь (август 2005 г.). «Решающая роль ангиотензин-превращающего фермента 2 (ACE2) в поражении легких, вызванном коронавирусом SARS». Природа Медицина. 11 (8): 875–879. Дои:10,1038 / нм 1267. ISSN  1546–170X. ЧВК  7095783. PMID  16007097.
  17. ^ https://www.viennabiocenter.org/research/research-entities/institute-of-molecular-biotechnology-imba/
  18. ^ "Йозеф Пеннингер | Институт наук о жизни". lsi.ubc.ca. Получено 2019-07-26.
  19. ^ https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2000/kandel/facts/
  20. ^ "Сведения о членах Oeaw". www.oeaw.ac.at. Получено 2019-11-21.
  21. ^ «Джозеф Пеннингер из IMBA получает награду за новатор в размере 7,4 миллиона долларов от Министерства обороны США». ostaustria.org. Получено 2019-11-21.
  22. ^ «Продвинутые гранты ERC 2013» (PDF).
  23. ^ "Wittgenstein-Preise 2009, Юрген Кноблих и Герхард Видмер". OTS.at (на немецком). Получено 2019-11-21.
  24. ^ «Открытая наука». Открытая наука (на немецком). Получено 2018-02-17.

внешняя ссылка